4D34型

牛内皮型一氧化氮合酶血红素结构域与2-(2-(1H-咪唑-1-基)嘧啶-4-基)-N-(3-氟苯乙基)乙醇-1-胺配合物的结构


X射线衍射

结晶

结晶实验
身份证件方法酸碱度温度详细信息
1620-22%PEG3350,0.1 M碳酸酯,150-200 MM MG醋酸盐,5 MM TCEP,pH 6.0
晶体特性
马修斯系数溶剂含量
2.550.7

Crystal数据

单位单元格
长度(Ω)角度(˚)
a=58.159α = 90
b=106.632β = 90
c=156.638γ = 90
对称
空间组电话21 21 21

衍射

衍射实验
ID编号#水晶ID散射类型数据采集温度探测器探测器类型详细信息收款日期单色仪协议
11x射线100像素DECTRIS PILATUS公司镜子2013-12-01M(M)单波长
辐射源
ID编号#来源类型波长列表同步加速器站点光束线
1同步加速器SSRL梁线BL11-1SSRL公司BL11-1型

数据收集

总体
ID编号#分辨率(高)分辨率(低)可能百分比(观察)R合并I(观察)净I高于平均Sigma(I)冗余反射数(全部)反射次数(观察)观察标准Sigma(F)观察标准西格玛(I)B(各向同性)来自Wilson图
12.255099.60.09145.847016-3个
最高分辨率外壳
ID编号#分辨率(高)分辨率(低)可能百分比(全部)可能百分比(观察)R合并I(观察)Sigma上的平均值I(观察值)冗余唯一反射数(全部)
12.252.3798.71.50.85.5

精炼

统计
衍射ID结构求解方法交叉验证方法分辨率(高)分辨率(低)反射次数(观察)反射次数(R-Free)反射百分比(观察)R系数(观察值)R工作R自由R-Free选择细节平均各向同性B
X射线衍射分子替换贯穿始终2.254044238232098.770.178510.17580.23061随机55.811
温度因素建模
各向异性B[1]各向异性B[1][2]各向异性B[1][3]各向异性B[2]各向异性B[2][3]各向异性B[3]
2.82-1.43-1.39
RMS偏差
钥匙精炼约束偏差
r_二面角_2度34.18
r_二面角_4_deg18.269
r_二面角_3_deg16.814
r_二面角_1_deg6.689
r_m角度_ it3.864
r_sc债券3.236
r_mcbond_it2.584
r_mcbond_其他2.583
角度_角度_角度1.697
r_角度_其他_deg0.866
RMS偏差
钥匙精炼约束偏差
r_二面角_2度34.18
r_二面角_4_deg18.269
r_二面角_3_deg16.814
r_二面角_1_deg6.689
r_m角度_ it3.864
r_sc债券3.236
r_mcbond_it2.584
r_mcbond_其他2.583
r_角度_细化_度1.697
r_角度_其他_deg0.866
r_手性0.091
r_bond_refined_d债券0.014
r_gen_planes_已定义0.008
r生成_计划_其他0.005
r_债券_其他_d0.001
r_nbd精炼
r_nb_其他
r_n或已定义
r_n或_其他
r_xyhbond_nbd_re已定义
r_xyhbond_nbd_其他
r_metal_ion已定义
_金属_其他
r_symmetry_vdw_已定义
r_对称_vdw_其他
r_symmetry_hbond_refined
r_symmetry_hbond_other(对称_绑定_其他)
r_symetry_金属_离子_定义
r_对称金属离子_其他
r_mcangle_其他
r_scbond_其他
r_scangle_it(扫描角度)
r_scangle_other(扫描角度_其他)
r_long_range_B_refined
r_long_range_B_其他
r_刚性结合
r_球形_自由
r_球形_粘结
精炼中使用的非氢原子
非氢原子编号
蛋白质原子6452
核酸原子
溶剂原子173
异质原子187

软件

软件
软件名称目的
雷夫马克精炼
XDS公司数据缩减
SCALA公司数据缩放
雷夫马克阶段划分