山姆 swMATH ID: 8356 软件作者: John D.Storey,Robert Tibshirani 描述: DNA微阵列中检测差异基因表达的SAM阈值和错误发现率。SAM是一个计算机软件包,用于将基因表达与结果参数(如治疗、生存时间或诊断等级)相关联。它为适当的测试统计设置阈值,并基于一组样本排列报告每个测试的q值。SAM作为Microsoft Excel插件工作,具有用于折叠更改阈值和块排列的其他功能。在这里,我们解释了SAM方法如何在检测DNA微阵列中差异基因表达的一般方法的背景下工作。SAM软件中包含了一些最近开发的估计错误发现率和q值的方法,我们在这里进行了总结。 主页: http://rd.springer.com/chapter/10.1007/0-387-21679-0_12 相关软件: 生物导体;对;EB阵列;cp4p(cp4p);GEST公司;马诺瓦;github;利马;DEseq公司;Voom公司;边缘R;锡;阵列Express;TM4公司;WinBUGS公司;FAMT公司;农场测试;磁盘操作系统;TETRAD公司;cov测试 引用于: 26文件 全部的 前5名69位作者引用 3 约阿夫·本杰米尼 3 乔瓦尼·帕尔米吉亚尼 3 童铁军 2 约瑟夫·贝耶恩 2 比斯瓦斯,阿尼基特 2 艾哈迈德·侯赛因 2 丹尼尔·叶库蒂利 1 Natalie J.Blades。 1 吉尔斯·布兰查德 1 西米娜·博卡(Simina M.Boca)。 1 斯特凡诺·博纳西 1 布莱恩·卡福(Brian S.Caffo)。 1 塞奥拉达·布拉沃,赫克托 1 阿迪蒂亚·查特吉 1 查托帕迪亚伊,高兰加德布 1 加里·丘吉尔。 1 艾琳·康隆(Erin M.Conlon)。 1 崔向琴 1 格雷戈里·埃尔默。 1 范建清 1 Zeny Z.冯。 1 伊丽莎白·S·加勒特。 1 尤利娅·加夫里洛夫 1 彼得·吉尔伯特。 1 达琳·R·戈尔茨坦。 1 鲁迪·格拉 1 特雷弗·约翰·哈斯蒂 1 何旭明 1 朱莉娅·希尔顿。 1 杰克·霍夫曼(Jake M.Hofman)。 1 胡平钊 1 胡宗良 1 Hwang,J.T.基因 1 拉斐尔·艾里扎里。 1 张和民 1 阿德尔·坎马德 1 内里·卡夫卡菲 1 柯、袁 1 阿巴·克里格(Abba M.Krieger)。 1 Lee,Norman H。 1 Jeffrey T·利克。 1 诺亚·E·莱特温。 1 李高荣 1 德里克·罗夫利。 1 Barbara A.Methé。 1 安德烈亚·蒙塔纳里 1 斯特凡诺·莫雷蒂 1 彼得·米勒 1 皮埃尔·诺维亚尔 1 内文,K.P。 1 菲奥拉万特赞助人 1 波西耶,B.L。 1 邱靖 1 阿纳特·雷内尔·本奈姆 1 克里斯蒂安·罗伯特。 1 埃蒂安·罗奎恩 1 朱迪思·卢梭 1 萨纳特·库马尔·萨卡尔 1 阿米特·拉吉·沙玛 1 孙强 1 Robert John Tibshirani先生 1 王惠霞 1 王跃东 1 邓肯·詹姆斯·瓦茨 1 安德鲁·威兰(Andrew R.Willan)。 1 杨一平 1 斯科特·泽格。 1 赵宏宇 1 周文欣 全部的 前5名引用于18个系列 4 应用统计学杂志 2 统计学年鉴 2 生物计量学 2 美国统计协会杂志 2 生物统计学 1 斯堪的纳维亚统计杂志 1 生物特征 1 多元分析杂志 1 Neerlandica统计 1 统计传播。模拟和计算 1 计算统计与数据分析 1 顶部 1 英国皇家统计学会杂志。C系列应用统计 1 机器学习研究杂志(JMLR) 1 电子统计杂志 1 应用统计学年鉴 1 生物与健康统计 1 查普曼和霍尔/CRC数学和计算生物学系列 全部的 前5名在6个字段中引用 24 统计学(62-XX) 8 生物学和其他自然科学(92-XX) 5 数值分析(65-XX) 2 总体主题;集合(00-XX) 1 概率论与随机过程(60-XX) 1 博弈论、经济学、金融和其他社会和行为科学(91-XX) 按年份列出的引文