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谷胱甘肽合成酶ATP-结合域样超家族

SCOP分类
根目录: SUPERFAMILY中的SCOP层次结构[ 0] (11)
类别: α和β蛋白(a+b)[ 53931] (376)
折叠: ATP抓取[ 56058] (2)
超级家族:   谷胱甘肽合成酶ATP-结合域样[ 56059](9)
家庭: 肽合成酶的ATP-结合域[ 56060](3)
  赖氨酸生物合成酶LysX-ATP-结合域[ 103281]
  BC ATP绑定域类[ 56067] (6)
  突触蛋白C末端结构域[ 56078] (2)
  琥珀酰辅酶A合成酶,β链,N末端结构域[ 56081]
  丙酮酸磷酸二激酶,N-末端结构域[ 56085]
  真核谷胱甘肽合成酶ATP-结合域[ 56088]
  谷胱甘肽酰亚胺合酶ATP-结合域样[ 143890]
  PurP ATP结合结构域样[ 160804]


超级家庭统计
基因组(3,185) Uniprot 2018_03基因组 PDB链(SCOP1.75)
48,449 374,280 50
蛋白质 44,826 348,983 47


功能注释
一般类别 新陈代谢
详细类别 辅酶代谢和运输

文档:
SCOP域超家族的功能注释

酶委员会(EC)

(显示详细信息)
EC术语FDR(全部)SDEO水平注释(直接或继承)
酶委员会(EC)连接酶类0信息最少直接
酶委员会(EC)裂孔菌属1信息最少继承
酶委员会(EC)转移单碳基团1信息最少继承的
酶委员会(EC)形成碳氮键0信息量适中直接
酶委员会(EC)羧基裂解酶1信息量适中继承的
酶委员会(EC)以醇基为辅基的磷酸转移酶1信息量适中继承
酶委员会(EC)酸--D-氨基酸连接酶(肽合成酶)0信息丰富直接
酶委员会(EC)以谷氨酰胺为氨基-N的碳氮连接酶0.0001175信息丰富直接
酶委员会(EC)形成碳碳键的连接酶1信息丰富继承
酶委员会(EC)其他碳氮连接酶1信息丰富继承
酶委员会(EC)环-Ligas1信息丰富继承
酶委员会(EC)以磷酸基为辅酶的磷酸转移酶1信息丰富继承
酶委员会(EC)转移时酰基转化为烷基0.004511信息丰富继承的
酶委员会(EC)羟甲基、甲酰基和相关转移酶1信息丰富继承
酶委员会(EC)谷胱甘肽合成酶0高度信息化直接
酶委员会(EC)ATP柠檬酸合成酶0高度信息化直接
酶委员会(EC)5-(羧氨基)咪唑核糖核苷酸合成酶0高度信息化直接
酶委员会(EC)磷酸核糖胺——甘氨酸连接酶0高度信息化直接
酶委员会(EC)生物素羧化酶0高度信息化直接
酶委员会(EC)氨甲酰磷酸合成酶(谷氨酰胺水解素0高度信息化直接
酶委员会(EC)磷酸核糖基氨基咪唑羧化酶0高度信息化直接
酶委员会(EC)琥珀酸-CoA连接酶(ADP-形成)0高度信息化直接
酶委员会(EC)肌醇六磷酸激酶0.000000000000002328高度信息化直接
酶委员会(EC)丙酮酸羧化酶0.000000000000002558高度信息化直接
酶委员会(EC)磷酸核糖基甘氨酸甲酰转移酶0.0000000001025高度信息化直接
酶委员会(EC)丙酮酸,磷酸二激酶0.0000001639高度信息化直接
酶委员会(EC)丙酮酸、水二激酶0.000004259高度信息化直接
酶委员会(EC)甲基巴豆酰辅酶A羧化酶0.00001238高度信息化直接
酶委员会(EC)磷酸核糖基甲酰甘氨酰环-ligase0.0007799高度信息化直接

