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TATES公司

swMATH ID: 20044
软件作者: van der Sluis,S.、D.Posthuma、C.V.Dolan
描述: TATES:用于全基因组关联研究的高效多元基因型-表型分析。迄今为止,全基因组关联研究(GWAS)是鉴定导致表型变异的遗传变异的主要工具。由于GWAS分析在本质上通常是单变量的,因此多变量表型信息通常被简化为单个综合得分。这种做法往往导致检测因果变量的统计能力丧失。多元基因型-表型方法确实存在,但只有在特殊情况下才能达到最大功效。在这里,我们提出了一种新的多元方法,我们称之为TATES(使用扩展Simes程序的基于特征的关联测试),该方法受到了Li等人(2011)提出的GATES程序的启发。对于多元性状的每个成分,TATES将在标准单变量GWAS中获得的p值组合起来,以获得一个基于trait的p值,同时校正成分之间的相关性。广泛的模拟,探索各种基因型-表型模型,表明TATES的假阳性率是正确的,TATES检测因果变量的统计能力解释了0.5
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23359524
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引用于: 4文件

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