美国国旗

美国政府的官方网站

格式

发送至：

选择目的地
    • 显示当前项目。

    镁4aα-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A[褐家鼠（挪威鼠）]

    基因ID:367252，更新于2024年4月13日

    总结

    转到页面顶部 帮助
    官方符号
    镁4a由提供RGD公司
    官方全名
    α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A由提供RGD公司
    主要来源
    RGD:1305650号
    请参阅相关
    乐团：ENSRNOG00000018276 联盟基因组：RGD:1305650
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已验证
    有机体
    褐家鼠
    血统
    真核生物；后生动物；脊索动物；克兰亚塔；脊椎动物；真造口术；哺乳动物；Eutheria；尤阿古托格利尔斯；闪光；啮齿动物；变形肌；蘑菇总科；鼠科；穆里奈；大鼠
    总结
    预计可激活乙酰氨基葡萄糖转移酶活性。预计参与蛋白质N-连接糖基化。预计位于高尔基体膜和细胞外区域。预计为膜的组成部分。预计在高尔基球堆栈中活跃；内质网；和内质网-高尔基体中间室。与人MGAT4A同源（α-1,3-甘露糖基-糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A）。【由基因组资源联盟提供，2022年4月】
    表达式
    胸腺（RPKM 166.4）、肾脏（RPKM105.7）和9个其他组织中的偏倚表达查看更多
    直系同源
    人类 鼠标 全部的
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    转到页面顶部 帮助
    位置：
    第9季度21
    外显子计数：
    19
    注释发布 状态 装配 氯代甲烷 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCr8级(GCF_036323735.1号) 9 NC_086027.1（47169229..47282577，补码）
    RS_2023_06号 上一个程序集 额定BN7.2(GCF_015227675.2号) 9 NC_051344.1（39673427..39786747，补码）
    106 上一个程序集 雷诺_6.0(GCF_ 000001895.5) 9 NC_005108.4（44033433..44126946，补体）

    9号染色体-NC_086027.1描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene inositol polyphosphate-4-phosphatase type I A Neighboring gene uncharacterized LOC120094669 Neighboring gene cytochrome C oxidase assembly factor 5 Neighboring gene unc-50 inner nuclear membrane RNA binding protein Neighboring gene CRACD like Neighboring gene uncharacterized LOC134480567 Neighboring gene U2 spliceosomal RNA

    基因组区域、转录物和产物

    转到页面顶部 帮助

    表达式

    转到页面顶部 帮助
    • 项目名称：跨越11个器官和4个发育阶段的大鼠RNA-Seq转录体BodyMap
    • 描述：从Fischer 344大鼠的11个器官（肾上腺、大脑、心脏、肾脏、肝脏、肺、肌肉、脾脏、胸腺和睾丸或子宫）中分离出320个RNA样本，这些器官来自四个发育阶段（2周、6周、21周和104周龄）的两性
    • 生物项目：项目编号：238328
    • 出版物：PMID 24510058
    • 分析日期：2016年6月6日星期一17:44:12

    参考文献

    转到页面顶部帮助

    PubMed中的相关文章

    1. 胰腺癌中N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IVa和IVb（GnT-IVa和b）的异常表达。 Ide Y、，等生物化学与生物物理研究委员会，2006年3月10日。PMID 16434023号
    2. N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IVa和-IVb双缺陷小鼠的生理和糖学特征。 高松S，等.糖生物学，2010年1月PMID 20015870，免费PMC文章
    3. 核心岩藻糖的缺失上调GnT-III和Wnt靶基因：聚糖功能适应性反应的可能机制。 栗本A，等生物化学杂志，2014年4月25日。PMID 24619415，免费PMC文章
    4. 利用多维蛋白质鉴定技术（MudPIT）对人腮腺外泌体进行蛋白质组学分析。 Gonzalez-Begne M，等《蛋白质组研究杂志》，2009年3月，PMID 19199708，免费PMC文章
    5. 归一化和减法：促进基因发现的两种方法。 博纳尔多MF，等《基因组研究》，1996年9月，PMID 8889548

    查看PubMed中的所有（7）引文

    GeneRIFs：功能的基因引用

    一般基因信息

    转到页面顶部 帮助

    标记

    同源性

    基因本体论 RGD提供

    功能 证据代码 酒吧
    激活乙酰氨基葡萄糖转移酶活性 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    激活乙酰氨基葡萄糖转移酶活性 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  
    使丙氨酸-谷氨酸转氨酶活性 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
    		  
    激活α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶活性 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  
    激活α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶活性 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
    		  
    激活糖基转移酶活性 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  
    启用金属离子绑定 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    实现蛋白质同二聚体活性 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
    		  
    过程 证据代码 酒吧
    参与N-聚糖加工 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  
    参与N-聚糖加工 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
    		  
