（IUCr）结晶学报第D节第57卷第2部分，2001年2月

《水晶学报》。(2001).D类57，181-186
doi:10.1107/S090744900018023

为什么大自然会结巴？重复氨基酸链的调查

E.F.梅耶和小W.J.Tollett

对含有极不可能的单链氨基酸的可用数据库进行了调查。本文最后向晶体学界提出了一个挑战，即在这一被忽视的领域探索结构-功能关系的结构起源。

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细胞溶质牛视网膜肌酸激酶的三维结构

D.蒂西，B.巴克斯和A.勒夫

肌酸激酶催化磷酸部分从磷酸肌酸到ADP的可逆转移，生成肌酸和ATP。细胞溶质脑型肌酸激酶2.3的结构报告了奥数。

PDB参考:细胞溶质牛视网膜肌酸激酶，1g0w

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羟基腈裂解酶的结构马尼奥特·埃斯库伦塔与底物丙酮和氯丙酮的络合物：对氰化机理的启示

H.劳布尔，S.Förster公司，B.米利希，H.瓦詹特和F.埃芬伯格

羟基腈裂解酶的X射线结构埃斯库伦塔支原体研究了丙酮和氯丙酮的配合物。观察到的结合表明，酶利用一般的碱机制来催化反应。结合其他动力学数据，对底物特异性进行了讨论。

PDB参考:MeHNL–丙酮络合物，1dwo;MeHNL–氯丙酮络合物，1dwq

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含苯基半乳糖衍生物对耐热肠毒素和霍乱毒素GM1受体结合位点的探索

E.风扇，E.A.Merritt公司，Z.张，J.C.皮肯斯，C.蟑螂，安先生和W.G.J.霍尔

热胆汁性肠毒素来自大肠杆菌（LT）和与之密切相关的霍乱毒素是世界范围内大量严重腹泻病例的原因。本文的晶体学研究表明，由半乳糖锚定构建并含有多种取代苯基环系统的化合物如何与LT的受体结合位点相互作用。

PDB参考:书信电报B类–PAPG，1efi;计算机断层扫描B类–MNPG，1eei;书信电报B类–BAPG，第1页，共7页;书信电报B类–PEPG，1eef

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在1.15下RNA/DNA杂交十聚物的直接方法测定奥数分辨率

G.W.韩

本文报道了1.15℃HIV-1多尿路RNA/DNA杂交十聚体caaagaaaag/CTTTCTTTG的晶体结构测定 Å. 这种混合十聚体是迄今为止由从头算在这个分辨率下限下直接使用方法。

PDB参考:RNA/DNA杂交，1g4q

NDB参考:AH0012型

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一种RNA双链的结构，在1.6时具有异常的G·C对，呈摆动状构象奥数分辨率

M.Perbandt先生，M.Vallazza先生，C.李普曼，C.贝策尔和V.A.埃尔德曼

RNA双链r（CUGGGCGG）·r（CCGCCUGG）的结构已确定为1.6 奥决议并细化为最终决议R（右）系数为18.3%(R（右）_自由的 = 24.1%).

NDB参考:r（CUGGGCGG）·r（CCGCCUGG），AR0012

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3-异丙基苹果酸脱氢酶172位点突变酶的设计、X射线晶体学、分子模型和热稳定性研究嗜热菌

C.曲，S.Akanuma公司，N.田中，H.森山和T.大岛

热稳定性之间的关系嗜热杆菌IPMDH在残基172处突变，取代残基的疏水性取决于其在取代残基附近的详细结构。

PDB参考:A172F，1gc8;A172G，1gc9;A172V，1g2u

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用氪进行MAD定相

A.科恩，P.埃利斯，N.Kresge公司和S.M.Soltis公司

两种蛋白质的阶段，17 抹香鲸kDa-Fe蛋白肌红蛋白(猫齿P)和一个18 绿鲍kDa蛋白（SP18）(H.富尔根斯)使用Kridge MAD和冷冻晶体证明了该技术作为常规结构测定方法的可行性。

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卤化物用于大分子结构定相的实际经验：结构基因组学的强大工具

Z.道特，李先生和A.瓦洛达尔

与卤化物盐（如Br）一起使用短低温浸泡⁻根据解决大分子结构的成功经验，讨论了相化大分子结构假单胞菌属羧基蛋白酶，一种分子量为≃40的酶 kDa，通过单波长反常衍射。

