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生物门户

swMATH编号: 22917
软件作者: Noy NF、Shah NH、Whetzel PL等人
描述: BioPortal:点击鼠标即可获得本体和集成数据资源。生物医学本体提供基本的领域知识,以推动数据集成、信息检索、数据注释、自然语言处理和决策支持。生物门户(http://bioportal.bioontology.org)是一个开放的生物医学本体库,通过Web服务和Web浏览器访问以OWL、RDF、OBO格式和Protégéframes开发的本体。BioPortal功能包括浏览、搜索和可视化本体的能力。Web界面还提供了一些功能,可以根据可用性、域覆盖率、内容质量以及文档和支持等标准,为本体术语、术语之间的映射和本体审查添加注释,从而促进基于社区的参与本体内容的评估和演变。BioPortal还通过在BioPortal中用本体对生物医学数据资源进行注释和索引,实现了对生物医学数据资源的集成搜索,如基因表达综合总线(GEO)、ClinicalTrials.gov和ArrayExpress。因此,BioPortal不仅为研究人员、临床医生和开发人员提供了以编程方式访问生物医学本体的“一站式购物”,还为集成来自各种生物医学资源的数据提供了支持。
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19483092
相关软件: DBpedia(数据库);链锯;弹丸;Konclude公司;故障电流互感器++;银河;Aber-OWL公司;WebProtege公司;Ontobee公司;JavaScript脚本;EDAM浏览器;阿伯纳;QTAG公司;生物2RDF;BioMOBY公司;caGrid公司;塔维纳;AlexNet公司;达奇;PointNet(点网)
引用于: 8文件

标准条款

1出版物描述软件 年份
生物门户:点击鼠标即可获得本体和集成数据资源
诺伊,娜塔莉亚·弗里德曼;尼甘·沙阿。;Patricia L.Whetzel。;戴,本杰明;迈克尔·多夫(Michael Dorf);尼古拉斯·格里菲斯;克莱门特·琼奎特;丹尼尔·鲁宾(Daniel L.Rubin)。;《故事》,玛格丽特·安妮·D。;Chute,Christopher G。;马克·穆森。
2009

按年份列出的引文