MATRAS公司 swMATH ID: 16871 软件作者： 川端武 说明： MATRAS：蛋白质3D结构比较程序。最近积累了大量的三维结构数据，因此需要一种灵敏、自动的方法来比较和分类这些结构。我们使用Matras程序开发了一个用于比较蛋白质3D结构的网络服务器(http://biunit.aist-nara.ac.jp/matras网站). Matras的一个优点是其结构相似性得分，它被定义为概率的对数，类似于Dayhoff的氨基酸替代模型。该评分旨在检测进化相关（同源）结构相似性。我们的网络服务器有三个主要服务。第一种是成对3D对齐，即简单地对齐两个结构。用户可以通过输入PDB代码或在本地计算机中上传PDB格式文件来分配结构。第二个服务是多重3D比对，它比较几个蛋白质结构。该程序采用渐进式对齐算法，其中成对3D对齐以正确的顺序组装。第三项服务是三维图书馆搜索，它将一个查询结构与大量的图书馆结构进行比较。我们希望该服务器为深入了解蛋白质3D结构提供有用的工具。 主页： http://nar.oxfordjournals.org/content/31/13/3367.short 相关软件： 肌肉;剂量;阿波罗;DBAli工具;NUCPLOT公司;LIGPLOT公司;EMBOS公司;焦耳（Jmol）;PhenomeNET公司;智能GO;Ontobee公司;FUNC公司;Aber-OWL公司;工厂TFDB;鸡蛋NOG;ELM公司;数据库CAN;抗SMASH;解剖HMMER;HPMV（高压中压） 引用于： 1文件 2位作者引用 1 卡鲁戈语、奥利维埃罗语 1 弗兰克·艾森哈伯 连载1篇 1 分子生物学方法 在2个字段中引用 1 统计学（62-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文