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SCOP层次结构
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α和β蛋白(a+b)类
SCOP分类
根目录:
SUPERFAMILY中的SCOP层次结构
[
0
] (11)
等级
:
α和β蛋白(a+b)
[
53931
] (376)
折叠:
微生物核糖核酸酶
[
53932
]
类溶菌酶
[
53954
]
半胱氨酸蛋白酶
[
54000
]
His-Me指核酸内切酶
[
54059个
]
核糖核酸酶A样
[
54075
]
类EndoU
[
142876
]
类朊病毒
[
54097
]
LysM域
[
54105
]
类似gpW/XkdW
[
64209
] (2)
假设蛋白质MTH677
[
110782
]
GTF2I-like重复
[
117772
]
尿素酶,γ亚单位
[
54110
]
类IL8
[
54116
] (2)
DNA-结合域
[
54170
]
青霉素结合蛋白2x(pbp-2x),c端结构域
[
54183
]
多肽亚基样
[
88797
] (6)
核糖体蛋白S24e、L23和L15e
[
54188
]
核糖体结合域样
[
100965
] (2)
类TFB5
[
142896
]
Obg GTP结合蛋白C末端结构域
[
102740
]
类似HIT
[
54196
] (2)
分泌伴侣样
[
69634个
] (5)
内含子编码核酸内切酶的DNA结合域
[
64495美元
]
MotA C端域状
[
69651
]
YktB/PF0168类
[
142912
]
Mago nashi蛋白
[
89816
]
WGR域类
[
142920
]
类似PH1570
[
159901
]
核糖体蛋白S5结构域2样
[
54210
]
β-抓握(泛素样)
[
54235
] (14)
类似MM3350
[
159940人
]
WWE域
[
117838
]
FAD-连接还原酶,C末端结构域
[
54372
]
类胱抑素
[
54402
] (7)
核酸酶A抑制剂(NuiA)
[
82601
]
大肠杆菌素D/E5核酸酶域
[
102823
]
类似RelE
[
143010
]
假设蛋白SAV1430
[
110835
]
Ns1效应器域样
[
143020
]
类YbaB
[
82606
]
类动粒球状结构域
[
143025
]
类L35p
[
143033
]
细胞分裂蛋白ZapA-like
[
102828
]
ssDNA-结合转录调控域
[
54446
]
光系统I亚单位PsaD
[
64233
]
GINS/PriA/YqbF域
[
160058
]
MHC抗原识别域
[
54451
]
类UBC
[
54494
]
类沙地
[
63762
]
NRDP1 C端类域
[
160087年
]
冠状病毒NSP8-like
[
143075
]
ParB/硫氧还蛋白
[
110848
]
γ-谷氨酸环转移酶样
[
110856
]
BB1717类
[
143080
]
SARS Nsp1类
[
160098
]
乙酰乙酸脱羧酶样
[
160103
]
AF0104/ALDC/Ptd012-类
[
117855
]
NSFL1(p97 ATP酶)辅因子p47,SEP结构域
[
102847
]
TTHA1013/TTHA0281类
[
143099
]
YegP样
[
160112
]
二氨基戊二酸差异构酶样
[
54505
]
类GFP
[
54510
]
Tubby C端domain-like
[
54517
]
菌毛亚基
[
54522
]
线粒体糖蛋白MAM33样
[
54528
]
类NAP
[
143112
]
Polo-box域
[
82614
]
mRNA去盖酶DcpS N末端结构域
[
102859
]
脊椎动物溶菌酶抑制剂,常春藤
[
89871
]
类FKBP
[
54533
](3)
核糖体蛋白S16
[
54564
]
核糖体蛋白S19
[
54569
]
是的,喜欢
[
143119
]
核糖体蛋白L31e
[
54574
]
别藻蓝蛋白连接链(域)
[
54579
]
Cdc48域2-类
[
54584
]
Glyoxalase/博来霉素抗性蛋白/二羟基联苯双加氧酶
[
54592
]
染色体蛋白MC1
[
102874
]
CPE0013类
[
160147
]
β-发夹-α-发夹重复序列
[
74651
] (2)
丙氨酸
[
89889
]
类SecB
[
54610
]
类MesJ基底识别域
[
82828
]
FYSH域
[
89894
]
VSV基质蛋白
[
75403
]
Mlu1-box结合蛋白MBP1的DNA结合域
[
54615
]
血红素结合蛋白A(HasA)
[
54620
]
查尔酮异构酶
[
54625
]
粪卟啉原III氧化酶
[
102885
]
假设蛋白质Ta1206
[
102890
]
