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第一次,从头算直接法已被用于求解RNA/DNA杂交十聚体的晶体结构。RNA/DNA序列对应于息肉尿路(PPT)最左侧三分之二的区域,PPT是HIV-1逆转录酶(RT)合成第二链DNA的引物。直接方法使用摇晃和烘焙(SnB公司)使用1.15Å的数据得出了RNA/DNA十聚体分子的溶液,这刚好处于直接方法的分辨率边缘。96%整个分子的原子位置,包含514个非H原子,包括三个Ca2+离子,很容易从基于`摇晃和烘焙'最小功能和克鲁克阶段重新定义程序。傅里叶图谱中只缺少六个原子,主要是糖链中的原子。目前R(右)模型系数为0.143(R(右)自由的=0.186)。RNA/DNA螺旋的构象为A型,具有典型的A螺旋微槽宽度。本文介绍了求解此结构的方法。

支持信息

NDB参考:AH0012型

PDB参考:RNA/DNA杂交,1g4q


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