函数

功能：一个检测基因集和本体论注释之间重要关联的软件包。背景：全基因组表达、序列和关联研究通常会产生大量候选基因，然后必须进一步分析和解释。关于这些基因的信息越来越多地被捕获和组织在本体论中，例如基因本体论。通过实验方法鉴定出的基因集与生物学知识之间的关系可以明确化并用于解释结果。然而，由于许多相互依赖的类别是同时测试的，因此通常很难评估这些分析的统计意义。结果：我们开发了程序包FUNC，包括并扩展了现有的方法，以识别基因集和本体论注释之间的重要关联。实现了几个特别适用于全基因组序列比较的测试、家庭错误率的估计、错误发现率、结果全局重要性的敏感估计器以及降低结果复杂性的算法。结论：FUNC是全基因组数据分析的通用工具。它可以在GPL许可下免费获得，也可以通过web服务访问。