这是一个列表假单胞菌属可以在中找到注释和序列的菌株这个假单胞菌属基因组数据库。有关正在进行的更全面的列表基因组测序、转录组和表观基因组项目基于NCBI生物项目数据库中注册的内容,请查看我们的可搜索、用户友好的的列表生物项目.

默认情况下,具有完整基因组序列的菌株并显示基因组草图,但您可以筛选列表通过使用以下广泛的标准。我们计划扩张基因组测序的搜索功能增长和元数据标准成熟。

可用时,菌株具有MLST序列类型。它们目前基于PubMLST网站上的方案(网址:https://pubmlst.org/)由Keith Jolley开发(Jolley&Maiden 2010,BMC生物信息学,11:595)由Torsten Seemann(Github)开发的“mlst”软件预测https://github.com/tseemann/mlst).

14230返回的菌株

=流行菌株(按流行菌株首先,然后通过菌株名称,上升的)
应变 装配 轮廓 程序集级别 基因(部分) 生物样本获取 宿主生物 宿主疾病 隔离源 位置 MLST公司 机构
铜绿假单胞菌PAO1(Stover等人,2000) GCF_ 000006765.1
最新的
- 完整基因组 5688 (0) SAMN02603714标准 人类 伤口 澳大利亚:墨尔本 549(小儿麻痹症) PathoGenesis公司
应变详细信息
铜绿假单胞菌UCBPP-PA14(Lee等人,2006) GCF_000014625.1号
最新的
- 完整基因组 5977 (0) SAMN02603591号 人类 燃烧 烧伤 253(小儿麻痹症) 马萨诸塞州总医院
应变详细信息
铜绿假单胞菌PA7 GCF_000017205.1号
最新的
- 完整基因组 6369 (0) SAMN02603435标准 人类 非呼吸道临床分离物 阿根廷 1195(小儿麻痹症)
J.Craig Venter研究所
应变详细信息
铜绿假单胞菌PAK(Cain等人,2019)-组装GCF_902172305.2 GCF_902172305.2
最新的
- 完整基因组 5848 (26) 萨摩亚1695737 人类 693(小儿麻痹症) 欧洲生物信息研究所
联合国安全理事会
应变详细信息
铜绿假单胞菌PAK-组装GCF_000568855.2 GCF_000568855.2
最新的
- 完整基因组 5564 (96) SAMN02483603标准 人类 693(小儿麻痹症) 德克萨斯大学奥斯汀分校
应变详细信息
恶臭假单胞菌KT2440(TIGR) GCF_ 000007565.2
最新的
- 完整基因组 5729 (0) SAMN02603999标准 土壤 69(pputida)
钨极氩弧焊
应变详细信息
丁香假单胞菌。番茄DC3000(Buell等人,2003) GCF_ 000007805.1
最新的
- 完整基因组 5842 (0) SAMN02604017标准 番茄 细菌斑点
钨极氩弧焊
应变详细信息
铜绿假单胞菌CF39S 合同通用条款011466835.1
最新的
- 完整基因组 6780 (52) 第13226654页 人类 囊性纤维化 美国:华盛顿州西雅图 175(小儿麻痹症) 卡尔加里大学
应变详细信息
荧光假单胞菌SBW25 GCF_ 000009225.2
最新的
- 完整基因组 6106 (5) 萨摩亚2272316 甜菜 甜菜叶 英国:牛津郡 NERC病毒学和微生物生态学研究所,
威康信托桑格研究所
应变详细信息
savastanoi假单胞菌。phaseolicola 1448A型 GCF_000012205.1号
最新的
- 完整基因组 5437 (0) SAMN02603162号 芸豆 光晕病
康奈尔大学
应变详细信息
斯氏假单胞菌A1501 GCF_000013785.1
最新的
- 完整基因组 4209 (0) SAMN02603910标准 土壤、水稻根 中国
中国农业科学院生物技术研究所
应变详细信息
铜绿假单胞菌LESB58 GCF_000026645.1号
最新的
- 无间隙染色体 6028 (0) 相同17051916 人类 囊性纤维化 痰液 英国:利物浦 146(小儿麻痹症)
惠康信托桑格研究所
应变详细信息
假单胞菌蛋白酶Pf-5 GCF_000012265.1号
最新的
- 完整基因组 6273 (0) SAMN02604012标准 土壤 美国:德克萨斯州
钨极氩弧焊
应变详细信息
麻风假单胞菌ATCC 700689 GCF_900100795.1
最新的
54 康蒂格 6535 (107) SAMN05216605号 丢失的 丢失的 美国能源部联合基因组研究所
应变详细信息
麻风假单胞菌KF701 GCF_000974525.1
最新的
140 康蒂格 6154 (98) SAMD00023455标准 日本:北九州 AIST生物生产研究所微生物和遗传资源研究小组
国家先进工业科学技术研究所(AIST)
应变详细信息
麻风假单胞菌KF717 GCF_000876035.1号
最新的
97 康蒂格 6158 (114) SAMD00023465标准 日本:北九州 AIST生物生产研究所微生物和遗传资源研究小组
国家先进工业科学技术研究所(AIST)
应变详细信息
深海假单胞菌MT5 GCF_002307495.1号
最新的
79 康蒂格 3975 (81) SAMN07634961号 深海水域 上海海洋大学
应变详细信息
嗜酸假单胞菌ATCC 31363 GCF_002362315.1号
最新的
11 康蒂格 6173(78) SAMN06246902号 土壤 圣母大学
应变详细信息
绿脓杆菌MAFF 301350 GCF_019168305.1
最新的
- 康蒂格 5084 (277) SAMN19959866号 日本:福冈 国家农业和食品研究组织(NARO)
应变详细信息
铜绿假单胞菌#700 GCF_030688825.1号
最新的
- 康蒂格 6779 (64) SAMN36630189号 非囊性纤维化 痰液 中国 235(小儿麻痹症) 浙江大学附属第二医院
应变详细信息