PDB参考:胃蛋白酶抑制素不敏感羧基蛋白酶1ga1

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MAD数据的直接方法辅助定相

Y.X.顾，Y.D.刘，Q.郝，S.E.伊里克和高压风机

MAD阶段可以通过合并直接方法程序进行补充和改进。

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全长人RPA14/32二聚体的动态光散射分析：纯化、结晶和自结合

J.E.哈贝尔，J.F.Ohren（J·F·奥伦）和G.E.O.Borgstahl公司

本文描述了利用动态光散射改进纯化、改善结晶以及研究全长人类复制蛋白A异二聚体的自结合。

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全长CysB的结晶产气克雷伯菌，LysR型转录调节器

K.H.G.Verschueren公司，C.艾迪，E.J.多德森和A.J.威尔金森

来自产气杆菌无论有无诱导剂N个-乙酰丝氨酸和四种不同的晶体形式。

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一种抗菌蛋白的结晶和初步晶体学研究睑板炎零

S.C.哈，K.最小值，J.C.古，Y.Kim先生，D.J.Yun（D.J.云），M.J.Cho先生和K·K·金

抗菌蛋白来自P.无已结晶，并在1.78收集了本地数据同步辐射X射线的光学分辨率。

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转羧酶12S中心亚基的结晶及初步X射线分析谢尔马尼丙酸杆菌

Y.-F.王，D.C.凯悦酒店，R.E.里维拉，P.R.凯里和V.C.Yee公司

转羧化酶多酶复合物12S中心亚基的几种晶型谢尔马尼已经长大了。与甲基丙二酰CoA或丙二酰辅酶A衬底共结晶生成具有改进衍射和与CdCl共结晶的晶体形式₂进一步提高晶体稳定性。

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AML1的DNA-结合runt结构域的结晶及初步研究

S.Bäckström公司，S.-H.黄，M.沃尔夫·沃茨，X.-Q.谢，T·哈德，T.Grundström和U.H.绍尔

AML1的DNA结合域在空间群中结晶C类2和R（右）研究发现，添加DNA可以提高晶体质量，而不会将DNA并入晶格。晶体衍射到1.7和2.0 中的奥数C类2和R（右）分别为32。

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基因克隆、表达、结晶和初步X射线分析嗜热菌精氨酸-tRNA合成酶

A.岛田，O.努雷基，N.多马，K.Takio公司和横山由纪夫

精氨酸-tRNA合成酶基因嗜热杆菌克隆并结晶重组蛋白。X射线数据是从闪冻的天然晶体收集到2.3 Å分辨率。

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TM1442基因产物的结晶和初步X射线晶体学分析海洋热托加，同系物枯草芽孢杆菌抗igma因子

K.S.Ha公司，J.E.Kwak先生，B.W.韩，J.Y.Lee先生，J.月亮，B.I.李和S.W.Suh先生

TM1442基因产物来自马里蒂玛锥虫过度表达和结晶(P（P）2₁;一= 31.54,b条= 116.83,c（c）= 31.39 Å, β = 119.84°). 衍射数据已收集到2.0 同步辐射X射线的光学分辨率。

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二型脱氢醌酶的结晶和初步X射线晶体学分析幽门螺杆菌

J.E.Kwak先生，J.Y.Lee先生，B.W.韩，J.月亮，S.H.索恩和S.W.Suh先生

Ⅱ型脱氢喹啉酶幽门螺杆菌过度表达和结晶(P（P）4₂32,一=b条=c（c）= 98.91 Å). 衍射数据已收集到2.5 使用同步辐射的光学分辨率。

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Tn中氯霉素乙酰转移酶的结晶和初步X射线衍射分析2424

周先生，M.-L.卢，W.邱，R.L.坎贝尔，V.纳胡姆，J.拉波因特，P.H.罗伊和S.-X.林

来自Tn的B2类2424，一个3×23.5的同源三聚体 kDa已结晶；晶体的空间群是P（P）2₁3，带unit-cell参数一= 130 Å. 2.7收集了完整的数据集 Å分辨率。