    涉及生物过程 ND（无损检测）
    无可用生物数据
    更多信息
    		  
    参与乙醛酸代谢过程 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
    		  
    involved_in蛋白N-连接糖基化 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    acts_upstream_of_or_in蛋白质N-连接糖基化 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  
    参与蛋白质糖基化 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    		  
    组件 证据代码 酒吧
    位于高尔基膜内 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    高尔基球堆栈中的is_active 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    内质网内is_active 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    内质网高尔基体中间室is_active 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    位于细胞外区域 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    定位膜 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    定位于过氧化物酶体 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
    		  

    一般蛋白质信息

    转到页面顶部 帮助
    首选名称
    α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A
    姓名
    N-乙酰氨基葡萄糖转移酶IVa
    N-糖基-低聚糖-糖蛋白N-乙酰氨基葡萄糖转移酶IVa
    UDP-N-乙酰氨基葡萄糖：α-1,3-D-甘露醇β-1,4-N-乙酰氨基葡萄糖苷转移酶IVa
    glcNAc-T IVa公司
    gnT-IVa
    甘露糖苷乙酰氨基葡萄糖转移酶4，同工酶A
    甘露糖基（α-1,3-）糖蛋白β-1,4-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶，同工酶A
    NP_001012225.1号
    NP_001153627.1号
    XP_006244902.1号
    XP_017452062.1型
    XP_038939898.1号
    XP_038939899.1号
    XP_063123578.1号
    XP_063123579.1号

    NCBI参考序列（RefSeq）

    转到页面顶部 帮助

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环，因此它们的版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来识别版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域，成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_001012225.2→NP_001012225.1号α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型2

      参见NP_001012225.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态：已验证

      描述
      转录变体：与变体1相比，该变体（2）在5'编码区中使用了一个替代的帧内拼接位点。与亚型1相比，生成的亚型（2）缺少内部10-aa片段。
      源序列
      BC088215、BM388934、JAXUCZ010000009
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      第5季度854
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A6INH4型
      相关的
      ENSRNOP00000095476.1公司,ENSRNOT00000097529.1号
      保守领域（1）总结
      pfam04666型
      位置：94→371
      糖转运蛋白_54；N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV（GnT-IV）保守区

    2. NM_001160155.1→NP_001153627.1号α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型1

      状态：已验证

      描述
      转录变体：该变体（1）代表较长的转录，编码较长的亚型（1）。
      源序列
      BC088215、BM388934、CV115746、JAXUCZ010000009
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A6INH4型,F1LMP1型
      相关的
      ENSRNOP00000024701.5,ENSRNOT00000024701.7号
      保守领域（2）总结
      pfam04666型
      位置：103→380
      糖转运蛋白_54；N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV（GnT-IV）保守区
      cd21105
      位置：287→302
      类PGAP4；推测TM2螺旋[结构基序]

    注释基因组的参考序列：GCF_036323735.1-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定的基因组构建。解释

    参考GRCr8

    基因组学

    1. NC_086027.1参考GRCr8

      范围
      47169229..47282577补码
      下载
      GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）

    mRNA和蛋白质

    1. XM_063267508.1号→XP_063123578.1号α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X3

      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      Q5M854型

    2. XM_063267509.1号→电话：0663123579.1α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X4

    3. XM_039083970.2→XP_038939898.1号α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X1

      UniProtKB/TrEMBL公司
      A6INH4型,F1LMP1型
      保守领域（2）总结
      pfam04666型
      位置：103→380
      糖转运蛋白_54；N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV（GnT-IV）保守区
      镉1105
      位置：287→302
      类PGAP4；推测TM2螺旋[结构基序]

    4. XM_006244840.4号→XP_006244902.1号α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X2

      UniProtKB/TrEMBL公司
      A6INH4型
      保守领域（1）总结
      pfam04666型
      位置：103→380
      糖转运蛋白_54；N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV（GnT-IV）保守区

    5. XM_017596573.3号→XP_017452062.1型α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X1

      UniProtKB/TrEMBL公司
      A6INH4型,F1LMP1型
      保守领域（2）总结
      pfam04666型
      位置：103→380
      糖转运蛋白_54；N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV（GnT-IV）保守区
      cd21105
      位置：287→302
      类PGAP4；推测TM2螺旋[结构基序]

    6. XM_039083971.2→XP_038939899.1号α-1,3-甘露糖基糖蛋白4-β-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶A亚型X1

      UniProtKB/TrEMBL公司
      A6INH4型,F1LMP1型
      保守领域（2）总结
      pfam04666型
      位置：103→380
      糖转运蛋白_54；N-乙酰氨基葡萄糖转移酶-IV（GnT-IV）保守区
      cd21105
      位置：287→302
      类PGAP4；推测TM2螺旋[结构基序]
    核苷酸 蛋白质 应变
    标题 访问和版本
    蛋白质接入 链接
    GenPept链接 UniProtKB链接
    Q5M854.1问题 GenPept公司 UniProtKB/Swiss-Prot:Q5M854

    基因链接

    以下内容链接输出资源由外部提供者提供。这些提供者负责维护链接。

    化学信息
    分子生物学数据库
    研究材料
    工具
    其他