鹿西尼亚斯®分子流行病学分析POT试剂盒(大肠杆菌用)


大肠杆菌E.coli)是在自然环境中广泛存在的日和见感染菌。在医疗环境中,食物中毒和院内感染等集体感染的原因很多,感染管理很重要。
本试剂盒是用于进行大肠杆菌的菌种鉴定、克隆鉴定及菌株识别的基因型试剂盒。在PCR-based ORF Typing(POT)法中,使用多重PCR扩增大肠杆菌所拥有的多个特定基因区域,通过琼脂糖凝胶电泳法对分离出的带型进行数值化,从遗传学上决定克隆鉴定和菌株识别。

特征

  • 通过将分析结果数值化(POT值)E.coil菌株识别
  • 约4小时以内可以进行分子流行病学分析
  • 无需特殊装置
  • 特别是在ESBL产生大肠杆菌中接近PFGE的识别能力

套件配置

  个别名称 容量 数量
试剂A AptaTaq DNA Master(5×Conc.)* 240μL 一根
试剂B PCR补充剂 240μL 一根
试剂C 底漆α 120μL 一根
试剂D 引物混合β 120μL 一根
试剂E 正控制 240μL 一根
试剂F 6个加载缓冲区 240μL 一根

*AptaTaq DNA Master(5×Conc.)Roche诊断K.K.的产品。

操作步骤

  1. 分离的菌株纯培养
  2. 进行DNA提取,制备模板DNA
  3. 2种多路PCR
  4. 琼脂糖凝胶电泳
  5. 读取带模式
  6. POT值的计算
  7. 各检体的POT值的比较分析

分析方法

电泳模式
:50bp DNA梯形图
P:积极控制
N:负控制(TE缓冲液)
1-4:大肠杆菌的分离株

检测ORF的种类(目标区域)及其PCR扩增产物尺寸

  POT No。 放大尺寸(bp) 目标区域

读取,读取
mixture1
PCR PC 652 E.coil判定区域
POT1-1 511 Genomic Islet-1
POT1-2 415 Genomic Islet-2
POT1-3 363 Genomic Islet-3
POT1-4 307 Genomic Islet-4
POT1-5 253 Genomic Islet-5
POT1-6 222 Genomic Islet-6
POT2-1 178 bla CTX-M-2
POT2-2 146 Genomic Island-1
POT2-3 123 Genomic Island-2
POT2-4 98 Genomic Island-3
POT2-5 80 Genomic Island-4
读取,读取
mixture2
PCR PC 652 E.coil判定区域
POT2-6 527 Genomic Islet-7
POT2-7 436 Genomic Island-5
POT2-8 361 bla CTX-M-1
POT3-1 311 Genomic Island-6
POT3-2 250 Genomic Island-7
POT3-3 219 Genomic Islet-8
POT3-4 179 Genomic Island-8
POT3-5 154 Genomic Island-9
POT3-6 122 Genomic Islet-9
POT3-7 102 Genomic Island-10
POT3-8 79 bla CTX-M-9
  1. 从两个多路PCR的电泳结果读取带模式。
  2. 使用该电泳带有无的结果在POT值解析用Excel表中用二进制输入,计算3个类别的POT值。
    1. PCR PC阳性时,大肠杆菌(Escherichia coli)。
    2. 如果POT2值为奇数则为CTX-M-1group,如果为128以上则为CTX-M-2group
      如果POT3的值为奇数,则持有CTX-M-9group的各ESBL基因。
    3. 通过比较检体间POT值E.coli的菌体间的同源性能客观地推测。
    4. 从集体感染得到的菌体POT1~3的POT值全部变得相同。

分析结果

  样本编号
1个 2 3 4个
POT1 20 26 49 49
POT2 1个 144 58 101
POT3 94 4个 215 178

产品列表

产品编号 产品名称 保存温度 标准 包装 详细信息
08362-97 鹿西尼亚斯分子流行病学分析POT试剂盒(大肠杆菌用) 冷冻 分子生物学用 1次(30次)
08178-96 鹿西尼亚斯DNA提取试剂 冷藏 分子生物学用 1次(120次)

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