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阿伯纳

swMATH编号: 30049
软件作者: 伯尔定居
描述: ABNER:一个开源工具,用于在文本中自动标记基因、蛋白质和其他实体名称。摘要:ABNER(生物医学命名实体识别器)是一种用于分子生物学文本挖掘的开源软件工具。其核心是一个机器学习系统,该系统使用具有各种正交和上下文特征的条件随机场。最新版本是1.5,它有一个直观的图形界面,包括两个模块,用于标记在标准语料库上训练的实体(例如蛋白质和细胞系),其性能大致处于最先进水平。它还包括一个Java应用程序编程接口,允许用户将ABNER合并到自己的系统中,并在新语料库上训练模型。可用性:ABNER可作为可执行Java存档和源代码从网址:http://www.cs.wisc.edu/b设置/abner/
主页: https://academic.oup.com/bioinformatics/article/21/14/3191/266815
依赖项: Java语言
相关软件: iHOP公司;专业矿工;GENIA语料库;KEGG公司;生物2RDF;生物门户;RelEx公司;打开DMAP;SVM灯;基因标签;医学扫描;链接语法-WN
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