甲状腺癌蛋白质组
甲状腺癌相当常见。不同人群的年发病率在0.5-10‰之间，女性的发病率是男性的2-4倍。甲状腺癌最常见的形式是乳头状癌（70-80%），其次是滤泡状癌（10-20%）、髓样癌（5-10%）和间变性癌（2-10%）。根据WHO，甲状腺癌的分类取决于组织学特征。甲状腺肿瘤也可以根据侵袭性分为低度恶性、中度恶性和高度恶性。
甲状腺癌预后良好，乳头状癌的10年相对生存率约为98%。除了年龄外，年轻患者的预后要好得多，原发肿瘤的大小和肿瘤分期是最重要的预后因素。
尽管免疫组织化学在表现出异常形态特征的肿瘤中起着重要作用，但对于大多数甲状腺肿瘤，仅通过显微镜检查即可确定诊断。
在这里，我们使用TCGA转录组学数据和基于抗体的蛋白质数据来探索甲状腺癌蛋白质组。根据501例患者的转录组数据，345个基因被认为是预后基因；185基因与不良预后和160基因与预后良好有关。
TCGA数据分析
在这项元数据研究中，我们使用了来自TCGA的数据，其中转录组学数据来自501名甲状腺癌患者。总数据集包括366名女性和135名男性。在收集数据时，大多数患者（485名患者）仍然活着。分期分布为阶段i）281名患者，阶段ii）52名患者，步骤iii）111名患者，时段iv）55名患者和2名缺失分期信息的患者。
甲状腺癌的不良预后基因
对于不利基因，诊断时较高的相对表达水平会显著降低患者的总体生存率。有185甲状腺癌预后不良相关基因。在表1中，列出了与不良预后相关的前20个最重要的基因。
LARS是一个与甲状腺癌不良预后相关的基因最佳分离是通过12.8 fpkm的表达截止值实现的，该值将患者分为两组，高表达患者的5年生存率为79%，低表达患者的生存率为98%，p值：2.98e-4。使用抗体靶向的免疫组织化学染色LARS1号机组（HPA036424）显示甲状腺癌样本中的差异表达模式。
p<0.001
LARS1号机组-生存分析
LARS1号机组-高表达
LARS1号机组-低表达
表1。这20个最显著的基因与甲状腺癌的不良预后相关。
甲状腺癌的有利预后基因
对于有利基因，诊断时较高的相对表达水平可显著提高患者的总体生存率。有160与甲状腺癌预后良好相关的基因。在表2中，列出了与良好预后相关的前20个最重要的基因。
VAMP8是一个与甲状腺癌预后良好相关的基因最佳分离是通过118.0 fpkm的表达截止值实现的，该值将患者分为两组，高表达患者的5年生存率为98%，低表达患者为66%，p值为8.07e-9。使用抗体靶向的免疫组织化学染色VAMP8型（HPA006882）显示甲状腺癌样本中的差异表达模式。
p<0.001
VAMP8型-生存分析
VAMP8型-高表达
VAMP8型-低表达
表2。这20个最显著的基因与甲状腺癌的良好预后相关。
甲状腺癌转录组
转录组分析显示68%（n=13798)所有人类基因中（n=20162) 在甲状腺癌中表达。根据甲状腺癌中mRNA水平与其他16个分析过的癌组织中mRNA含量的比值，根据甲状腺癌特异性表达将所有基因分为五个不同类别之一。
图1。基于甲状腺癌以及所有其他癌症组织中转录物丰度，所有基因在五类中的分布。
289与其他癌症相比，甲状腺癌中的基因表达水平有所提高（图1）。如表3所示，提升类别进一步细分为三个类别。
表3。甲状腺癌高表达细分类别中的基因数量。
其他信息
乳头状甲状腺癌是一种恶性上皮性肿瘤。显微镜下肿瘤显示滤泡细胞分化的证据，典型的是乳头状和滤泡结构以及肿瘤细胞核的特征性变化。准确诊断的关键是核特征，包括毛玻璃外观、大尺寸、苍白染色、轮廓不规则、深凹槽和假包涵体。乳头状甲状腺癌是一种惰性肿瘤，尽管有局部侵袭和向区域淋巴结转移的倾向，但长期预后良好。远处转移并不常见。
滤泡癌表现为滤泡分化，但缺乏乳头状癌的诊断特征。地方性甲状腺肿地区滤泡癌的发病率较高，碘缺乏似乎是主要的危险因素。与乳头状癌相比，转移扩散的主要方式是血行性而不是通过淋巴系统。滤泡癌通常由纤维囊包围紧密包裹的滤泡、小梁或肿瘤细胞的固体薄片来分隔。肿瘤细胞通常呈长方体，细胞核呈深色或苍白染色，核仁不明显。少数滤泡癌可能表现为核多形性。
用于甲状腺肿瘤诊断的抗体包括甲状腺球蛋白（TG）、降钙素（CALCA）和甲状腺转录因子（TTF1）。
相关链接和出版物
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组织学词典-甲状腺癌
