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ClueGO是一个细胞景观插件,它可视化功能分组网络中大簇基因的非冗余生物学术语。标识符可以从文本文件上载,也可以从Cytoscape网络交互上载。用户可以轻松地扩展支持的标识符类型。ClueGO对多个簇(基因列表)进行单聚类分析和比较。从所使用的本体源中,根据不同的过滤条件选择术语。共享相似相关基因的相关术语可以进行融合以减少冗余。ClueGO网络是用kappa统计量建立的,它反映了基于相关基因相似性的术语之间的关系。在网络上,节点颜色可以在功能组和簇分布之间切换。ClueGO图是生物学作用的特殊性和共同方面的基础。术语和组的重要性是自动计算的。ClueGO是很容易更新的最新文件从基因本体,KEGG,WikiPathways和Reactome。为了扩展它的功能,还可以使用CluePedia。


zbMATH中的参考文献(参考文献9条,1标准件)

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按年份排序(引用)

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  9. 宾迪亚,加布里埃拉;姆莱克尼克,伯恩哈德;哈克,休伯特;查伦通,色情;托索里尼,玛丽;基里洛夫斯基,阿莫斯;弗里德曼,沃尔夫·赫尔曼;帕吉斯,弗兰克;特拉贾诺斯基,兹拉特科;Galon,Jérôme:Cluego:一个用于破译功能分组基因本体和路径注释网络的细胞景观插件(2009)ioport公司