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一种γ-内酰胺酶的结晶和初步X射线分析

I.S.贡萨尔维斯，M.N.Isupov先生和J.A.小男孩

γ-内酰胺酶晶体C.转酸菌已通过坐滴蒸发扩散技术从表达于大肠杆菌.三斜晶衍射至2.0 Å分辨率。

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初步结构研究大肠杆菌异戊烯焦磷酸异构酶

Y.乌贾马，V.杜贝克，G.塞恩斯，B.克兰廷，C.三角帆，五、史泰龙，V.维莱和L.德罗格曼

大肠杆菌异戊烯基二磷酸异构酶是以硒代亚砜的形式产生的，蛋白质是通过悬挂滴气相扩散法结晶的。晶体显示具有单位-细胞参数的三角对称性一=b条= 71.3,c（c）= 61.7 ？并衍射至1.45 Å分辨率。

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血管疾病相关酶人重组胱硫堇β-合成酶活性核心的结晶和初步X射线衍射分析

M.Janosik先生，M.Meier先生，V.凯里，J.奥利维里乌索娃，P.Burkhard先生和J.P.克劳斯

X射线质量的晶体是一种截短形式的胱硫醚β合成酶，它是一种与血管疾病有关的酶，含有PLP和血红素辅因子。

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天然型和磷酸化型产孢因子SpoIIAA的结晶和初步X射线分析

P.R.西弗斯，R.J.刘易斯，J.A.布兰尼根和A.J.威尔金森

衍射数据达到1.6和2.25 已从抗igma因子拮抗剂SpoIIAA的晶体中收集到了λ分辨率球形芽孢杆菌分别以天然形式和磷酸化形式。

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纯化、结晶和初步X射线数据大肠杆菌GlmU：一种双功能乙酰基转移酶/尿苷酰转移酶

L.R.奥尔森，Y.Tian先生和S.L.罗德里克

的晶体大肠杆菌GlmU与辅酶A和UDP-GlcNAc形成络合物。这些晶体属于太空群R（右）32，带单元间参数一=104.5，c（c）=648.2 λ，并将X射线衍射至至少2.1 Å分辨率。

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结晶和初步X射线分析伯氏疏螺旋体外表面蛋白C（OspC）

D.库马兰，S.Eswaramoorthy公司，J.J.邓恩和S.斯瓦米纳坦

HB19菌株的外表面蛋白C（OspC）B.伯格多费里已结晶，本机数据扩展到2.2 已收集分辨率。

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来自的[2Fe–2S]铁氧还蛋白（FdVI）的结晶和初步X射线衍射分析红细胞

J.阿蒙加德，G.塞恩斯，Y.Jouanneau先生和L.C.Sieker公司

一种可能参与铁硫簇生物合成的细菌[2Fe–2S]铁氧还蛋白首次结晶。晶体是从中过量生产的重组蛋白中获得的大肠杆菌; 计划在铁边进行MAD实验以解决该结构。

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蛋白质的结晶和初步X射线衍射分析L（左）-异天门冬氨酰O（运行）-小麦胚芽甲基转移酶

阿马拉医学博士，L.Chen先生，D.查托帕迪亚，C.D.史密斯和E.J.Meehan先生

WPIMT是一种在小麦胚芽中发现的蛋白质甲基转移酶，已被纯化至均匀状态，并在S公司-腺苷-L（左）-同型半胱氨酸。晶体衍射到3.3 和属于四方空间群P（P）4₁2₁2或P（P）4_三2₁2

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多种晶型的鉴定巢状曲霉去氢醌合酶

C.E.尼科尔斯，J.Ren（任正非），H.羔羊，F.霍尔丹，A.R.霍金斯和D.K.冲压件

获得了9种不同的脱氢喹啉合酶晶体形式，并对其进行了表征。描述了含有抑制剂、辅因子和未连接酶的配合物晶体。

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天然和硒蛋氨酸果糖-1,6-二磷酸醛缩酶的结晶和初步X射线分析水热Thermus aquaticus

V.Sauvé和J.Sygusch公司

来自嗜热菌的重组果糖-1,6-二磷酸醛缩酶水生T在两种条件下结晶。在条件I下生长的天然晶体衍射为2 在条件II下生长的钇和SeMet晶体衍射到2.6 Å.

