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西卡西尼亚®分子疫学解析POT配件(大肠菌用)

s_EcoilPOT_top.png

大肠杆菌E.coli)是自然环境中广泛存在的日见感染菌。在医疗环境中,食物中毒
院内感染这样的集体感染的原因很多,感染管理变得重要。
本配套元件是大肠菌的菌种鉴定、克隆认定以及菌株识别基因型别配套元件。
在PCR-based ORF Typing(POT)法中,使用多路复用PCR,放大大大肠菌所持有的多个特定基因区域,并使用AGLOSGEL电泳法分离出的带型图案。
通过价值化,在遗传学上决定克隆认定和菌股识别。

特点

●通过将分析结果数值化(POT值)E.coil 的菌株识别可能。
●约4小时以内可以进行分子疫学解析。
●不需要特别的装置。
●特别是ESBL生产的大肠菌,具有接近PFGE的识别能力。

配套元件配置(30次)

 单独名称容量数量
试剂A AptaTaq DNA Master(5×Conc.)* 240μL 一瓶
试剂B PCR附录 240μL 一瓶
试剂C 主混合α 120μL 一瓶
试剂D 初级混合β 120μL 一瓶
试剂E 积极控制 240μL 一瓶
试剂F 6×加载缓冲器(BPB·XC) 240μL 一瓶

*AptaTaq DNA Master(5×Conc.)是Roche Diagnostics K.K.的商品。

操作程序

纯培养分离的菌株
进行DNA抽出,调制模板DNA
2种多路复用PCR
阿加洛斯凝胶电泳
读取带图案
计算POT值
各检体POT值的比较分析

分析方法

s_EcoilPOT_rei1.png

电泳模式
男:50 bp DNA拉达
P:积极控制
N:消极控制(TE缓冲液)
1-4:大肠杆菌的分离株


检测ORF的种类(目标区域)及其PCR放大产物尺寸

 POT No.放大尺寸(bp)目标区域

拉丁堡
mixture 1
PCR PC 652 E.coil判定区域
POT 1-1 511 Genomic Islet-1
POT 1-2 415 Genomic Islet-2
POT 1-3 363 Genomic Islet-3
POT 1-4 307 Genomic Islet-4
POT 1-5 253 Genomic Islet-5
POT 1-6 222 Genomic Islet-6
POT 2-1 178 blaCTX-M-2
POT 2-2 146 Genomic Island-1
POT 2-3 123 Genomic Island-2
POT 2-4 98 Genomic Island-3
POT 2-5 八十 Genomic Island-4
拉丁堡
mixture 2
PCR PC 652 E.coil判定区域
POT 2-6 527 Genomic Islet-7
POT 2-7 436 Genomic Island-5
POT 2-8 361 blaCTX-M-1
POT 3-1 311 Genomic Island-6
POT 3-2 二百五十 Genomic Island-7
POT 3-3 219 Genomic Islet-8
POT 3-4 179 Genomic Island-8
POT 3-5 154 Genomic Island-9
POT 3-6 122 Genomic Islet-9
POT 3-7 102 Genomic Island-10
POT 3-8 79 blaCTX-M-9

①从2个多路复用PCR的电泳结果读取带图形。
②使用这个电泳带的有无的结果,在POT值解析用excelset里二进制输入,算出3个类别的POT值。
如果PCR PC是阳性的,则会产生大肠菌Escherichia coli )。
如果POT2的值是奇数,则CTX-M-1 group,128以上的话CTX-M-2 group,
如果POT3的值是奇数,则持有CTX-M-9 group的各ESBL基因。
通过比较验体间的POT值,E.coli 的菌体间的相同性能客观地推测。
从集体感染中得到的菌体POT 1~3的POT值全部相同。

分析结果


分类,分类
样品编号
1234
POT 1 20 26 49 49
POT 2 1 144 58 101
POT 3 94 4 215 178

产品一览

产品编号 产品名称 保存温度 规格 包装 价格
08178-96 ジャジューアージューR DNA抽出试剂
Cica geneusR DNA extraction reagent
冷藏 分子生物学用 1pack(120次分) ¥22,000
08362-97 新鲜拉丝R分子疫学分析POT油(大肠菌用)
Cica geneusR E.coli POT kit
冷冻 分子生物学用 1pack(30次分) ¥42000

★本套装从爱知县和中部大学获得专利许可后进行制造销售。
★关于其他厂家的商品的许可证和专利权,请向各厂家确认。
★产品的规格可能会因为产品的改良而变更。请预先谅解。

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冷冻 分子生物学用 1pack(30次分) ¥38,000
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冷冻 分子生物学用 1pack(30次分) ¥42000

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分离培养地
产品编号 产品名称 保存温度 包装 价格
72101 橄榄油+ESBL生培地
CHROMagarTM ESBL(prepared)
冷藏 十张 ¥3,100
72120 卢浮屠/ESBL分画培养地
CHROMagarTM Orientation/ESBL Agar
冷藏 十张 ¥2800

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小册子,小册子

西卡西尼亚®分子疫学解析配套元件(大肠菌用)(1,695KB)

使用说明书

西卡西尼亚®分子疫学解析POT配件(大肠菌用)(926KB)

计算表(ZIP文件、Excel)

POT(E.coli)计算表(ZIP文件)

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