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CliqueTop（单击顶部）

swMATH ID: 29766
软件作者： 朱斯蒂C
描述： CliqueTop是一组用于对称矩阵拓扑分析的matlab脚本。对于任何对称矩阵A，使用该包的语法为：ompute_clique_topology（A）。可以在compute_clique_topology函数的文档中找到选项和详细信息。CliqueTop目前依赖于以下软件包，为了方便起见，这些软件包包含在这个存储库中，并且应该在不安装的情况下自动运行：对于持久同源性计算，我们使用Vidit Nanda的Perseus。在撰写本文时，可以在以下位置找到当前版本网址：http://www.sas.upenn.edu/vnanda/perseus/index.html。我们建议使用此存储库中提供的快照，因为Perseus的输入/输出格式将来可能会更改。Cliquer，对于团枚举算法的团分裂版本，由Sampo Niskanen和Patric R.J.Østergárd编写的C包，可在http://users.aalto.fi/pat/cliquer.html。该代码由Chad Giusti编写，其基本思想是与Vladimir Itskov和Carina Curto共同工作的结果。这项工作得到了NSF DMS-1122519的支持。更多细节可以在Giusti、Pastalkova、Curto和Itskov中找到，“团拓扑揭示了神经相关性的内在几何结构。”（arXiv:1502.06172[q-bio.NC]和arXiv:1502.06173[q-bio.NC]）
主页： https://github.com/nebneuron/clique-top
源代码：  https://github.com/nebneuron/clique-top
依赖项： Matlab公司
相关软件： 洞;持久性图像;裂土器;github;叫做古迪辛;狄奥尼索斯;埃雷内;科学Py;javaPlex公司;TDA公司;乔托-塔达;大脑连接工具箱;AGL评分;地形网;爱马仕;j孔;旗手;麦考莱2;NetworkX公司;鲁万将军
引用于： 42文件

标准条款

1出版物描述软件，包括1出版物以zbMATH为单位 年份
团拓扑揭示了神经关联的内在几何结构。 Zbl 1355.92015年
乍得朱斯蒂;伊娃·帕斯塔尔科娃;卡琳娜·库托;弗拉基米尔·伊茨科夫
2015
全部的 前5名