CBS域对
[
54630
]
硫酯酶/硫醇酯脱氢酶-异构酶
[
54636
]
数据链路连接器
[
54647
]
丝氨酸蛋白酶抑制剂CI-2家族
[
54653
]
整合素β尾结构域
[
69686
]
类YcgL
[
160190
]
α/β-锤头
[
54664
] (5)
POZ域
[
54694
]
EF Ts类结构域
[
54712
] (2)
铁、锰超氧化物歧化酶(SOD),C末端结构域
[
54718
]
类ClpS
[
54735
]
假设蛋白质MTH1880
[
75411
]
核糖体L11/L12e N端结构域
[
54746
]
抗-LPS因子/recA域
[
54751
] (2)
信号识别颗粒alu-RNA结合异二聚体,SRP9/14
[
54761
]
类dsRBD
[
54767
](5)
2-异丙基苹果酸合成酶LeuA,变构(二聚)结构域
[
110920
]
NMB0488类
[
160206
]
战略参考19
[
69694
]
SufE/NifU公司
[
82648
]
类似FlaG的
[
160213
]
AMPKBI-类
[
160218
]
DNA结合蛋白Tfx
[
89914
]
真核型KH-结构域(KH-域I型)
[
54790
]
溶α蛋白酶前体蛋白样
[
54805
] (10)
核苷酸转移酶
[
81302
]
Nqo5类
[
143242
]
核糖体蛋白S3 C末端结构域
[
54820
]
转录因子NusA,N末端结构域
[
69704
]
烯醇化酶N-末端结构域样
[
54825
]
核糖体蛋白L22
[
54842
]
原核核糖体蛋白L17
[
64262
]
类似GroEL的中间领域
[
54848
]
PX域
[
64267
]
Shew3726型
[
160271个
]
DsrC,异化亚硫酸盐还原酶的γ亚单位
[
69720
]
DNA损伤诱导蛋白DinI
[
54856
]
HSP90 C端域
[
110941
]
类铁氧还蛋白
[
54861
] (59)
类似PurS
[
109622
]
类RplX
[
160373
]
dystrogycan,结构域2
[
111005
]
假尿苷合酶
[
100877
]
SP0830-类似
[
160378
]
叶绑定域
[
103024
]
THUMP结构域
[
143436
]
AMMECR1类
[
143446
]
NosL/MerB-like型
[
160386
]
YehU型
[
118000
]
假想蛋白YwqG
[
103031
]
VC0467类
[
143455
]
病变旁路DNA聚合酶(Y家族),小指域
[
2008年
]
ImmE5类
[
143468
]
核糖体蛋白L30p/L7e
[
55128
]
Chorismate类裂解
[
64287个
]
YdfO类
[
160418
]
TM1622类
[
143476
]
BH3703类
[
160423
]
可能的细菌效应器结合域
[
55135
]
类CheC
[
103038
]
LightT型
[
55143
]
胃蛋白酶抑制剂-3
[
55148
]
类CYTH磷酸酶类
[
55153
]
反平行β/α桶(PT-barrel)
[
143491
]
eIF1类似
[
55158
] (2)
刺猬/DD-肽酶
[
55165
]
Alpha-L RNA结合基序
[
55173
]
RRF/tRNA合成酶额外域样
[
55185
] (4)
LuxS/MPP样金属水解酶
[
63410
]
类IF3
[
55199
] (8)
PUG域类
[
143502
]
PG1857类
[
160447个
]
PB2 C端域状
[
160452
]
核糖体结合蛋白Y(YfiA同源物)
[
69753
]
TolA/TonB C端域
[
74652
]
酵母杀手毒素
[
55220
]
细胞分裂蛋白MinE拓扑特异域
[
55228
]
假设蛋白YoaG
[
103062
]
BLRF2-类
[
160458
]
核衣壳蛋白二聚结构域
[
103067
]
氰酶C末端结构域
[
55233
]
多药外排转运体AcrB-TolC对接结构域;
DN和DC子域
[
82713
]
RuBisCO,小亚基
[
55238
]
类DCoH
[
55247
] (5)
TRCF域类
[
143516
]
NMB0513类
[
160471
]
PA1123-类
[
160476
]
假设蛋白Yml108w
[
100886
]
类MutS N端域
[
55266
] (2)
GYF/BRK域类
[
55276
](2)
GTP环水解酶I反馈调节蛋白
[
69760
]
RL5类
[
55281
]
类RPB5 RNA聚合酶亚单位
[
55286
]
分支杆菌突变样
[
55297
] (9)
YjbQ类
[
111037
]
互变酶/MIF
[
55330
]
FwdE/GAPDH域类
[
55346
] (4)
类似Ava3019
[
160531
]
假想蛋白质PF0899
[
