SeqSQC公司

利用下一代测序数据进行样品质量检查的生物导体包

生物导体版本：释放（3.18）

SeqSQC旨在识别NGS数据中存在问题的样本，包括具有性别错配、污染、隐秘相关性和群体异常值的样本。

作者：刘谦[aut，cre]

维护人员：钱刘（Qian Liu）<qliu7 at buffal.edu>

引文（从R中输入引文（“SeqSQC”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.3”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“SeqSQC”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“SeqSQC”）

生物视图	实验数据,基因组,人乳头数据,项目1000基因组,排序数据,软件
版本	1.24.1
在生物导体中	生物技术3.6（R-3.4）（6.5年）
许可证	GPL-3公司
取决于	R（>=3.4），实验中心(>= 1.3.7),SNP关联(>= 1.10.2)
进口	e1071，基因组范围,gdsfmt公司、ggplot2、GGally、，I范围、方法、策略、RColorBrewer、重塑2、rmarkdown、，S4载体，统计，实用程序
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/Liubuntu/SeqSQC
错误报告	https://github.com/Liubuntu/SeqSQC发布

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	序号SQC_1.24.1.tar.gz
Windows二进制	序列SQC_1.24.1.zip
macOS二进制（x86_64）	序号SQC_1.24.1.tgz
macOS二进制（arm64）	序列SQC_1.24.1.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SeqSQC
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/SeqSQC
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/SeqSQC/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/SeqSQC/
软件包下载报告	下载统计信息
BioC 3.18的旧源程序包	源存档