结晶学报D辑
结晶学报
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结构
生物学
第61卷
|
第9部分
国际标准编号:2059-7983
2005年9月发行
封面插图:
EETI-II四方晶型的封装-
TNNK公司
复杂(
第1255页
).
专题评论
《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
1173-1180
https://doi.org/10.107/S090744905019451
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提高蛋白质晶体衍射质量的结晶后处理
B.赫拉斯
和
J.L.马丁
这篇综述提供了一个后结晶方法的汇编,该方法可以将衍射较差的晶体转换为数据质量好的晶体。
概述了退火、脱水、浸泡和交联的协议,并提供了晶体质量中一些引人注目的变化的示例。
阅读文章
研究论文
《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
1181-1189
https://doi.org/10.107/S09074490501543X
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与溶菌酶结合的高碘酸盐的规则排列
J.昂德拉切克
,
M.S.Weiss先生
,
J.布林达
,
J.菲亚拉
,
F.Jursík
,
佩·埃萨科娃
,
L.B.詹纳
和
J.塞德拉切克
对溶菌酶高碘酸盐配合物的结构进行了测定、精制和分析。
PDB参考
:
溶菌酶、1hc0、r1hc0sf的高碘酸盐复合物
阅读文章
《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
1190-1198年
https://doi.org/10.107/S090744905017488
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亚硝酸盐还原酶氧化和还原形式的结构
球形红杆菌
2.4.3高pH值下:2型铜相互作用的变化
F.雅各布森
,
H.郭
,
K.Olesen公司
,
M.Økvist先生
,
R.纽茨
和
L.Sjölin先生
氧化和还原的亚硝酸盐还原酶的晶体结构
球形R
对亚硝酸盐与活性位点结合的pH依赖性提供新的见解。
PDB参考
:
亚硝酸盐还原酶,氧化,1zv2,r1zv2sf
;
减少,2a3t,r2a3tsf
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《水晶学报》。
(2005).
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61
,
1199-1206
https://doi.org/10.107/S090744905017531
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萘酸合酶(MenB)的结构
结核分枝杆菌
以本机形式和产品绑定形式
J.M.约翰斯顿
,
V.L.Arcus公司
和
E.N.贝克
用X射线晶体学测定了萘酸合成酶(MenB)及其与产物萘酰辅酶A的配合物的晶体结构,其分辨率为2.15和2.30
分别为:。
天然结构显示活性位点周围有几个柔性区域,这些区域仅被结合配体部分硬化。
PDB参考
:
门B、1rjm、r1rjmsf
;
MenB–萘酰辅酶A络合物,1rjn,r1rjnsf
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《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
1207-1212
https://doi.org/10.107/S090744905017841
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一种推测的2′-5′RNA连接酶的结构
霍里克希热球菌
P.H.Rehse先生
和
T.H.塔希罗夫
推测的2′-5′RNA连接酶的晶体结构
P.horikoshii先生
已求解并与
嗜热菌
同源物和结构相关的环状磷酸二酯酶。
PDB参考
:
推测的2′-5′RNA连接酶,1vdx,r1vdxsf
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《水晶学报》。
(2005).
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61
,
1213-1221
https://doi.org/10.1107/S907444905018317
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甘油醛-3-磷酸脱氢酶的结构
恶性疟原虫
J.F.萨切尔
,
R.L.马尔比
,
C.S.罗
,
A.阿迪萨
,
A.E.Alpyurek公司
,
N.Klonis公司
,
B.J.史密斯
,
L.蒂利
和
P.M.科尔曼
的结构
恶性疟原虫
GAPDH已解为2.6
用一个NAD分子拆分
+
每亚单位结合。
氨基酸替代物聚集在
R(右)
dyad表明血红素有一个潜在的结合位点,已知其能特异性抑制
疟原虫
酶。
PDB参考
:
甘油醛-3-磷酸脱氢酶,1ywg,r1ywgsf
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(2005).
