基因俱乐部 swMATH ID: 8358 软件作者： Kim-Anh Do、Bradley Broom、Sijin Wen 描述： 基因俱乐部。双向聚类技术，如层次聚类、K-means聚类、树结构矢量量化、自组织映射、，主成分分析被用来将基因组织成组或“簇”“在相关的组织样本或细胞系中具有相似的行为。然而，这些程序寻求所有基因的样本或细胞株的单一全局重新排序，尽管它们在揭示总体全局结构方面很有效，但在应用于更复杂的聚类模式时，效果要差得多（例如，存在重叠基因簇的地方）。本章介绍了基因剃毛（Hastie等人，2000年），这是一种简单但有效的方法，用于识别具有连贯表达模式且在样本或条件之间存在较大差异的基因子集。在总结了基因保存方法之后，我们描述了实现该方法的两个软件包：一个用S编写的小软件包（可在S-Plus或R中使用）和一个速度快得多的混合语言实现，带有一个图形用户界面，用于更广泛的应用。该软件包可以执行无监督、完全监督或部分监督的基因剃毛，用户可以指定与算法相关的各种参数。该包输出提取的簇的图形表示（如彩色热图）和诊断统计信息。然后，我们演示了如何使用后一个工具分析两个已发布的数据集（Alon colon数据和NCI60数据）。 主页： http://rd.springer.com/chapter/10.1007/0-387-21679-0_15 相关软件： 结婚输入;S-PLUS系统;椭圆;POE公司;马诺瓦;山姆;电子束阵列;MAExplorer（主浏览器）;斯诺马德;龙视图;表达式探查器;d芯片;结婚地块;结婚标准;结婚课程;EMMIX公司;生物导体;R（右） 引用于： 1文件 4位作者引用 1 伊丽莎白·S·加勒特。 1 拉斐尔·艾里扎里。 1 乔瓦尼·帕尔米吉亚尼 1 斯科特·泽格。 连载1篇 1 生物与健康统计 在3个字段中引用 1 总体主题；集合（00-XX） 1 统计学（62-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文