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山姆

swMATH ID: 8356
软件作者: John D.Storey,Robert Tibshirani
描述: DNA微阵列中检测差异基因表达的SAM阈值和错误发现率。SAM是一个计算机软件包,用于将基因表达与结果参数(如治疗、生存时间或诊断等级)相关联。它为适当的测试统计设置阈值,并基于一组样本排列报告每个测试的q值。SAM作为Microsoft Excel插件工作,具有用于折叠更改阈值和块排列的其他功能。在这里,我们解释了SAM方法如何在检测DNA微阵列中差异基因表达的一般方法的背景下工作。SAM软件中包含了一些最近开发的估计错误发现率和q值的方法,我们在这里进行了总结。
主页: http://rd.springer.com/chapter/10.1007/0-387-21679-0_12
相关软件: 生物导体;;EB阵列;cp4p(cp4p);GEST公司;马诺瓦;github;利马;DEseq公司;Voom公司;边缘R;;阵列Express;TM4公司;WinBUGS公司;FAMT公司;农场测试;磁盘操作系统;TETRAD公司;cov测试
引用于: 26文件
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69位作者引用

3 约阿夫·本杰米尼
3 乔瓦尼·帕尔米吉亚尼
3 童铁军
2 约瑟夫·贝耶恩
2 比斯瓦斯,阿尼基特
2 艾哈迈德·侯赛因
2 丹尼尔·叶库蒂利
1 Natalie J.Blades。
1 吉尔斯·布兰查德
1 西米娜·博卡(Simina M.Boca)。
1 斯特凡诺·博纳西
1 布莱恩·卡福(Brian S.Caffo)。
1 塞奥拉达·布拉沃,赫克托
1 阿迪蒂亚·查特吉
1 查托帕迪亚伊,高兰加德布
1 加里·丘吉尔。
1 艾琳·康隆(Erin M.Conlon)。
1 崔向琴
1 格雷戈里·埃尔默。
1 范建清
1 Zeny Z.冯。
1 伊丽莎白·S·加勒特。
1 尤利娅·加夫里洛夫
1 彼得·吉尔伯特。
1 达琳·R·戈尔茨坦。
1 鲁迪·格拉
1 特雷弗·约翰·哈斯蒂
1 何旭明
1 朱莉娅·希尔顿。
1 杰克·霍夫曼(Jake M.Hofman)。
1 胡平钊
1 胡宗良
1 Hwang,J.T.基因
1 拉斐尔·艾里扎里。
1 张和民
1 阿德尔·坎马德
1 内里·卡夫卡菲
1 柯、袁
1 阿巴·克里格(Abba M.Krieger)。
1 Lee,Norman H。
1 Jeffrey T·利克。
1 诺亚·E·莱特温。
1 李高荣
1 德里克·罗夫利。
1 Barbara A.Methé。
1 安德烈亚·蒙塔纳里
1 斯特凡诺·莫雷蒂
1 彼得·米勒
1 皮埃尔·诺维亚尔
1 内文,K.P。
1 菲奥拉万特赞助人
1 波西耶,B.L。
1 邱靖
1 阿纳特·雷内尔·本奈姆
1 克里斯蒂安·罗伯特。
1 埃蒂安·罗奎恩
1 朱迪思·卢梭
1 萨纳特·库马尔·萨卡尔
1 阿米特·拉吉·沙玛
1 孙强
1 Robert John Tibshirani先生
1 王惠霞
1 王跃东
1 邓肯·詹姆斯·瓦茨
1 安德鲁·威兰(Andrew R.Willan)。
1 杨一平
1 斯科特·泽格。
1 赵宏宇
1 周文欣

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