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闪光HMM

swMATH ID: 21670
软件作者: W.H.Majoros、M.Pertea、S.L.Salzberg
描述: GlimmerHMM是一种基于广义隐马尔可夫模型(GHMM)的新基因发现器。尽管基因查找器符合GHMM的整体数学框架,但它还结合了来自GeneSplicer程序的剪接位点模型和来自GlimmerM的决策树。它还将内插马尔可夫模型用于编码和非编码模型。目前,GlimmerHMM的GHMM结构包括每个阶段的内含子、基因间区域和四种类型的外显子(初始、内部、最终和单个)。这里可以查阅基本的用户手册。
主页: https://ccb.jhu.edu/software/glimmerhmm网站/
相关软件: 老虎扫描;生物HMM;PICNIC公司;基因智慧;MetaGeneAnnotator(元基因注释器);数字;InterProScan公司;ESTScan扫描;ExonHunter公司;EasyGene公司
引用于: 3文件

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