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    Cxcr4号机组C-X-C基序趋化因子受体4[小家鼠(家鼠)]

    基因ID:12767,更新日期2024年4月21日

    摘要

    官方符号
    Cxcr4号机组由提供MGI公司
    官方全名
    C-X-C基序趋化因子受体4由提供MGI公司
    主要来源
    MGI:MGI:109563
    请参阅相关
    乐团:ENSMUSG00000045382 联盟基因组:MGI:109563
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已验证
    有机体
    小家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;弦线;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;变形肌;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
    也称为
    CD184;出租人;Sdf1r;CXC-R4;CXCR-4;Cmkar4;PB-CKR;b2b220Clo;PBSF/SDF-1型
    摘要
    预计可实现多种功能,包括趋化因子受体活性;细胞骨架蛋白结合活性;泛素蛋白连接酶结合活性。参与髓鞘维持;冷诱导产热的正调控;少突胶质细胞分化的正调控。多个过程的上游或内部行为,包括循环系统开发;配子世代;和神经系统发育。位于细胞间连接处;质膜外侧;和生长锥。以多种结构表达,包括消化系统;心血管系统;胚胎间充质;胚外成分;和神经系统。用于研究WHIM综合征。与WHIM综合征相关的该基因的人类同源基因;血液肿瘤(多发);白细胞减少;骨质疏松症;胰腺癌。与人CXCR4同源(C-X-C基序趋化因子受体4)。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
    表达式
    胸腺成体(RPKM 230.6)、脾成体(RTKM 93.9)和10个其他组织中的偏倚表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    位置:
    1 E4;156.43立方厘米
    外显子计数:
    4
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 1 NC_000067.7(128515936..128520036,补码)
    108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 1 NC_000067.6(128588199..128592299,补码)

    染色体1-NC_000067.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E4344 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E2558 Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr1:130487786-130488065 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E10032 Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr1:130502453-130502636 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E4345 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E10033 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E7744 Neighboring gene predicted gene, 41950 Neighboring gene eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 1 pseudogene Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E9477 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_02173 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_02174 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E2007 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_02175 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_02176 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_02178 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_02179 Neighboring gene predicted gene, 23056 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_02180 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_02181 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_02182 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_02183 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_02184 Neighboring gene thrombospondin, type I, domain containing 7B Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_02185 Neighboring gene predicted gene, 36347

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:鼠标ENCODE转录组数据
    • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
    • 生物项目:PRJNA66167型
    • 出版物:PMID 25409824
    • 分析日期:无

    参考文献

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?

    变化

    等位基因

    这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)

    PubChem的途径

    互动

    产品 交互作用者 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

    标记

    基因本体论 MGI提供

    过程 证据代码 酒吧
    acts_upstream_of_or_within CXCL12-activated CXCR4信号通路 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    参与CXCL12-激活的CXCR4信号通路 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与G蛋白偶联受体信号通路 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or内T细胞增殖 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与动物器官形态发生 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或主动脉内发育 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或血管内皮细胞内迁移 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与大脑发育 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    大脑发育中的上游活动 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游ofor分支内参与血管形态发生 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    钙介导的信号转导 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    acts上游of或钙介导信号内 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    公共医学 
    参与心肌收缩 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞趋化性 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与细胞迁移 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    细胞内对细胞因子刺激的反应 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    参与细胞对细胞因子刺激的反应 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞对有机氮化合物的反应 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与趋化性 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与检测与疼痛感觉有关的机械刺激 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与检测与疼痛感觉有关的温度刺激 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与内皮细胞分化 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    内皮管形态发生 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与上皮细胞发育 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与神经元生成 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游或生殖细胞发育内 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游或生殖细胞内迁移 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或造血干细胞迁移内 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与免疫反应 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    肾脏发育中的上游活动 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    actits_upstream_of_or运动神经元轴突内导向 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    受累髓磷脂维持 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与神经系统发育 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
    公共医学 
    参与神经前体细胞增殖 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    参与神经发生 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与神经发生 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    actits_upstreamm_of_or内神经元迁移 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    参与神经元迁移 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or_ERK1和ERK2级联正向调节范围内 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or内钙离子导入的正调控 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    参与细胞迁移的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与趋化性的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与冷诱导产热的正调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与胞浆钙离子浓度的正调控 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与枝晶延伸的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与巨噬细胞迁移抑制因子信号通路的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与间充质干细胞迁移的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与神经发生的正向调节 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与少突胶质细胞分化的正调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或蛋白质磷酸化正调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与血管创伤愈合的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与血管系统发育的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    钙离子转运的调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞粘附的调节 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or调节细胞迁移 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or调节细胞迁移 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与趋化性调节 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or调节神经元迁移 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与细胞程序性死亡的调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与病毒过程的调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与对有机环状化合物的反应 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与他克莫司反应 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts上游of或信号转导内 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    端脑细胞迁移受累 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts上游of或室间隔内发育 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    组件 证据代码 酒吧
    定位于锚固接头 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    位于单元格前沿 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    位于单元格表面 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    位于单元格表面 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
    公共医学 
    定位于细胞间连接 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    定位于细胞质小泡 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    与早期内体共定位 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    定位于早期内体 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    定位于内体 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    在质膜的外侧是活性的 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    位于质膜外侧 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    位于生长锥中 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    定位于晚期内体 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    与溶酶体共定位 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    定位于溶酶体 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    定位膜 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     
    定位于质膜 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    定位于质膜 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    蛋白质复合物的一部分 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     

    一般蛋白质信息

    首选名称
    C-X-C趋化因子受体4型
    姓名
    SDF-1受体
    趋化因子(C-X-C基序)受体4
    趋化因子(C-X-C)受体4
    趋化因子受体4
    融合蛋白
    白细胞衍生七跨膜结构域受体
    白细胞表达的七跨膜结构域
    前B细胞衍生趋化因子受体
    基质细胞衍生因子1受体

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节为中报告的基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_001356509.1号NP_001343438.1号C-X-C趋化因子受体4型亚型2

      状态:已验证

      源序列
      AC161170型
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      O09059号,O09062号,第70233页,第70346页,第70658页,第4季度公里1
      保守领域(2)总结
      pfam12109型
      位置:638
      CXCR4_N;CXCR4趋化因子受体N端
      cd15179
      位置:39318
      7tmA_ CXCR4;CXC趋化因子受体4型,七跨膜G蛋白偶联受体A类家族成员
    2. NM_001420067.1号NP_001406996.1号C-X-C趋化因子受体4型亚型3

      状态:已验证

      源序列
      AC161170型
    3. NM_001420068.1号NP_001406997.1号C-X-C趋化因子受体4型亚型3

      状态:已验证

      源序列
      AC161170型
    4. NM_009911.4号NP_034041.2号C-X-C趋化因子受体4型亚型1

      参见NP_034041.2的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已验证

      源序列
      交流电161170
      共识CDS
      CCDS15254.1号文件
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      O09059号,O09062号,第70233页,第70346页,第70658页,第4季度公里1
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A0A0R4J0N8型
      相关的
      ENSMUSP00000053489.7号,ENSMUST00000052172.7
      保守领域(2)总结
      pfam00001型
      位置:57309
      7tm_1;7跨膜受体(视紫红质家族)
      pfam12109型
      位置:840
      CXCR4_N;CXCR4趋化因子受体N端

    注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定的基因组构建。解释

    参考GRCm39 C57BL/6J

    基因组学

    1. NC_000067.7参考GRCm39 C57BL/6J

      范围
      128515936..128520036补码
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)