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表达式探查器

swMATH ID: 8351
软件作者: 贾克·维洛(Jaak Vilo)、米沙·卡普什斯基(Misha Kapushesky)、帕特里克·凯默伦(Patrick Kemmeren)、乌吉斯·萨尔坎斯(Ugis Sarkans)、阿尔维斯·布拉斯马(Alvis Brazma)
描述: 表达式分析器(EP,网址:http://ep.ebi.ac.uk/)是一套用于分析和解释基因表达和其他功能基因组数据的工具。这些工具执行表达数据聚类、可视化和分析,将表达数据与蛋白质相互作用数据和功能注释(如GeneOntology)集成,以及分析启动子序列以预测转录因子结合位点。一些用于序列模式发现的聚类分析方法实现和工具为各种类型的生物数据提供了丰富的数据挖掘环境。所有工具都是基于Web的,对浏览器的要求最低。分析结果与其他数据库交叉链接,并且可以在Internet上使用工具。这样可以进一步集成工具和数据库;例如,Array Express等公共微阵列基因表达数据库。
主页: http://rd.springer.com/chapter/10.1007%2F0-387-21679-0_6
相关软件: 生物导体;塔维纳;R(右);Matlab公司;Globus工具包;阿斯卡隆;ICEP公司;PERL语言;阵列Express;网络阵列;CARMAweb公司;limmaGUI公司;结婚输入;S-PLUS系统;椭圆;POE公司;基因俱乐部;马诺瓦;山姆;电子束阵列
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