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提纯、结晶和初步X射线分析大肠杆菌葡萄糖-1-磷酸酶

Z.贾，M.科特里尔，G.P.帕尔，D.李，M.Sung先生，C.W.Forsberg先生和J.P.菲利普斯

大肠杆菌葡萄糖-1-磷酸酶水解葡萄糖-1-磷酸。重组蛋白已结晶为空间群R（右）3，在不对称单元中有两个单体。

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肽聚糖相关脂蛋白的结晶和初步晶体学研究大肠杆菌

C.阿贝格尔，A.沃尔伯格，S.Chenivesse公司和C.拉兹敦斯基

109个C末端残基的晶体大肠杆菌已生产出Pal基因产品。目前正在生产硒代蛋氨酸取代的截短Pal蛋白，以便使用MAD方法解决Pal结构。

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豇豆重组磷脂酶D的结晶及初步晶体学研究(长爪Vigna unguiculataL.Walp）

C.阿贝格尔，A.阿布萨勒姆，S.Chenivesse公司，里维尔先生，A.-M.穆斯塔加斯-加的斯和R.Verger公司

豇豆植物磷脂酶D基因产物的晶体已经产生。晶体衍射到1.94 Å. 目前正在生产使用蛋白质的钙结合位点和磷脂结合位点的重原子衍生物。

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晶体的结晶和周质结构域的初步晶体学研究大肠杆菌TolR蛋白

C.阿贝格尔，L.旅程，S.Chenivesse公司，M.加维奥利和R.Lloubès先生

周质域晶体大肠杆菌TolR基因产物已经产生。硒代蛋氨酸取代的截短Pal蛋白目前是为了利用MAD方法解决TolR结构而产生的。

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细菌铁蛋白的结构测定脱硫弧菌采用MAD法测定FeK（K）-边缘

A.V.科埃略，南马其顿，P.M.马蒂亚斯，A.W.汤普森，J.勒加尔和M.A.Carrondo先生

细菌铁蛋白分离自D.脱硫菌使用在K（K）-壳铁边缘。

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一种求解RNA结构的有效方法：用锌代替镁进行MAD定相

E.恩尼法尔，P.沃尔特和P.杜马

利用多波长反常分散技术，成功地解决了46核苷酸RNA复合物的结构问题K（K）边缘。

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漆酶的结构灰鸡腿菇1.68 Δ分辨率：不同“2型Cu-depleted”亚型的证据

V.杜克罗斯，A.M.布尔佐夫斯基，K·S·威尔逊，P.Ø斯特加德，P.施耐德，A.斯文森和G.J.戴维斯

真菌“蓝色”多铜氧化酶漆酶的三维结构C.cinereus公司1.68 奥揭示了2型铜亏损物种亚型的结构基础。

PDB参考:C.cinereus公司漆酶（2.2 Å, 293 K），1a65;C.cinereus公司漆酶（1.68 Å, 100 K），1小时

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光谱蛋白SH3结构域突变体的原子分辨结构

R.贝里西奥，A.维圭拉，L.塞拉诺和M.Wilmanns先生

SH3结构域突变体的晶体结构已在1.12处得到细化奥分辨率。这种结构可以在分子水平上解释动力学和热力学实验数据。

PDB参考:SH3域突变体，1g2b

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四泛素新晶型的结构

C.L.菲利普斯，J.投掷器，C.M.皮卡尔和C.P.希尔

将一种新的泛素结构与先前确定的泛素结构进行比较，发现相邻泛素部分之间的连接非常灵活。这表明，有关多泛素构象的知识需要结合到目标蛋白的多泛素结构。

PDB参考:四泛素，1f9j

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含2′-脱氧-5-甲酰尿苷的DNA十二聚体的结晶和初步X射线分析；镁阳离子在Dickerson型DNA十二聚体结晶中的作用是什么？

Tsunoda先生，N.卡里诺，Y.上野，A.松田和A.竹中

在Dickerson型DNA十二聚体的结晶过程中，一个五元环的水分子可以取代水合镁离子，以连接晶格中相邻的双工体，尽管镁离子更有效，并以略高的分辨率进行X射线衍射。

PDB参考:DNA十二碳复合体，1g75;1g8n公司;1g8单位;1g8伏

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中子蛋白质晶体学——现状与展望

T.Gutberlet公司，U.海涅曼和M.斯坦纳

本文综述了中子蛋白质晶体学的现状和未来前景，并简要讨论了中子在生物学中的相关性。

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