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鹿吉尼斯®分子流行病学分析POT套装(大肠菌用)

s_EcoilPOT_top.png

大肠杆菌E. coli)是在自然环境中广泛存在的日和见感染菌。在医疗环境中,食物中毒和
院内感染这种集体感染的原因很多,感染管理很重要。
本配套元件是用于识别大肠菌的菌种、克隆识别及菌种的遗传基因类型配套元件。
在PCR-based ORF Typing(POT)法中,使用多Plex PCR放大大肠菌所持有的多个特定遗传因子区域,并使用阿格洛斯特凝胶电泳法将分离的带图案数
通过值化,遗传性地决定克隆识别和菌种识别。

特长

●通过将解析结果数值化(POT值)E.coil 的菌种识别。
●约4小时以内可以进行分子流行病学分析。
●无需特别装置。
●特别是ESBL产大肠菌,与PFGE相近的识别能力。

配套元件构成(30次)

 个别名称容量数量
试剂A AptaTaq DNA Master(5×Conc.)* 240 μL 一枝
试剂B PCR辅助食品 240 μL 一枝
试剂C 标准混合α 120 μL 一枝
试剂D 标准混合β 120 μL 一枝
试剂E 积极控制 240 μL 一枝
试剂F 6×负载缓冲存储器(BPB・XC) 240 μL 一枝

*AptaTaq DNA Master(5×Conc.)是Roche Diagnostics K.K.的商品。

操作步骤

纯培养分离的菌株
进行DNA提取,制备模板DNA
两种多功能PCR
阿加索凝胶电泳
读取带图案
POT值的计算
各样品POT值的比较分析

分析方法

s_EcoilPOT_rei1.png

电泳模式
M:50bp DNA拉达
P:积极控制
N:消极控制(TE缓冲液)
1-4 :大肠菌的分叉


检测ORF的种类(目标区域)及其PCR放大产品尺寸

 POT No.放大尺寸(bp)目标区域

Reaction
mixture 1
PCR PC 652 E.coil判定区域
POT 1-1 511 Genomic Islet-1
POT 1-2 415 Genomic Islet-2
POT 1-3 363 Genomic Islet-3
POT 1-4 307 Genomic Islet-4
POT 1-5 253 Genomic Islet-5
POT 1-6 222 Genomic Islet-6
POT 2-1 178 blaCTX-M-2
POT 2-2 146 Genomic Island-1
POT 2-3 123 Genomic Island-2
POT 2-4 98 Genomic Island-3
POT 2-5 80 Genomic Island-4
Reaction
mixture 2
PCR PC 652 E.coil判定区域
POT 2-6 527 Genomic Islet-7
POT 2-7 436 Genomic Island-5
POT 2-8 361 blaCTX-M-1
POT 3-1 311 Genomic Island-6
POT 3-2 250 Genomic Island-7
POT 3-3 219 Genomic Islet-8
POT 3-4 179 Genomic Island-8
POT 3-5 154 Genomic Island-9
POT 3-6 122 Genomic Islet-9
POT 3-7 102 Genomic Island-10
POT 3-8 79 blaCTX-M-9

①从两个多应用PCR的电泳结果中读取带图案。
②使用该电泳带的有无结果,用二进制输入POT值解析用Excel表,算出3个类别的POT值。
i)PCR PC为阳性时,大肠菌(Escherichia coli )。
ii)POT2的值为奇数时CTX-M-1 group,128以上时CTX-M-2 group
如果POT3的值是奇数,则持有CTX-M-9 group的各ESBL遗传因子。
ⅲ)通过比较样品间的POT值E. coli 的菌体之间的同性可以客观地推测。
iv)集体感染得到的菌体POT1~3的POT值全部相同。

分析结果


分类
样本编号
1234
POT 1 20 26 49 49
POT 2 1 144 58 101
POT 3 94 4 215 178

产品一览表

产品编号 产品名称 保存温度 规格 包装 价格
08178-96 传感器R DNA提取试剂
Cica geneusR DNA extraction reagent
冷藏 分子生物学用 1pack(120次) ¥22,000
08362-97 系统R分子流行病学分析POT脚注(大肠菌用)
Cica geneusR E.coli POT kit
冷冻 分子生物学用 1pack(30次) ¥42,000

★本套装得到爱知县和中部大学的专利许可,正在制造销售。
★关于其他厂家的商品许可证和专利,请向各厂家确认。
★产品的规格可能会因产品的改良而变更。请事先谅解。

・“法律”、“SDS”、“库存”等详细信息请点击产品编号进行确认。
・购买和使用试剂时

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Cica geneusR AmpC Genotype detection kit
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08158-96 传感器传感器R套管平底板Manefic遗传基因型检测脚轮2
Cica geneusR Carbapenemase Genotype detection kit 2
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冷冻 分子生物学用 1pack(30次) ¥42,000
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Cica geneusR ESBL Genotype Detection KIT2
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冷冻 分子生物学用 1pack(30次) ¥42,000

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分离培养基
产品编号 产品名称 保存温度 包装 价格
72101 技术型A罩衫ESBL生培养地
CHROMagarTM ESBL(prepared)
冷藏 十张 ¥3,100
72120 技术型领域————领域—————领域/ESBL分画培养地
CHROMagarTM Orientation/ESBL Agar
冷藏 十张 ¥2,800

・“法律”、“SDS”、“库存”等详细信息请点击产品编号进行确认。
・购买和使用试剂时

小册子

鹿吉尼亚斯®分子流行病学分析套件(大肠菌用)

使用说明书

鹿吉尼斯®分子流行病学分析POT套装(大肠菌用)

计算表(ZIP文件、Excel)

POT(E.coli)计算表(ZIP文件)

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