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抗体反应数据。
使用不同的蛋白质表位特征标签（PrEST）作为抗原产生单特异性抗体的12634次免疫接种的结果。结果以免疫和亲和纯化后获得的特异性抗体的数量（mg）表示，使用相同的特异性蛋白片段（PrEST）作为抗原和纯化伙伴。逗号分隔文件包括：抗原id、抗体id、抗原序列和抗体量（mg）。 |
与出版物相关：
Rockberg J，Uhlén M。
用重组人蛋白片段作为抗原预测抗体反应。
蛋白质科学。2009 18(11):2346-55.
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抗体应答.csv.zip
CSV文件，927.7 KB |
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TMA表达数据。
基于免疫组织化学的蛋白质表达谱组织微阵列。逗号分隔的文件包含抗体标识符（hpa_id），集合基因标识符（Ensembl_gene_id），组织名称，强度，分数和摘要表达式值。数据基于人类蛋白质图谱版本4.1和Ensembl版本54.36。 |
与出版物相关：
Pontén F、Gry M、Fagerberg L、Lundberg E、Asplund A、Berglund L、Oksvold P、Björling E、Hober S、Kampf C、Navani S、Nilsson P、Ottosson J、Persson A、Wernérus H、Wester K、Uhlén M。
人类细胞、组织和器官中蛋白质表达的全局视图。
分子系统生物学。2009年5月37日。
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expression_data（表达式数据）。TMA.csv.zip文件
CSV文件，1.7 MB |
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CMA表达数据。
基于免疫组织化学的蛋白质表达谱细胞微阵列。逗号分隔的文件包含抗体标识符（hpa_id），集合基因标识符（Ensembl_gene_id），细胞系名称（celline）和该细胞系中的摘要表达式值（summary_expression_value）。数据基于人类蛋白质图谱版本4.1和Ensembl版本54.36。 |
与出版物相关：
Pontén F、Gry M、Fagerberg L、Lundberg E、Asplund A、Berglund L、Oksvold P、Björling E、Hober S、Kampf C、Navani S、Nilsson P、Ottosson J、Persson A、Wernérus H、Wester K、Uhlén M。
人类细胞、组织和器官中蛋白质表达的全局视图。
分子系统生物学。2009年5月37日。
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expression_data（表达式数据）。CMA.csv.zip文件
CSV文件，892.2 KB |
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IF表达式数据。
基于免疫荧光染色细胞的蛋白质表达谱。逗号分隔的文件包含抗体标识符（hpa_id），集合基因标识符（Ensembl_gene_id），细胞系名称（celline）和该细胞系中的摘要表达式值（summary_expression_value）。数据基于人类蛋白质图谱版本4.1和Ensembl版本54.36。 |
与出版物相关：
Pontén F、Gry M、Fagerberg L、Lundberg E、Asplund A、Berglund L、Oksvold P、Björling E、Hober S、Kampf C、Navani S、Nilsson P、Ottosson J、Persson A、Wernérus H、Wester K、Uhlén M。
人类细胞、组织和器官中蛋白质表达的全局视图。
分子系统生物学。2009年5月37日。
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expression_data（表达式数据）。IF.csv.zip文件
CSV文件，32.5 KB |
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RNA亚型数据
基于RNA-seq的32个组织中的RNA水平。标签分隔的文件包括集合基因标识符（“基因”）、集合转录标识符（“转录本”）、分析样本（“样本”）和每千基转录本每百万个映射片段的片段数（“FPKM”）。数据基于人类蛋白质图谱版本13和Ensembl版本75.37。 |
与出版物相关：
Uhlén M、Fagerberg L、HallströM BM、Lindskog C、Oksvold P、Mardinoglu A、Sivertsson奥、Kampf C、Sjöstedt E、Asplund A、Olsson I、Edlund K、Lundberg E、Navani S、Szigyarto CA、Odeberg J、Djureinovic D、Takanen JO、Hober S、Alm T、Edqvist PH、Berling H、Tegel H、Mulder J、Rockberg J，Nilsson P、Schwenk JM、Hamsten M、von Feilitzen K、Forsberg M、，Persson L、Johansson F、Zwahlen M、von Heijne G、Nielsen J、Pontén F。
基于组织的人类蛋白质组图谱。
科学类2015 347(6220):1260419.
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rna_抄送.tsv.gz
TSV文件，56.3 MB |
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综合相关网络。
综合多组学相关网络，包括临床化学、蛋白质组学、转录组学、脂质组学、代谢组学、免疫细胞术、自身抗体以及肠道微生物群组成。标签分隔的txt文件包括：节点ID、rho-spearman相关性和调整后的p值。 |
与出版物相关：
Tebani A、Gummesson A、Zhong W、Koistinen IS、Lakshmikanth T、Olsson LM、Boulund F、Neiman M、Stenlund H、HellströM C、Karlsson MJ、Arif M、Dodig-CrnkovićT、Mardinoglu A、Lee S、Zhang C、Chen Y、Olin A、Mikes J、Danielsson H、von Feilitzen K、Jansson PA、AngeróS O、Huss M、Kjellqvist S、Odeberg J、Edfors F、Tremaroli V、Forsstr M B、，Schwenk JM、Nilsson P、Moritz T、Bäckhed F、Engstrand L、Brodin P、Bergström G、Uhlen m、Fagerberg L。
在纵向健康状况分析队列中整合分子特征。
国家公社。2020 11(1):4487.
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scapeis_wellness_correlation_network_all_data.txt.gz
TSV文件，725.8 MB |
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用于scRNA-seq的FUCCI U-2 OS细胞的FACS分类
为了准备细胞周期不同阶段的scRNA-seq，FACS使用BD流入系统（BD Biosciences，San Jose，CA）将总共1152个细胞分为三个384孔板。利用前向散射宽度靶向单个细胞。根据GFP标记的GMNN（530 nm）和RFP标记的CDT1（585 nm）的荧光强度，在G1（红色）、S（黄色）和G2（绿色）阶段选择大约相等数量的细胞。逗号分隔的文件包括每个孔中GFP标记的GMNN（530/40[488]）和RFP标记的CDT1（585/29[561]）的记录平均荧光强度，以及细胞周期G1、S（S-ph）或G2/M（G2M）相中以及单重细胞（singlet cells）中物体的识别。
FUCCI U-2操作系统的scRNA-seq
FACS共对1152个U2OS FUCCI细胞进行分类，并在Illumina HiSeq 2000测序仪上使用SMART-seq2提取和文库制备协议收集每个细胞的RNA-Seq。包含725次读取的FASTQ文件可在GEO上访问GSE146773. |
与出版物相关：
Mahdessian D、Cesnik AJ、Gnann C、Danielsson F、Stenström L、Arif m、Zhang C、Le T、Johansson F，Shutten R、Bäckström A、Axelsson U、Thul P、Cho NH、Carja O、Uhlén m、Mardinoglu A、Stadler C、Lindskog C、Ayoglu B、Leonetti MD、Pontén F、Sullivan DP、Lundberg E。
单细胞蛋白基因组学对细胞周期的时空解剖。
自然。2021 590（7847）：649-654。
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pubmed33627808_FUCCI-FACS-data.zip
CSV文件，28.4 KB |
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