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线索GO

swMATH ID:	22916
软件作者：	Bindea G、Mlecnik B、Hackl H等人
描述：	ClueGO是一个Cytoscape插件，用于可视化功能分组网络中大型基因簇的非冗余生物学术语。标识符可以从文本文件上传，也可以从Cytospace网络交互上传。用户可以轻松扩展支持的标识符类型。ClueGO对几个簇（基因列表）进行单簇分析和比较。从所使用的本体源中，通过不同的过滤标准选择术语。共享相似关联基因的相关术语可以进行融合以减少冗余。ClueGO网络是用kappa统计数据创建的，根据相关基因的相似性反映术语之间的关系。在网络上，节点颜色可以在功能组和簇分布之间切换。线索GO图是生物学作用的特异性和共同方面的基础。自动计算术语和组的重要性。ClueGO可以轻松更新来自Gene Ontology、KEGG、WikiPathways和Reactome的最新文件。为了扩展它的功能，还可以获得ClueMedia。
主页：	http://apps.cytoscape.org/apps/cluego
相关软件：	字符串;完整的;KEGG公司;细胞景观;全球气候变化评估;生物网格;生物导体;对;反应途径;黑豹;处罚LDA;edr图形工具;RSIR公司;m代码;iCDI-PseFpt公司;药物数据库;GPCR-GIA公司;iEzy-药物;Clustal X公司;MEGA公司
引用于：	7文件

1出版物描述软件	年份
Cluego：一个细胞图插件，用于破译功能分组的基因本体和路径注释网络加布里埃拉·宾迪亚；Mlecnik，Bernhard；哈克尔，休伯特；Charoentong，Pornpimol；玛丽·托索里尼；阿莫斯·基里洛夫斯基；沃尔夫·赫尔曼·弗里德曼；法兰克·帕吉斯；特拉亚诺斯基，兹拉特科；杰罗姆·加隆	2009