榆树

ELM服务器:研究模块化真核蛋白质短功能位点的新资源。多结构域蛋白在真核蛋白质组中占主导地位。分配给不同序列片段的单个功能结合起来为整个蛋白质创建一个复杂的功能。虽然在线资源可用于在序列中揭示球状结构域,但迄今为止还没有一个可与球状结构域资源相媲美的小功能位点/基序的综合收集,然而这些对于多结构域蛋白质的功能同样重要。短线性肽基序用于细胞室靶向、蛋白质-蛋白质相互作用、磷酸化、乙酰化、糖基化和其他许多翻译后修饰。ELM是位于http://ELM.eu.org/的真核生物线性基序服务器,是研究真核生物蛋白质中候选短非球状功能基序的一种新的生物信息学资源,旨在填补生物信息学工具的空白。用短基序进行序列比较很难进行评价,因为通常的显著性评估是不合适的。因此,服务器使用几个逻辑过滤器来消除误报。目前的过滤器是针对细胞室,球状域冲突和分类范围。在有利的情况下,滤波器可以将保留匹配的数量减少一个数量级或更多。


zbMATH参考文献(参考 8篇文章 参考)

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