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老虎扫描

swMATH ID: 21669
软件作者: W.H.Majoros、M.Pertea、S.L.Salzberg
描述: TigrScan是一种基于广义隐马尔可夫模型框架的基因查找器,类似于Genscan和Genie。它具有高度可重构性,并包括用于再培训的软件。它是用高度优化的C++编写的。运行时间和内存需求在序列长度上是线性的。提供了高分开放阅读框架的图论表示,允许探索次优基因模型。它使用插值马尔可夫模型(IMM)。
主页: http://www.cbcb.umd.edu/software/pirate/tigrscan/tigrscan-menu.html
相关软件: 闪光HMM;生物HMM;PICNIC公司;InterProScan公司;ESTScan扫描;ExonHunter公司;EasyGene公司
引用于: 3文件

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