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61
,
1222-1226
https://doi.org/10.107/S090744905018834
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酵母5-氨基乙酰丙酸脱水酶与抑制剂5-羟基乙酰丙酸复合物的结构
P.T.厄斯金
,
L.科茨
,
R.纽黑德
,
A.A.布林德利
,
F.斯塔弗
,
G.D.E.比文
,
R.吉尔
,
A.焦化装置
,
S.P.木材
,
M.J.沃伦
,
P.M.Shoolingin-约旦
,
R.内尔
和
J.B.库珀
以1.9的分辨率测定了酵母中5-氨基乙酰丙酸脱水酶(ALAD)与竞争抑制剂5-羟基乙酰丙酸络合后的X射线结构
Å。
PDB参考
:
5-氨基乙酰丙酸脱水酶,1w31,r1w31sf
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《水晶学报》。
(2005).
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61
,
1227-1237
https://doi.org/10.107/S090744905019360
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改进RIP的辐射损伤子结构
纳奥先生
,
G.M.谢尔德里克
和
R.B.G.拉维利
提出了一种处理RIP数据的简单方法,该方法提高了RIP子结构的质量以及下游相位应用的相位。
PDB参考
:
弹性蛋白酶,2blo,r2blosf
;
2blq、r2blosf
;
胰岛素,2bn3,r2bn3sf
;
2bn1,2bn1sf
;
溶菌酶,2blx,r2blxsf
;
2bly、2blysf
;
核糖核酸酶A,2blp,r2blpsf
;
2亿英镑,2亿英镑
;
索默丁,2blr,r2blrsf
;
2blu,r2blusf
;
胰蛋白酶,2blv,r2blvsf
;
2blw,r2blwsf
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《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
1238-1244
https://doi.org/10.107/S090744905019761
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克服直接法中的假极小问题:噬菌体φ13包装酶P4的结构测定
C.梅耶
,
E.J.曼奇尼
,
D.H.Bamford先生
,
M.A.沃尔什
,
D.I.斯图亚特
和
J.M.格里姆斯
描述了噬菌体φ13包装酶P4的定相和结构测定过程中遇到的问题,这些问题是由组成晶体不对称单元的四个六聚体的排列引起的。
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《水晶学报》。
(2005).
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61
,
1245-1254
https://doi.org/10.107/S090744905020251
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的结构
恶性疟原虫
嘌呤核苷磷酸化酶与硫酸盐及其天然底物肌苷的复合
C.施尼克
,
M.A.Robien先生
,
A.M.布尔佐夫斯基
,
E.J.多德森
,
G.N.穆尔舒多夫
,
L.安德森
,
J.R.勒夫特
,
C.梅林
,
W.G.J.霍尔
,
J.A.布兰尼根
和
A.J.威尔金森
报道了疟疾嘌呤核苷磷酸化酶(PNP)与肌苷和硫酸盐的复合物。
这些结构与以前的结构进行了比较
恶性疟原虫
PNP与过渡态抑制剂复合体。
PDB参考
:
功率因数
PNP–ino、2bsx、r2bsxsf
;
功率因数
PNP–销售
4
,1sq6,r1sq6sf
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《水晶学报》。
(2005).
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61
,
1255-1262
https://doi.org/10.107/S090744905021207
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的结构
刺五加
胰蛋白酶抑制剂II(EETI-II):一种刚性分子支架
R.Krätzner先生
,
《期刊》。
德布赖采尼
,
T.帕佩
,
T.R.施耐德
,
A.文策尔
,
H.科尔马
,
G.M.谢尔德里克
和
一、Uson
胱氨酸结蛋白EETI-II表现出特别刚性。
PDB参考
:
EETI-II,1w7z,r1w7zsf
;
胰蛋白酶–EETI-II(野生型)复合物,1h9h,r1h9hsf
;
胰蛋白酶–EETI-II(突变)复合物,1h9i,r1h9isf
阅读文章
《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
1263-1272
https://doi.org/10.107/S090744905021475
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关于软X射线在大分子晶体学中的常规应用。
第三部分最佳数据收集波长
C.米勒-迪克曼
,
S.Panjikar公司
,
P.A.塔克
和
M.S.Weiss先生
根据在不同X射线波长下进行的大量实验对异常信噪比的评估,发现衍射数据采集的最佳波长接近2.1
不管异常散射子结构的性质如何。
PDB参考
:
ConA-Xe、2a7a、r2a7asf
;
自适应-Xe,2a7b,r2a7bsf
;
PPE-Xe、2a7c、r2a7csf
;
HEL-Xe,2a7d,r2a7dsf
;
DNA,2a7e,r2a7esf
;
HEL、2a7f、r2a7fsf
;
嗜热菌蛋白酶,2a7g,r2a7gsf
;
胰蛋白酶,2a7h,r2a7hsf
;
thaumatin,2a7i,r2a7isf
;
PPE-Ca、2a7j、r2a7jsf
阅读文章
《水晶学报》。
(2005).