111056个
]
主衣壳蛋白gp5
[
56562
]
MK0786类
[
143559
]
类似YkuJ
[
143566
]
类铜胺氧化酶的N结构域
[
55382
] (5)
Aha1/BPI域类
[
55393
] (2)
类似SpoVG
[
160536
]
枯草杆菌素抑制剂
[
55398
]
RNA噬菌体衣壳蛋白
[
55404
]
类似eIF4e
[
55417个
]
CO脱氢酶黄素蛋白C域样
[
55423
](2)
类SRF
[
55454
]
复制绑定域的起源,类似RBD
[
55463
]
SARS受体绑定域样
[
143586
]
Hut操纵子阳性调节蛋白HutP
[
111063
]
假设蛋白yfbM
[
111068
]
TTHA1528类
[
143591
]
像YojJ
[
143596
]
STIV B116类
[
143601
]
芽孢杆菌噬菌体蛋白
[
111073
]
FMN依赖性硝基还原酶样
[
55468
]
真核肽链释放因子亚基1的N-末端结构域
[
55480
]
EscU C终端域类
[
160543
]
类锌
[
55485
] (2)
类SH2
[
55549
]
类HPr
[
55593
] (2)
TrkA C端类结构域
[
116725
]
假想蛋白YjiA,C末端结构域
[
90001
]
类YggU
[
69785
]
类归位核酸内切酶
[
55603
] (2)
T形折叠
[
55619
] (2)
细胞周期调节蛋白
[
55636
]
YonK型
[
160569
]
类似BLIP
[
55647
] (2)
核糖体蛋白L9 C结构域
[
55652
]
MbtH/L9域类
[
55657
] (2)
Tombusvirus P19核心蛋白,VP19
[
103144
]
核糖核酸酶PH域2-样
[
55665个
]
调节因子Nef
[
55670
]
CytB类内毒素
[
55675
]
Ⅱ类aaRS和生物素合成酶
[
55680
]
网格蛋白亚结构域和互变异构体附属物结构域
[
55710
]
类SCP
[
55717
]
Ta1353-类
[
103164
]
Mog1p/PsbP类
[
55723
]
SMI1/KNR4类
[
160630
]
酰基-CoA N-酰基转移酶(Nat)
[
55728
]
类盖尔索林
[
55752
] (3)
PHP14类
[
143723
]
类Profilin
[
55769
] (10)
NO信号转导和高尔基体转运中的配体结合域
[
111125
]
噬菌体尾蛋白样
[
143748
]
PR-1类
[
55796
]
磷酸转移酶/阴离子转运蛋白
[
55803
]
努迪克斯
[
55810
]
5'-核苷酸酶(即UDP-糖水解酶),C末端结构域
[
55815
]
YrdC/肋B
[
55820
]
GIY-YIG核酸内切酶
[
82770
]
YbaK/ProRS关联域
[
55825
]
胸苷酸合成酶/dCMP羟甲基化酶
[
55830
]
胸苷酸合成酶互补蛋白Thy1
[
69795
]
N-乙酰鼠酰-L-丙氨酸酰胺酶样
[
55845
]
细胞色素b5样血红素/类固醇结合域
[
55855个
]
BTG域类
[
160695
]
类DUSP
[
143790
]
DNA拓扑异构酶I结构域
[
55868个
]
HSP90伴侣/DNA拓扑异构酶II/组氨酸激酶的ATP酶域
[
55873
]
是的,就像
[
160703
]
产孢反应调节蛋白Spo0B
[
55889
]
核糖核酸酶Rh-like
[
55894
]
类YlxR
[
64375
]
类YggX
[
111147
]
L28p类
[
143799
]
类似YqaI
[
160712
]
鸟氨酸脱羧酶C末端结构域
[
55903
]
戊聚糖,β/α螺旋桨
[
55908
]
肌酸酶/氨肽酶
[
55919
]
gpW/gp25类
[
160718
]
谷氨酰胺合成酶/胍基激酶
[
55930
]
类TBP
[
55944
] (11)
西斯尔式
[
143846
]
腺苷甲硫氨酸合成酶
[
55972
]
DNA钳
[
55978
]
假想蛋白TM0160
[
103255
]
TTHC002类
[
160760
]
钼辅因子结合域
[
56002
]
NE1680-类似
[
160765
]
亚硝酸盐和亚硫酸盐还原酶4Fe-4S域样
[
56013
]
DeoB插入域类
[
143855
]
纺锤组件检查点蛋白mad2
[
56018
]
磷脂酶D/核酸酶
[
56023
]
CorA可溶性域样
[
143864
]
单加氧酶(羟化酶)调节蛋白
[
第56028页
]
PurM C端域样
[
56041
]
PF0523类
[
143869
]
分支酸合酶,AroC
[
103262
]
Hsp33结构域
[
64396
]
类似MTH1598
[
69818
]
蛋白质-L-异天冬氨酰O-甲基转移酶,C末端结构域
[
68929
]
类OsmC
[
82783
