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    Nfkb2号核因子κB亚基2[褐家鼠(挪威鼠)]

    基因ID:309452,更新日期2024年4月11日

    总结

    官方符号
    Nfkb2号由提供RGD公司
    官方全名
    核因子κB亚基2由提供RGD公司
    主要来源
    RGD:1307189号
    请参阅相关
    乐团:ENSRNOG00000019311 联盟基因组:RGD:1307189
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    临时的
    有机体
    褐家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;大鼠
    也称为
    RGD1307189号
    总结
    预测可启用DNA-结合转录激活物活性、RNA聚合酶II特异性和RNA聚合物II顺调控区序列特异性DNA结合活性。涉及老龄化;细胞因子反应;以及对脂多糖的反应。位于细胞质和细胞核中。用于研究帕金森综合征。该基因的人类同源基因与常见变量免疫缺陷有关。与人NFKB2同源(核因子κB亚基2)。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
    表达式
    脾脏(RPKM 124.5)、胸腺(RPKM83.0)和9个其他组织中的偏倚表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    位置:
    第1季度54
    外显子计数:
    23
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCr8级(GCF_036323735.1号) 1 NC_086019.1(255106010..255114649)
    RS_2023_06号 上一个程序集 额定BN7.2(GCF_015227675.2号) 1 NC_051336.1(245164586..245173225)
    106 上一个程序集 雷诺_6.0(GCF_ 000001895.5) 1 NC_005100.4(266050634..266059277)

    染色体1-NC_086019.1描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene ribosomal protein L19, pseudogene 3 Neighboring gene uncharacterized LOC134484075 Neighboring gene pleckstrin and Sec7 domain containing Neighboring gene F-box and leucine-rich repeat protein 15

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:跨越11个器官和4个发育阶段的大鼠RNA-Seq转录体BodyMap
    • 描述:从Fischer 344大鼠的11个器官(肾上腺、大脑、心脏、肾脏、肝脏、肺、肌肉、脾脏、胸腺和睾丸或子宫)中分离出320个RNA样本,这些器官来自于四个发育阶段(2-、6-、21-和104周龄)的雌雄大鼠
    • 生物项目:项目编号:238328
    • 出版物:PMID 24510058
    • 分析日期:2016年6月6日星期一17:44:12

    参考文献

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?
    提交: 新GenerRIF 更正

    PubChem的途径

    一般基因信息

    克隆名称

    • MGC93816型

    基因本体论 RGD提供

    过程 证据代码 酒吧
    参与典型NF-kappaB信号转导 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与典型NF-kappaB信号转导 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞应激反应 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    细胞外基质组织中的acts_upstream_of_或 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts上游或滤泡内树突状细胞分化 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts上游of或在生发中心形成内 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与炎症反应 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与先天性免疫反应 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与非经典NF-κB信号转导 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与非经典NF-κB信号转导 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与RNA聚合酶II对转录的正调控 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与RNA聚合酶II对转录的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与DNA模板转录的调节 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞因子反应 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与细胞因子反应 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    参与脂多糖反应 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    脾脏发育中的上游活动 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    组件 证据代码 酒吧
    Bcl3/NF-kappaB2复合物的一部分 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    细胞质中有活性 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    位于细胞质中 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    定位于胞浆中 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    定位于胞浆中 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    核质定位 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    核质定位 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    在核心中是活动的 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    位于核内 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     

    一般蛋白质信息

    首选名称
    核因子NF-kappa-B p100亚单位
    姓名
    B细胞2,p49/p100中κ轻多肽基因增强子的核因子

    NCBI参考序列(参考序列)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    信使核糖核酸和蛋白质

    1. NM_001008349.1号NP_001008350.1号核因子NF-kappa-B p100亚单位

      参见NP_001008350.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:暂定

      源序列
      BC085800英镑
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A8I6G6F3A6JHL7型A6JHL8型Q5U2Z4型
      相关的
      ENSRNOP00000080319.1号ENSRNOT00000103016.1标准
      保守领域(7)总结
      cd07934
      位置:38221
      RHD-n_NFkB2;核因子κB2的Rel同源结构域(RHD)的N-末端亚结构域
      cd08798
      位置:773847
      死亡_NFkB2_p100;核因子-KappaB2前体蛋白p100的死亡结构域
      cd00204号
      位置:482619
      ANK;锚蛋白重复;锚蛋白重复序列介导多种蛋白质家族中的蛋白质相互作用。蛋白质中ANK重复的数量可以从2个到20个以上(例如,锚蛋白)。ANK重复可能与其他。。。
      cd01177号
      位置:228327
      IPT_NFkappaB;转录因子NFkappaB和相关转录因子的IPT结构域。NFkappaB被认为是应激反应的中央调节器,由不同的应激条件激活,包括身体应激、氧化应激和暴露于。。。
      pfam12796型
      位置:604697
      Ank_2;Ankyrin重复(3份)
      pfam13637型
      位置:487546
      Ank_4;Ankyrin重复(多份)
      sd00045美元
      位置:598629
      ANK;ANK重复[结构图案]

    注释基因组的参考序列:GCF_036323735.1-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定的基因组构建。解释

    参考GRCr8

    基因组学

    1. NC_086019.1参考GRCr8

      范围
      255106010..255114649
      下载
      GenBank(基因银行)美国金融服务贸易协会序列查看器(图形)

    信使核糖核酸和蛋白质

    1. XM_006231503.4号XP_006231565.1号核因子NF-kappa-B p100亚基亚型X1

      参见XP_006231565.1的相同蛋白质及其注释位置

      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A8I6G6F3A6JHL7型A6JHL8型Q5U2Z4型
      相关的
      ENSRNOP00000026235.2公司ENSRNOT00000026235.4号
      保守领域(7)总结
      cd07934
      位置:38221
      RHD-n_NFkB2;核因子κB2的Rel同源结构域(RHD)的N-末端亚结构域
      cd08798
      位置:773847
      死亡_NFkB2_p100;核因子-KappaB2前体蛋白p100的死亡结构域
      cd00204号
      位置:482619
      ANK;锚蛋白重复;锚蛋白重复序列介导多种蛋白质家族中的蛋白质相互作用。蛋白质中ANK重复的数量可以从2个到20个以上(例如,锚蛋白)。ANK重复可能与其他。。。
      cd01177号
      位置:228327
      IPT_NFkappaB;转录因子NFkappaB和相关转录因子的IPT结构域。NFkappaB被认为是应激反应的中央调节器,由不同的应激条件激活,包括身体应激、氧化应激和暴露于。。。
      pfam12796型
      位置:604697
      Ank_2;Ankyrin重复(3份)
      pfam13637型
      位置:487546
      Ank_4;Ankyrin重复(多份)
      sd00045美元
      位置:598629
      ANK;ANK重复[结构图案]