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.2024年1月5日；52（D1）：D1438-D1449。
doi:10.1093/nar/gkad944。

2024年IUPHAR/BPS药理学指南

西蒙·D·哈丁 1, 简·F·阿姆斯特朗 1, 埃琳娜·法森达 1, 克里斯托弗·索桑 1, 斯蒂芬·P·H·亚历山大 2, 安东尼·达文波特 三, 迈克尔·斯佩丁 4, 杰米·戴维斯 1
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2024年IUPHAR/BPS药理学指南

西蒙·德·哈丁等。 核酸研究. .

摘要

IUPHAR/BPS药理学指南（GtoPdb；https://www.guidetopharmacology.org)是一个开放存取的、由专家管理的在线数据库，为药理靶点及其推荐的实验配体提供了简明扼要的概述和关键参考。它包括3039个蛋白质靶点和12163个配体分子，包括批准的药物、小分子、肽和抗体。在这里，我们向资源报告了最近的发展，并描述了过去两年中六个数据库版本的内容扩展。本文的数据库更新部分侧重于与重大全球卫生挑战相关的两个领域。第一个是SARS-CoV-2冠状病毒-19，仍然是一个主要问题，我们描述了我们为扩展数据库以包括新的冠状病毒蛋白家族所做的努力。第二个领域是抗菌素耐药性，为此，我们与AntibioticDB合作，扩大了抗菌药物的覆盖面，这一合作通过GARDP的支持继续进行。我们还讨论了其他策展领域，并重点讨论了我们与PubChem等资源的外部联系，这些资源带来了重要的协同效应。

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数字

图形摘要
图形摘要
图1。
图1。
GtoPdb中配体类型的提取pIC50值的方框图汇总。该图显示了六个数据系列，每个数据系列针对不同的配体类型。每个系列总结了涉及该类型配体的相互作用的pIC50值。最小和最大晶须设置为1.5*IQR（四分位范围）。使用Highcharts JS编制图表(https://www.highcharts.com).
图2。
图2。
GtoPdb中目标类的提取pIC50值的方框图摘要。该图显示了六个数据系列，每个数据系列针对不同的目标类。每个系列总结了涉及该类目标的交互的pIC50值。最小和最大晶须设置为1.5*IQR（四分位范围）。使用Highcharts JS编制图表(https://www.highcharts.com).
图3。
图3。
PubChem中的药理学数据指南。面板A显示了PubChem上主要搜索“IUPHAR/BPS PHARACOLOGY指南”的结果。B组显示了PubChem物质的PHARMACOLOGY化合物指南搜索结果，该指南自2020年起提供，并标有我们批准的药物和抗体类别。使用的完整查询是（（（‘UPHAR/BPS药理学指南’[SourceName]）和‘gtopdb_approved’[Comment]）和’gtopdb_antibody’[Comment]）和（‘2020/01/01〃[AvailableDate]：‘3000’[Available Date]）。
图4。
图4。
Venn图显示了已批准的药物、抗体和《免疫药理学指南》记录之间的配体PubChem SID交叉点。使用Venny绘制的图表(https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny网站/).
图5。
图5。
显示PubChem CID比较的文氏图(A类)和UniProtKB标识符(B类)GtoPdb、ChEMBL和BindingDB之间。CID计数使用高级PubChem Compound搜索(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pccound网站)，在查询中指定源名称（即“IUPHAR/BPS PHARACOLOGY指南”[SourceName]而不是“ChEMBL”[SourceName]）。UniProtKB计数取自UniProt知识库高级搜索，过滤交叉引用>化学数据库（即。https://www.uniprot.org/uniprotkb？查询=%28数据库%3Guidetopharmacology%29+NOT+%28数据库%3Chembl%29). 这些交叉引用的更新频率可能因源而异。
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    1. Alexander S.P.H.，Mathie A.，Peters J.A.，受体和通道指南（GRAC），第5版。英国药理学杂志。2011; 164:S1–S324。-项目管理咨询公司-公共医学
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