]
假设蛋白质HI1480
[
103276
]
类ERH
[
143874
]
核糖体蛋白S8
[
56046
]
核糖体蛋白L6
[
56052
]
NE0471 N端domain-like
[
143879
]
Lp2179类
[
160799
]
类似RGC域
[
143884
]
Smc铰链域
[
75552
]
DNA错配修复蛋白MutL
[
118115
]
ATP抓取
[
56058
](2)
SAICAR合成酶样
[
56103
]
蛋白激酶样(PK-like)
[
56111年
]
FAD-结合/转运蛋白相关域样
[
56175
]
尿苷二磷酸-N-乙酰基丙酮酸葡萄糖胺还原酶,MurB,C-末端结构域
[
56193
]
甲基四氢甲烷蝶呤环水解酶
[
56198
]
Prim-pol域
[
56746
]
Hect,E3连接酶催化结构域
[
56203
]
腈水合酶α链
[
56208
]
4'-磷酸乙烯基转移酶
[
56213
]
DNA酶I样
[
56218
]
醛铁氧还蛋白氧化还原酶,N末端结构域
[
56227
]
类Ntn水解酶
[
56234
] (2)
DmpA/ArgJ类
[
56265
]
丙酮酸依赖性组氨酸和精氨酸脱羧酶
[
56270
]
S-腺苷蛋氨酸脱羧酶
[
56275
]
金属水解酶/氧化还原酶
[
56280
]
PP2C类
[
81607
]
金属依赖性磷酸酶
[
56299
]
碳氮水解酶
[
56316
]
CNF1/YfiH类推测半胱氨酸水解酶
[
64437
]
ADC合成酶
[
第56321页
]
果糖-1,6-二磷酸亚砜样
[
111248
]
LDH C末端域样
[
56326
]
DNA断裂-重新连接酶
[
56348
]
复制调制器SeqA,C端DNA结合域
[
82807
]
SMAD MH1域
[
56365
]
YopH酪氨酸磷酸酶N端结构域
[
64448
]
轮状病毒NSP2片段,N末端结构域
[
75573
]
Rv2827c C端子域状
[
160886
]
磷蛋白寡聚结构域样
[
160891
]
Taf5 N-末端结构域样
[
160896
]
类似Jann2411
[
160903
]
类似ATP12
[
160908
]
核糖体失活蛋白(RIP)
[
56370
]
ADP核糖基化
[
56398
]
肽脱甲酰化酶
[
56419
]
LCCL域
[
69847
]
琥珀酸脱氢酶/富马酸还原酶黄素蛋白,催化结构域
[
56424
]
C型凝集素样
[
56435
]
溶血凝集素CEL-III,C末端结构域
[
111264
]
类似SRCR
[
56486
] (2)
纤维蛋白原C末端域样
[
56495
]
gp120芯
[
56501
]
蛋氨酸合酶激活域样
[
56506
]
UbiD C端域样
[
143967
]
假设蛋白质TM0875
[
90063
]
金属阳离子转运ATP酶,ATP结合域N
[
81661
]
融合N端域抑制器
[
103358
]
一氧化氮合酶加氧酶结构域
[
56511
]
青霉素结合蛋白二聚结构域
[
56518
]
氧化还原酶钼蝶呤结合域
[
56523
]
FAH公司
[
56528
]
芳香氨基酸单加氧酶,催化和齐聚域
[
56533
]
HMG-CoA还原酶的底物结合域
[
56541
]
精氨酸琥珀酸合成酶,C末端结构域
[
69863
]
假设蛋白PH1602
[
103364
]
IlvD/EDD N端域类
[
143974
]
DNA甲基化酶特异性结构域
[
116733
]
GCM域
[
90072美元
]
转录调控蛋白vp16的保守核心
[
56547
]
插入RNA聚合酶α亚单位的亚结构域
[
56552
]
基板结构蛋白gp11
[
56557
]
短尾纤维蛋白gp12的受体结合域
[
88873
]
外衣壳蛋白sigma 3
[
64464
]
磷蛋白M1,C末端结构域
[
118172
]
五十、 D-转肽酶预催化域样
[
143984
]
类似YbiA
[
143989
]
NinB公司
[
103369
]
AF2331类
[
143994
]
SSo0622类
[
111277个
]
DNA回转酶的假定调节剂PmbA/TldD
[
111282
]
PSTPO5379类
[
160919
]
类似PG1388
[
160924
]
氧化甾醇结合蛋白样
[
143999
]
ORC1-绑定域
[
144004
]
类CofE
[
144009
]
肽聚糖脱乙酰酶N-末端非催化区
[
144014
]
球蛋白的非球α+β亚单位
[
56567
]
请引用:
Gough,J.、Karplus,K.、Hughey,R.和
Chothia,C.(2001)。
“使用隐马尔可夫模型库将同源性分配给基因组序列
代表所有已知结构的蛋白质。
"
分子生物学杂志。
,
313(4)
,
903-919中。
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