警告
您正在使用我们不支持的web浏览器。
我们的网站将无法正常工作。
请更新到新版本或下载新的web浏览器,如Chrome或Firefox。
联系我们
切换导航
RCSB PDB公司
保证金
准备数据
PDBx/mmCIF文件
pdb提取物
SF-工具
利兰博览会
MAXIT系列
验证数据
验证服务器
验证API
日记账信息
验证工作组
存款数据
wwPDB OneDep系统
PDB-开发
帮助和资源
存款常见问题
验证常见问题解答
教程
批注策略
处理程序
PDBx/mmCIF字典
化学成分词典
生物有趣分子参考词典(BIRD)
BioSync/Beamlines/设施
相关工具
搜索
高级搜索
序列相似性搜索
结构相似性搜索
化学相似性搜索
化学素描工具
按注释浏览
新条目
未发布条目
PDB统计
可视化
Mol*(MolStar)
序列注释查看器
基因组视图
分析
成对结构对齐
PDB中的对称资源
结构质量
分组结构
PDB引文MeSH网络浏览器
PDB统计
EPPIC生物组件
外部数据和资源
综合资源
额外资源
下载
坐标和实验数据
序列
配体
文件下载服务
Web服务
学习
培训课程
PDB数据指南
本月最佳分子
教育资源
课程设置
浏览
新闻
科学艺术画廊
欧文·盖斯
大卫·古德塞尔
关于
联系我们
关于RCSB PDB
愿景和使命
引文、使用、隐私政策、徽标
新闻
PDB历史
PDB50型
用户社区
出版物
RCSB PDB咨询委员会
团队成员
多样性、公平性、包容性和准入
服务状态
文件
常规帮助
蛋白质数据库中的3D结构
计算结构模型(CSM)
搜索和浏览
基本搜索
高级搜索
浏览批注
可视化和分析
序列查看器
成对结构对齐
探索三维结构
分组结构
编程访问
额外资源
软件支持人员
沉积资源
常见问题解答
词汇表
职业
新冠肺炎
219,869
来自PDB的结构
1,068,577
计算结构模型(CSM)
导航选项卡
结构概要
结构
注释
实验
顺序
基因组
配体
版本
显示文件
FASTA序列
mmCIF格式
mmCIF格式(标题)
PDB格式
PDB格式(标题)
下载文件
FASTA序列
PDBx/mmCIF格式
PDBx/mmCIF格式(gz)
二进制CIF格式(gz)
PDB格式
PDB格式(gz)
PDBML/XML格式(gz)
结构系数(CIF)
结构系数(CIF-gz)
验证完整PDF
验证(XML-gz)
生物组件1(CIF-gz)
生物组件1(PDB-gz)
fo-fc地图(DSN6)
2fo-fc地图(DSN6)
映射系数(MTZ格式)
数据API
4D34型
牛内皮型一氧化氮合酶血红素结构域与2-(2-(1H-咪唑-1-基)嘧啶-4-基)-N-(3-氟苯乙基)乙醇-1-胺配合物的结构
X射线衍射
结晶
结晶实验
身份证件
方法
酸碱度
温度
详细信息
1
6
20-22%PEG3350,0.1 M碳酸酯,150-200 MM MG醋酸盐,5 MM TCEP,pH 6.0
晶体特性
马修斯系数
溶剂含量
2.5
50.7
Crystal数据
单位单元格
长度(Ω)
角度(˚)
a=58.159
α = 90
b=106.632
β = 90
c=156.638
γ = 90
对称
空间组
电话21 21 21
衍射
衍射实验
ID编号#
水晶ID
散射类型
数据采集温度
探测器
探测器类型
详细信息
收款日期
单色仪
协议
1
1
x射线
100
像素
DECTRIS PILATUS公司
镜子
2013-12-01
M(M)
单波长
辐射源
ID编号#
来源
类型
波长列表
同步加速器站点
光束线
1
同步加速器
SSRL梁线BL11-1
SSRL公司
BL11-1型
数据收集
总体
ID编号#
分辨率(高)
分辨率(低)
可能百分比(观察)
R合并I(观察)
净I高于平均Sigma(I)
冗余
反射数(全部)
反射次数(观察)
观察标准Sigma(F)
观察标准西格玛(I)
B(各向同性)来自Wilson图
1
2.25
50
99.6
0.09
14
5.8
47016
-3个
最高分辨率外壳
ID编号#
分辨率(高)
分辨率(低)
可能百分比(全部)
可能百分比(观察)
R合并I(观察)
Sigma上的平均值I(观察值)
冗余
唯一反射数(全部)
1
2.25
2.37
98.7
1.5
0.8
5.5
精炼
统计
衍射ID
结构求解方法
交叉验证方法
分辨率(高)
分辨率(低)
反射次数(观察)
反射次数(R-Free)
反射百分比(观察)
R系数(观察值)
R工作
R自由
R-Free选择细节
平均各向同性B
X射线衍射
分子替换
贯穿始终
2.25
40
44238
2320
98.77
0.17851
0.1758
0.23061
随机
55.811
温度因素建模
各向异性B[1]
各向异性B[1][2]
各向异性B[1][3]
各向异性B[2]
各向异性B[2][3]
各向异性B[3]
2.82
-1.43
-1.39
RMS偏差
钥匙
精炼约束偏差
r_二面角_2度
34.18
r_二面角_4_deg
18.269
r_二面角_3_deg
16.814
r_二面角_1_deg
6.689
r_m角度_ it
3.864
r_sc债券
3.236
r_mcbond_it
2.584
r_mcbond_其他
2.583
角度_角度_角度
1.697
r_角度_其他_deg
0.866
显示所有键
RMS偏差
钥匙
精炼约束偏差
r_二面角_2度
34.18
r_二面角_4_deg
18.269
r_二面角_3_deg
16.814
r_二面角_1_deg
6.689
r_m角度_ it
3.864
r_sc债券
3.236
r_mcbond_it
2.584
r_mcbond_其他
2.583
r_角度_细化_度
1.697
r_角度_其他_deg
0.866
r_手性
0.091
r_bond_refined_d债券
0.014
r_gen_planes_已定义
0.008
r生成_计划_其他
0.005
r_债券_其他_d
0.001
r_nbd精炼
r_nb_其他
r_n或已定义
r_n或_其他
r_xyhbond_nbd_re已定义
r_xyhbond_nbd_其他
r_metal_ion已定义
_金属_其他
r_symmetry_vdw_已定义
r_对称_vdw_其他
r_symmetry_hbond_refined
r_symmetry_hbond_other(对称_绑定_其他)
r_symetry_金属_离子_定义
r_对称金属离子_其他
r_mcangle_其他
r_scbond_其他
r_scangle_it(扫描角度)
r_scangle_other(扫描角度_其他)
r_long_range_B_refined
r_long_range_B_其他
r_刚性结合
r_球形_自由
r_球形_粘结
隐藏所有关键点
精炼中使用的非氢原子
非氢原子
编号
蛋白质原子
6452
核酸原子
溶剂原子
173
异质原子
187
软件
软件
软件名称
目的
雷夫马克
精炼
XDS公司
数据缩减
SCALA公司
数据缩放
雷夫马克
阶段划分
关于
关于我们
引用我们
出版物
团队
职业
使用和隐私
帮助
联系我们
文档
网站常见问题
词汇表
服务状态
RCSB PDB公司(
引用
)由托管
RCSB PDB是
RCSB合作伙伴
核酸知识库
wwPDB合作伙伴
RCSB PDB公司
PDBe公司
PDBj公司
BMRB公司
EMDB公司