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61
,
1273-1279
https://doi.org/10.107/S090744905021487
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新型晶型氨基糖苷乙酰转移酶AAC(6′)-Ii的结构:结构和正常模式分析
D.L.伯克
,
B.熊
,
C.布莱特巴赫
和
A.M.Berghuis公司
抗生素抗性因子AAC(6′)-Ii在与辅酶A的复合物中的结构以一种新的晶体形式被确定。将该结构与先前确定的复合物进行比较,并结合正态分析,揭示了构象可塑性,这可能对酶促机制很重要。
PDB参考
:
AAC(6′)-Ii,2a4n,r2a4nsf
阅读文章
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(2005).
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61
,
1280-1288
https://doi.org/10.107/S090744905021566
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水凝胶珠中的蛋白质结晶
R.威拉德
,
I.泽格斯
,
L.Wyns公司
和
M.斯勒特尔
本文探讨了水凝胶珠在蛋白质结晶中的应用。
阅读文章
《水晶学报》。
(2005).
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61
,
1289-1298
https://doi.org/10.107/S090744905022316
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汞衍生物辐射引起的特定场所损害:阶段划分及其影响
美国拉马戈帕尔
,
Z.道特
,
R.Thirumuruhan先生
,
E.费多罗夫
和
S.C.阿尔莫
对Hg衍生晶体收集的数据进行分析表明,汞-半胱氨酸键非常容易受到辐射损伤。
阅读文章
短通信
《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
1299-1301
https://doi.org/10.107/S090744905019591
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大分子结构中的体积溶剂校正
B.里斯
,
L.詹纳
和
M.Yusupov先生
结果表明,在
中枢神经系统
在大分子结构的情况下,可能导致不正确的结果。
提出了一种改进的溶剂掩模定义方法。
阅读文章
《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
1302-1305
https://doi.org/10.107/S090744905019670
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重原子数据库系统
:基于氨基酸序列和结晶条件制备蛋白质晶体重原子衍生物的工具
M.Sugahara先生
,
Y.Asada(亚萨达)
,
H.阿亚玛
,
H.Ukawa公司
,
H.塔卡
和
N.Kunishima公司
重原子数据库系统
是一个帮助蛋白质重原子衍生化的程序。
基于氨基酸序列/基序和结晶条件,该程序通过搜索已知重原子衍生物的数据库,为任何目标蛋白推荐潜在的重原子试剂。
阅读文章
《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
1306-1310
https://doi.org/10.107/S090744905018822
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表面活性还原在人胆碱乙酰转移酶结晶中的应用
A.-R.金
,
T.多布兰斯基
,
R.J.莱利特
和
B.H.希尔顿
采用表面还原法获得高质量的人胆碱乙酰转移酶晶体。
阅读文章
补遗和勘误表
《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
1311
https://doi.org/10.107/S090744905024996
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参数空间筛选:用于高通量晶体结构测定的强大工具。
勘误表
Z.-J.刘
,
D.林
,
W.Tempel公司
,
J.L.普拉斯曼
,
J.P.罗斯
和
B.-C.王
论文的更正
线路接口单元
等。
(2005),
《水晶学报》。
D类
61
, 520–527
.
阅读文章
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(2005).
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61
,
1312
https://doi.org/10.107/S090744905019621
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解开龙虾壳着色机制的结构化学。
勘误表
N.E.Chayen公司
,
M.Cianci先生
,
J.G.格罗斯曼
,
J.哈巴什
,
J.R.海利维尔
,
G.A.Nneji公司
,
J.拉弗瑞
,
P.J.里兹卡拉
和
P.F.扎加尔斯基
论文的勘误表
Chayen公司
等。
(2003),
《水晶学报》。
D类
59
, 2072–2082.
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