4D34型

牛内皮型一氧化氮合酶血红素结构域与2-(2-(1H-咪唑-1-基)嘧啶-4-基)-N-(3-氟苯乙基)乙醇-1-胺配合物的结构


实验数据快照

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:2.25 Å
  • R值自由:0.231 
  • R值工作:0.176 
  • 观察到的R值:0.179 

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文学类

新型2,4-二取代嘧啶类化合物作为神经元一氧化氮合酶的强效、选择性和细胞渗透性抑制剂。

穆克吉,P。李,H。塞夫里奥科娃,I。克雷菲,G。Martasek,P。罗曼,L.J。普洛斯,T.L。R.B.西尔弗曼。

(2015)医学化学杂志58: 1067

  • 内政部:https://doi.org/10.1021/jm501719e
  • 相关结构的主要引文:
    4D2年,4天2次,4D30型,4D31型,4D32型,4D33型,4D34型,4D35型,4D36型,4D37型,4D38型,4D39型,4D3A型,4D3B型,4个UCH,4V3U型,4伏3伏,4伏3瓦,4V3X型,4V3Y型,4V3Z型

  • PubMed摘要:

    选择性抑制神经元一氧化氮合酶(nNOS)是靶向神经退行性疾病的重要治疗手段。然而,开发的大多数nNOS抑制剂都是精氨酸模拟物,因此生物利用度较差。我们设计了一种新的策略,将一种更具药代动力学优势的2-咪唑基嘧啶头与以前抑制剂中有前景的结构成分结合起来。结合广泛的结构-活性研究,发现了几种高效和选择性的nNOS抑制剂。X射线晶体学分析表明,这些II型抑制剂利用相同的疏水囊来获得强大的抑制效力(13),以及较高的异构体选择性。有趣的是,从该系列(9)中选择的化合物在Caco-2分析中显示出良好的渗透性和低外排,表明潜在的口服生物利用度,并显示出与50个中枢神经系统受体的最小非靶向结合。此外,即使分子中含有血红素配位基团,修饰其他药效片段也能最大限度地减少人类肝微粒体细胞色素P450的不良抑制。


  • 组织附属关系

    美国伊利诺伊州埃文斯顿西北大学分子创新和药物发现中心生命过程化学研究所分子生物科学系化学系,邮编:60208-3113。


大分子
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:1
分子链条序列长度有机体细节图像
一氧化氮合酶,内皮443牛头怪突变: 0 
欧盟委员会:1.14.13.39
UniProt公司
寻找蛋白质第29473页 (Bos金牛)
探索第29473页 
转到UniProtKB:第29473页
实体组 
序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团第29473页
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  • 参考序列
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配体6独特
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HEM查询

下载理想坐标CCD文件
C[认证A],
本人【授权B】
含FE的原卟啉IX
C类34H(H)32铁氮4O(运行)4
KABFMIBPWCXCRK-RGGAHWMASA-L公司
E2Z公司
E2Z查询

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E[认证A],
K[认证B]
2-(3-氟苯基)-N-{2-[2-(1H-咪唑-1-基)嘧啶-4-基]乙基}乙胺
C类17H(H)18前N5
ZPTNPJCYGBTULC-UHFFFAOYSA-N公司
H4B型
H4B查询

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D[认证A],
J[认证B]
5,6,7,8-四氢生物蝶呤
C类9H(H)15N个5O(运行)
FNKQXYHWGSIFBK-RPDRRWSUSA-N公司
高尔夫球
GOL查询

下载理想坐标CCD文件
G[认证A],
M[认证B]
甘油
C类H(H)8O(运行)
PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N公司

ZN查询

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H[认证A]锌离子

PTFCDOFLOPIGGS-UHFFFAOYSA-N公司
ACT公司
ACT查询

下载理想坐标CCD文件
F[认证A],
L[认证B]
醋酸盐离子
C类2H(H)O(运行)2
QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M公司
改性残留物 1独特
身份证件链条类型公式2D图表起源
中国科学院
CAS查询
A、 B类
L-肽连接C类5H(H)12作为N O2S公司CYS公司
绑定相关性批注
身份证件来源绑定相关性
E2Z公司 绑定MOAD: 4D34型 Ki公司:1.05e+4(nM)来自1次分析
绑定数据库: 4D34型 Ki公司:1次化验4000(nM)
实验数据和验证

实验数据

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:2.25 Å
  • R值自由:0.231 
  • R值工作:0.176 
  • 观察到的R值:0.179 
  • 空间组:第2页12121
单位单元格:
长度(Ω)角度(˚)
a=58.159α=90
b=106.632β=90
c=156.638γ = 90
软件包:
软件名称目的
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XDS公司数据缩减
SCALA公司数据缩放
REFMAC公司阶段划分

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  • 版本1.1:2015-03-04
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