NeMoFinder公司 swMATH ID: 29732 软件作者： Chen J、Hsu M、Lee L、Ng SK 描述： NeMofinder：具有中尺度网络基序的全基因组蛋白质-蛋白质相互作用。最近的网络分析工作揭示了蛋白质相互作用（PPI）网络等生物网络中存在网络基序。然而，现有的模体挖掘算法无法充分扩展以发现中尺度网络模体。此外，很少或根本没有系统地利用提取的网络基序来剖析巨大的相互作用体。我们描述了一种高效的网络模体发现算法NeMoFinder，该算法可以挖掘大型PPI网络中重复且唯一的中尺度网络模体。使用NeMoFinder，我们首次在大型全基因组酿酒酵母（酵母）PPI网络中成功发现了多达12个网络基序。我们还表明，可以系统地利用这些网络基序来索引通过高度错误的高通量实验方法生成的PPI数据的可靠性。 主页： https://dl.acm.org/citation.cfm？id=1150418 相关软件： 国防部;卡沃什;FANMOD公司;格雷姆林;KEGG公司;gSpan（量程）;MetaCyc公司;gl2vec公司;印章;线索GO;答对 了;图形库;HAPLO公司;MAVisto公司;算法97;PAML公司;ACME公司;ClustalW公司;MultiPhyl公司;PathBLAST（路径BLAST） 引用于： 6文件 全部的 前5名18位作者引用 1 哈亚特·迪诺·贝德鲁 1 马可·布雷桑 1 卡罕·埃尔西耶斯 1 冯玉凡 1 阿尔弗雷多·费罗 1 罗莎尔巴·朱格诺 1 艾莉森·希思。 1 利迪亚·卡夫拉基。 1 乔瓦尼·米凯尔 1 米塞尔·蒙吉奥夫·希 1 阿尔弗雷多·普维伦蒂 1 佩德罗·里贝罗 1 丹尼斯·沙沙（Dennis E.Shasha）。 1 费尔南多·席尔瓦 1 夏，冯 1 徐波 1 俞朔 1 张达 引用于4个系列 2 数据挖掘与知识发现 2 计算机科学评论 1 计算生物学 1 ACM算法事务 在3个字段中引用 5 计算机科学（68至XX） 三 生物学和其他自然科学（92-XX） 2 组合数学（05-XX） 按年份列出的引文