GeoMx工作流

GeoMx数字空间轮廓仪（DSP）数据分析工作流

生物导体版本：释放（3.19）

用于NanoString Technologies GeoMx Technology的工作流。Package提供了以生物导体为中心的工作流，用于利用现有软件包（例如GeomxTools）来处理、质量控制和分析数据。

作者：Maddy Griswold[cre，aut]，Jason Reeves[aut]

维护人员：Maddy Griswold<mgriswold at nanostring.com>

引文（从R中输入引文（“GeoMxWorkflows”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“GeoMxWorkflows”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“GeoMx工作流”）

生物视图	GeneExpressionWorkflow（通用表达式工作流）,免疫肿瘤学工作流,空间工作流,工作流
版本	1.10.0
许可证	麻省理工学院
取决于	R（>=4.0），NanoStringNC工具,Geomx工具
进口	博科生物,S4载体，rjson，readxl，EnvStats，dplyr，reformate2，methods，utils，stats，data.table，离群值，生物遗传学、ggplot2、ggreset、ggforce、cowplot、scales、umap、Rtsne、pheatmap、，仿生风格，网络D3
系统要求
统一资源定位地址

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	GeoMx工作流_1.10.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制（x86_64）
macOS二进制（arm64）
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GeoMx工作流
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/GeoMx工作流
包短Url	https://bioconductor.org/packages/GeoMx工作流/
软件包下载报告	下载统计信息