文档:SCOP域的EC注释

人类表型(HP)

(显示详细信息)
HP术语FDR(全部)SDHP水平注释(直接或继承)
表型异常(PA)代谢/体内平衡异常0.3152信息最少继承
表型异常(PA)泌尿生殖系统异常0.3319信息最少继承
表型异常(PA)酸碱平衡异常0.00001505信息量适中直接
表型异常(PA)泌尿系统生理异常0.0083信息量适中继承
表型异常(PA)循环代谢物浓度异常0.04937信息量适中继承
表型异常(PA)酸性尿0.0001477信息丰富直接
表型异常(PA)氮血症0.0002641信息丰富直接

文档:SCOP域的HP注释

小鼠表型(MP)

(显示详细信息)
MP术语FDR(全部)SDMP级别注释(直接或继承)
哺乳动物表型(MP)神经系统表型0.8774信息最少继承
哺乳动物表型(MP)神经系统生理异常0.7784信息量适中继承
哺乳动物表型(MP)异常行为1信息量适中继承
哺乳动物表型(MP)癫痫发作0.05356信息丰富继承
哺乳动物表型(MP)中枢神经系统突触传递异常0.1663信息丰富继承
哺乳动物表型(MP)强直阵挛性癫痫0.0006188高度信息化直接
哺乳动物表型(MP)异常突触抑制0.003176高度信息化继承
哺乳动物表型(MP)诱发剂致痫反应异常0.009254高度信息化继承
哺乳动物表型(MP)异常神经系统电生理学0.04197高度信息化继承

文档:SCOP域的MP注释

蠕虫表型(WP)

(显示详细信息)
WP术语FDR(全部)SDWP水平注释(直接或继承)
蠕虫表型(WP)器官系统形态变异0.000799信息最少直接
蠕虫表型(WP)生物环境刺激反应变异体0.004754信息最少继承
蠕虫表型(WP)细胞形态变异0.1041信息最少继承的
蠕虫表型(WP)生物行为变异体0.1648信息最少继承
蠕虫表型(WP)神经系统形态学变异0.0868信息量适中继承
蠕虫表型(WP)雄性交配变异体0.000002681信息丰富直接
蠕虫表型(WP)趋化性变体0.00003581信息丰富直接
蠕虫表型(WP)色素沉着变异体0.002592信息丰富继承
蠕虫表型(WP)体壁肌肌节形态变异0.01719信息丰富继承
蠕虫表型(WP)感器形态变异0.09338信息丰富继承
蠕虫表型(WP)渗透回避变体0.00000001899高度信息化直接
蠕虫表型(WP)染料填充缺陷0.00001538高度信息化直接
蠕虫表型(WP)清楚的0.00009858高度信息化直接
蠕虫表型(WP)体壁肌粗丝变异0.0002807高度信息化直接

文档:SCOP域的WP注释

酵母表型(YP)

(显示详细信息)
YP术语FDR(全部)SDYP级别注释(直接或继承)
酵母表型(YP)新陈代谢和生长0.3189信息最少继承
酵母表型(YP)养分利用0.2944信息量适中继承的
酵母表型(YP)氮源利用0.0006524信息丰富直接
酵母表型(YP)朊病毒形成0.0002569高度信息化直接

文档:SCOP域的YP注释

飞行解剖学(FA)

(显示详细信息) 文档:SCOP域的FA注释

斑马鱼解剖学(ZA)

(显示详细信息)
ZA术语FDR(全部)SDZA等级注释(直接或继承)
斑马鱼解剖学(ZA)神经系统0信息最少直接
斑马鱼解剖学(ZA)复合器官0信息最少直接
斑马鱼解剖学(ZA)有机体细分0信息最少直接
斑马鱼解剖学(ZA)多组织结构0信息最少直接
斑马鱼解剖学(ZA)心血管系统0信息量适中直接
斑马鱼解剖学(ZA)感觉系统0信息量适中直接
斑马鱼解剖学(ZA)组织的一部分0信息量适中直接
斑马鱼解剖学(ZA)解剖簇0信息量适中直接
斑马鱼解剖学(ZA)喷口后区域0信息丰富直接
斑马鱼解剖学(ZA)心包区0信息丰富直接
斑马鱼解剖学(ZA)0高度信息化直接