133位作者引用

4 卡琳娜·帕梅拉·库托
4 Michael T.绍布。
2 丹妮尔·巴塞特。
2 乍得朱斯蒂
2 格罗斯，伊丽莎白
2 丹尼尔·埃尔南德斯·塞拉诺
2 萨拉·卡利什尼克·维罗夫舍克
2 兰比奥特，雷诺
2 梅莫利、法孔多
2 Neuhäuser，Leonie
2 聂春霞
2 乔瓦尼·佩特里
2 兹维·罗森
2 达里奥·桑切斯·戈梅斯
2 魏国伟
1 尼尔·安德烈亚斯·巴斯
1 费德里科·巴蒂斯顿
1 罗宾·林恩·贝尔顿
1 奥斯汀·R·本森。
1 马蒂亚·朱塞佩·贝戈米
1 科西奥·贝什科夫
1 理查德·贝策尔（Richard F.Betzel）。
1 吉内斯特拉·比安科尼
1 克里斯蒂安·比克
1 安·西泽莫尔·布莱文斯
1 彼得·布贝尼克
1 米凯尔·布歇
1 曹晓春
1 朱利亚·塞塞蒂
1 Eduarda Gervini Zampieri森特诺
1 沃伊切赫·查霍尔斯基
1 陈家辉
1 萨米尔·乔杜里
1 洛林·克劳福德
1 亚历山德罗·德·格雷戈里奥
1 丁、李
1 安东·多希特曼
1 琳达·杜
1 本杰明·邓恩
1 蒂娜·埃利亚西·拉德
1 艾默生·G·埃斯科拉。
1 专家，保罗
1 布列塔尼·特雷泽·法西
1 马西莫·费里
1 乌尔德里科·福加奇
1 安娜·露西亚·加西亚·普利多
1 帕斯卡·格兰奇
1 海瑟·A·哈灵顿。
1 胡安·埃尔南德斯·塞拉诺
1 凯瑟琳·赫斯。
1 保罗·霍恩（Paul S.Horn）。
1 胡萍
1 迈克尔·B·赫尔。
1 伊阿科皮尼，伊阿科波
1 弗拉基米尔·伊茨科夫
1 阿里·贾德巴伊
1 乔纳森·贾奎特
1 杰弗里斯，杰克
1 阿里·卡恩
1 Kim，Woojin先生
1 亚历山大·库宁（Alexander B.Kunin）。
1 维托·拉托拉
1 克里斯蒂安·莱恩
1 冷、惠
1 李少梅
1 李伟
1 凯特琳·连凯佩尔
1 林乐亨
1 弗拉达·利米奇
1 加博尔·利普纳
1 刘健
1 刘书欣
1 马克西姆·卢卡斯
1 安德鲁·梅勒
1 罗斯蒂克·默茨
1 塞缪尔·米卡
1 大卫·L·米尔曼。
1 莫诺德、安提亚
1 朱利亚·莫雷尼
1 凯瑟琳·莫里森
1 Daan Mulder
1 格雷戈里·奈扎特
1 穆罕默德·奥马尔
1 乔舒亚·白克
1 伊娃·帕斯塔尔科娃
1 爱丽丝·巴塔尼亚
1 德鲁夫·帕特尔。
1 帕蒂尼奥·加林多，胡安·安格尔
1 尼古拉·奎西奥利
1 艾米丽·里班多·格罗斯
1 伊戈尔·里文
1 埃里克·里巴肯
1 丹尼尔·萨利纳斯
1 费尔南多·安托尼奥·诺布雷加·桑托斯
1 萨拉·斯卡拉穆西亚
1 安娜·申菲施
1 约旦舒巴赫
1 本杰明·施韦恩哈特
1 Shiu，Anne（安妮·休）
1 安·西莫尔（Ann E.Sizemore）。
…还有33位作者
全部的 前5名

30篇连载文章中引用

三 SIAM审查
2 非线性科学与数值模拟中的通信
2 SIAM应用代数和几何杂志
1 生物控制论
1 反问题
1 统计物理杂志
1 生理学A
1 《物理快报》。一个
1 物理报告
1 混沌、孤子和分形
1 应用数学与计算
1 欧洲组合数学杂志
1 应用数学进展
1 离散和计算几何
1 神经计算
1 计算几何
1 美国国家科学院院刊
1 美国数学学会公报。新系列
1 国际应用科学与工程分叉与混沌杂志
1 Fractals公司
1 计算神经科学杂志
1 范畴的理论与应用
1 复杂性
1 数学学报。英语系列
1 机器学习研究杂志（JMLR）
1 应用数学与工业数学的交流
1 应用与计算拓扑杂志
1 计算和数学生物物理
1 数据科学基础
1 组合理论
全部的 前5名

21个领域被引用

20 代数拓扑（55-XX）
16 组合数学（05-XX）
14 生物学和其他自然科学（92-XX）
9 博弈论、经济学、金融和其他社会和行为科学（91-XX）
8 统计学（62-XX）
8 计算机科学（68至XX）
三 交换代数（13-XX）
三 流形和细胞复合体（57至XX）
三 统计力学，物质结构（82-XX）
三 信息与通信理论、电路（94-XX）
2 代数几何（14-XX）
2 测量和集成（28-XX）
2 动力系统和遍历理论（37至XX）
2 概率论与随机过程（60-XX）
2 运筹学、数学编程（90-XX）
1 总体主题；集合（00-XX）
1 范畴理论；同调代数（18-XX）
1 常微分方程（34-XX）
1 凸和离散几何（52至XX）
1 一般拓扑结构（54至XX）
1 系统论；控制（93至XX）

按年份列出的引文