铜绿假单胞菌CF39S公司

应变概述
生物体名称 铜绿假单胞菌CF39S
物种 铜绿假单胞菌
应变 CF39S公司
描述/标题
注释基因 6780
部分基因 52
主机信息
宿主物种分类名称 智人
宿主物种通用名称 人类
宿主物种分类ID 9606
宿主物种疾病 囊性纤维化
地理位置
位置名称 美国：华盛顿州西雅图
隔离源 肺
纬度/经度 47.608013 N 122.335167宽
示例提供程序
姓名 简·伯恩斯
电子邮件 henrik.almblad@ucalgary.ca公司
机构 卡尔加里大学
收集日期 1993-03/1996-04

MLST数据

数据库 方案 序列类型 等位基因
公共MLST 小儿麻痹症 175
第二版A
14		 数字
三		 acsA公司
28		 aroE公司
22		 mutL公司
三		 邻氨基苯甲酸合成酶
19		 瓜阿
5
可用时，菌株具有MLST序列类型。它们目前基于PubMLST网站上的方案(网址：https://pubmlst.org/)由Keith Jolley（Jolley&Maiden 2010，BMC生物信息学，11:595）开发，由Torsten Seemann（Github）开发的“mlst”软件预测https://github.com/tseemann/mlst).
装配
组件数据库
参考序列
程序集访问
合同通用条款011466835.1
程序集状态 最新的
脚手架
轮廓
康蒂格N50
程序集级别 完整基因组
GC百分比
交叉引用
NCBI生物样本获取 第13226654页
NCBI分类ID 287
NCBI生物项目
相关数据
其他基因组项目信息
排序信息
基因组组装信息
细节
基因组浏览器*
铜绿假单胞菌CF39S株染色体，全基因组
铜绿假单胞菌CF39S菌株质粒pCF39S，完整序列

带注释的要素

功能 计数
基因 6780
客户尽职调查 6708
伪 83
tRNA 63
rRNA 12
非编码RNA 三
tmRNA 1

答复者

姓名 长度 GC公司
铜绿假单胞菌CF39S株染色体，全基因组 6797918基点 66.2%
Replicon详细信息
铜绿假单胞菌CF39S菌株质粒pCF39S，完整序列 468631基点 56.6%
复制副本详细信息

下载序列

基因组学 ORF DNA 基因间的 氨基酸

下载基因注释

TSV公司 CSV公司 GBK公司 欧洲工商管理学院 GFF3型 GFF3+序列 全球贸易基金