文档:SCOP域的ZA注释

爪蟾解剖学(XA)

(显示详细信息) 文档:SCOP域的XA注释

拟南芥植物本体(AP)

(显示详细信息)
AP术语FDR(全部)SDAP级别注释(直接或继承)
植物非原子实体(PAN)保护电池0信息最少直接
植物非原子实体(PAN)整个工厂0.005276信息最少继承
植物非原子实体(PAN)集体叶状体结构0.009628信息最少继承
植物非原子实体(PAN)0.01653信息最少继承
植物非原子实体(PAN)0.1357信息最少继承

文档:SCOP域的AP注释

酶委员会(EC)

(显示详细信息)
EC术语FDR(全部)SDEC级注释(直接或继承)
酶委员会(EC)转移含磷基团1信息最少继承
酶委员会(EC)裂解酶1信息最少继承
酶委员会(EC)连接酶类0信息量适中直接
酶委员会(EC)转移单碳基团1信息量适中继承
酶委员会(EC)以醇基为受体的磷酸转移酶1信息量适中继承
酶委员会(EC)碳碳裂解酶1信息量适中继承
酶委员会(EC)酸-氨基酸连接酶(肽合成酶)0信息丰富直接
酶委员会(EC)谷氨酰胺作为氨基氮供体的碳氮连接酶0.6693信息丰富继承
酶委员会(EC)羟甲基、甲酰基和相关转移酶1信息丰富继承的
酶委员会(EC)以磷酸基团为受体的磷酸转移酶1信息丰富继承
酶委员会(EC)羧基裂解酶1信息丰富继承的
酶委员会(EC)其他碳氮连接酶1信息丰富继承
酶委员会(EC)磷酸核糖胺——甘氨酸连接酶0高度信息化直接
酶委员会(EC)氨甲酰磷酸合成酶(谷氨酰胺水解)0高度信息化直接
酶委员会(EC)形成碳-碳键0高度信息化直接
酶委员会(EC)磷酸核糖基甘氨酸甲酰转移酶0.0000000001035高度信息化直接
酶委员会(EC)尿素羧化酶0.00008886高度信息化直接
酶委员会(EC)转移时酰基转化为烷基0.004582高度信息化继承
酶委员会(EC)酸-硫醇连接酶1高度信息化继承
酶委员会(EC)酸-氨(或胺)连接酶(酰胺合成酶)1高度信息化继承

文档:SCOP域的EC注释

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内部数据库链接

浏览此超家族的基因组分配。SUPERFAMILY隐马尔可夫模型库用于超家族水平上所有基因组的外SCOP域分配。


序列对齐60种型号单击上面的“Alignments”图标即可访问此超级系列中的。PDB序列一致性低于40%默认情况下显示,但可以对齐任何其他序列。选择PDB序列、基因组序列,或粘贴或上传您自己的序列。


浏览和查看具有以下特征的基因组中的蛋白质不同的结构域组合包括谷胱甘肽合成酶ATP-结合结构域样结构域。


检查域超家族或家族在主要分类王国或王国内基因组中的分布。这给人一个直接的印象,即超级家族是如何被限制在某些生命王国中的。


探索域发生网络,其中节点表示基因组,边缘是包含感兴趣超家族的域架构(基因组之间共享)。

有60个隐马尔可夫模型代表谷胱甘肽合成酶ATP-结合域样超家族。关于如何构建模型的信息,以及显示疏水性,匹配发射概率插入/删除概率可以检查。


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