跳到主页内容
美国国旗

美国政府的官方网站

Dot政府

gov意味着它是官方的。
联邦政府网站通常以.gov或.mil结尾。之前分享敏感信息，确保你在联邦政府网站。

Https系统

该站点是安全的。
这个https（https）：//确保您连接到官方网站，并且您提供的任何信息都是加密的并安全传输。

访问密钥 NCBI主页 MyNCBI主页 主要内容 主导航
.2009年7月；37（Web服务器问题）：W170-3。
doi:10.1093/nar/gkp440。 Epub 2009年5月29日。

BioPortal：点击鼠标即可获得本体和集成数据资源

娜塔莉亚·诺伊 1, 尼甘·沙阿, 帕特里夏·L·威策尔, 本杰明·戴, 多尔夫, 尼古拉斯·格里菲斯, 克莱门·琼奎特, 丹尼尔·鲁宾, 玛格丽特·安妮·斯托里, 克里斯托弗·G·丘特, 马克·穆森
附属公司

BioPortal：点击鼠标即可获得本体和集成数据资源

娜塔莉亚·诺伊等。 核酸研究. 2009年7月.

摘要

生物医学本体提供基本的领域知识，以推动数据集成、信息检索、数据注释、自然语言处理和决策支持。生物门户(http://bioportal.bioontology.org)是一个开放的生物医学本体库，通过Web服务和Web浏览器访问以OWL、RDF、OBO格式和Protégéframes开发的本体。BioPortal功能包括浏览、搜索和可视化本体的能力。Web界面还提供了一些功能，可以根据可用性、域覆盖率、内容质量以及文档和支持等标准，为本体术语、术语之间的映射和本体审查添加注释，从而促进基于社区的参与本体内容的评估和演变。通过在BioPortal中使用本体对这些资源进行注释和索引，BioPortal还可以集成搜索生物医学数据资源，如基因表达总表（GEO）、ClinicalTrials.gov和ArrayExpress。因此，BioPortal不仅为研究人员、临床医生和开发人员提供了以编程方式访问生物医学本体的“一站式购物”，还为集成来自各种生物医学资源的数据提供了支持。

PubMed免责声明

数字

图1。
图1。
BioPortal资源选项卡显示肝细胞癌术语的本体索引资源。
图2。
图2。
BioPortal架构。
请参阅PMC中的此图像和版权信息

类似文章

查看所有类似文章

引用人

  • 本体4Cat：调查用于催化研究数据管理的本体景观。
    Behr AS、Borgelt H、Kockmann N。 Behr AS等人。 化学信息杂志。2024年2月7日；16(1):16. doi:10.1186/s13321-024-00807-2。 《化学杂志》。2024 采购管理信息：38326906 免费PMC文章。
  • 糖尿病中医本体论的开发与应用。
    胡J，黄Z，葛X，沈Y，徐Y，张Z，周G，王J，卢S，于Y，万C，张X，黄R，刘Y，程G。 胡杰等。 BMC Med通知Decis Mak。2024年1月19日；24(1):18. doi:10.1186/s12911-023-02405-y。 BMC Med通知Decis Mak。2024 采购管理信息：38243204 免费PMC文章。
  • 整合健康的商业和社会决定因素：健康非临床决定因素的统一本体。
    Kollapally NM、Keloth VK、Xu J、Geller J。 Kollapally NM等人。 AMIA年度交响乐程序。2024年1月11日；2023:446-455. eCollection 2023年。 AMIA年度交响乐程序。2024 采购管理信息：38222328 免费PMC文章。
  • 基础本体论在生物医学研究中的应用。
    BernabéCH、Queralt-Rosinach N、Silva Souza VE、Bonino da Silva Santos LO、Mons B、Jacobsen A、Roos M。 BernabéCH等人。 生物语义学杂志。2023年12月11日；14(1):21. doi:10.1186/s13326-023-00300-z。 生物语义学杂志。2023 采购管理信息：38082345 免费PMC文章。 审查。
  • 在比较本体版本时分析和实现DynDiff工具。
    Diaz Benavides S、Cardoso SD、Da Silveira M、Pruski C。 Diaz Benavides S等人。 生物语义学杂志。2023年9月28日；14(1):15. doi:10.1186/s13326-023-00295-7。 生物语义学杂志。2023 采购管理信息：37770956 免费PMC文章。
查看所有“被引用”文章

工具书类

    1. Cote RG、Jones P、Martens L、Apweiler R、Hermjakob H。本体查找服务：用于受控词汇查询的更多数据和更好的工具。核酸研究2008；36:W372–W376。-项目管理咨询公司-公共医学
    1. Cote RG，Jones P，Apweiler R，Hermjakob H.本体查找服务，一种用于受控词汇查询的轻量级跨平台工具。BMC生物信息学。2006;7:97.-项目管理咨询公司-公共医学
    1. Shah NH、Jonquet C、Chiang AP、Butte AJ、Chen R、Musen MA。翻译生物信息学公共数据集的本体论驱动索引。BMC生物信息学。2009;10（补充2）：S1。-项目管理咨询公司-公共医学
    1. Smith B、Ashburner M、Rosse C、Bard J、Bug W、Ceusters W、Goldberg LJ、Eilbeck K、Ireland A、Mungall CJ等。海外建筑运营管理局铸造厂：支持生物医学数据集成的本体论协调发展。自然生物技术。2007;25:1251–1255.-项目管理咨询公司-公共医学
    1. Fink JL、Kushch S、Williams PR、Bourne PE。生物文学：将生物文献与数据库结合。核酸研究2008；36:W385–W389。-项目管理咨询公司-公共医学

出版物类型