CliqueTop(单击顶部) swMATH ID: 29766 软件作者: 朱斯蒂C 描述: CliqueTop是一组用于对称矩阵拓扑分析的matlab脚本。对于任何对称矩阵A,使用该包的语法为:ompute_clique_topology(A)。可以在compute_clique_topology函数的文档中找到选项和详细信息。CliqueTop目前依赖于以下软件包,为了方便起见,这些软件包包含在这个存储库中,并且应该在不安装的情况下自动运行:对于持久同源性计算,我们使用Vidit Nanda的Perseus。在撰写本文时,可以在以下位置找到当前版本网址:http://www.sas.upenn.edu/vnanda/perseus/index.html。我们建议使用此存储库中提供的快照,因为Perseus的输入/输出格式将来可能会更改。Cliquer,对于团枚举算法的团分裂版本,由Sampo Niskanen和Patric R.J.Østergárd编写的C包,可在http://users.aalto.fi/pat/cliquer.html。该代码由Chad Giusti编写,其基本思想是与Vladimir Itskov和Carina Curto联合工作的结果。这项工作得到了NSF DMS-1122519的支持。更多细节可以在Giusti、Pastalkova、Curto和Itskov中找到,“团拓扑揭示了神经相关性的内在几何结构。”(arXiv:1502.06172[q-bio.NC]和arXiv:1502.06173[q-bio.NC]) 主页: https://github.com/nebneuron/clique-top 源代码: https://github.com/nebneuron/clique-top 依赖项: Matlab公司 相关软件: 洞;持久性图像;裂土器;github;javaPlex公司;叫做古迪辛;狄奥尼索斯;埃雷内;SciPy公司;TDA公司;乔托-塔达;大脑连接工具箱;脂肪酸;珀尔修斯;AGL分数;拓扑网络;爱马仕;j孔;旗手;麦考利2 引用于: 42文件 标准条款 1出版物描述软件,包括1出版物在zbMATH中 年份 团拓扑揭示了神经关联的内在几何结构。 Zbl 1355.92015年乍得朱斯蒂;伊娃·帕斯塔尔科娃;卡琳娜·库托;弗拉基米尔·伊茨科夫 2015 全部的 前5名133位作者引用 4 卡琳娜·帕梅拉·库托 4 Michael T.绍布。 2 丹妮尔·巴塞特。 2 乍得朱斯蒂 2 格罗斯,伊丽莎白 2 丹尼尔·埃尔南德斯·塞拉诺 2 萨拉·卡利什尼克·维罗夫舍克 2 兰比奥特,雷诺 2 梅莫利、法孔多 2 Neuhäuser,Leonie 2 聂春晓 2 乔瓦尼·佩特里 2 兹维·罗森 2 达里奥·桑切斯·戈梅斯 2 魏国伟 1 尼尔·安德烈亚斯·巴斯 1 费德里科·巴蒂斯顿 1 罗宾·林恩·贝尔顿 1 奥斯汀·R·本森。 1 马蒂亚·朱塞佩·贝戈米 1 科西奥·贝什科夫 1 理查德·贝策尔(Richard F.Betzel)。 1 吉内斯特拉·比安科尼 1 克里斯蒂安·比克 1 安·西泽莫尔·布莱文斯 1 彼得·布贝尼克 1 米凯尔·布歇 1 曹晓春 1 朱利亚·塞塞蒂 1 Eduarda Gervini Zampieri森特诺 1 沃伊切赫·查霍尔斯基 1 陈家辉 1 萨米尔·乔杜里 1 洛林·克劳福德 1 亚历山德罗·德·格雷戈里奥 1 丁、李 1 安东·多希特曼 1 琳达·杜 1 本杰明·邓恩 1 Eliasi Rad,蒂娜 1 艾默生·G·埃斯科拉。 1 专家,保罗 1 布列塔尼·特雷泽·法西 1 费里,马西莫 1 乌尔德里科·福加奇 1 安娜·露西亚·加西亚·普利多 1 帕斯卡·格兰奇 1 海瑟·A·哈灵顿。 1 胡安·埃尔南德斯·塞拉诺 1 凯瑟琳·赫斯。 1 保罗·霍恩(Paul S.Horn)。 1 胡萍 1 迈克尔·B·赫尔。 1 伊阿科皮尼,伊阿科波 1 弗拉基米尔·伊茨科夫 1 阿里·贾德巴比 1 乔纳森·贾奎特 1 杰弗里斯,杰克 1 阿里·卡恩 1 Kim,Woojin先生 1 亚历山大·库宁(Alexander B.Kunin)。 1 维托·拉托拉 1 Lehn,克里斯蒂安 1 冷辉 1 李少梅 1 李伟 1 凯特琳·连凯佩尔 1 林乐亨 1 弗拉达·利米奇 1 加博尔·利普纳 1 刘健 1 刘树新 1 马克西姆·卢卡斯 1 安德鲁·梅勒 1 罗斯蒂克·默茨 1 塞缪尔·米卡 1 大卫·L·米尔曼。 1 莫诺德、安提亚 1 朱利亚·莫雷尼 1 凯瑟琳·莫里森 1 Daan Mulder 1 格雷戈里·奈扎特 1 穆罕默德·奥马尔 1 乔舒亚·白克 1 伊娃·帕斯塔尔科娃 1 爱丽丝·巴塔尼亚 1 德鲁夫·帕特尔。 1 帕蒂尼奥·加林多,胡安·安格尔 1 尼古拉·奎西奥利 1 艾米丽·里班多·格罗斯 1 伊戈尔·里文 1 埃里克·里巴肯 1 丹尼尔·萨利纳斯 1 费尔南多·安托尼奥·诺布雷加·桑托斯 1 萨拉·斯卡拉穆恰 1 安娜·申菲施 1 约旦舒巴赫 1 本杰明·施韦恩哈特 1 Shiu,Anne(安妮·休) 1 安·西莫尔(Ann E.Sizemore)。 …还有33位作者 全部的 前5名30篇连载文章中引用 三 SIAM审查 2 非线性科学与数值模拟中的通信 2 SIAM应用代数和几何杂志 1 生物控制论 1 反问题 1 统计物理杂志 1 生理学A 1 《物理快报》。一个 1 物理报告 1 混沌、孤子和分形 1 应用数学与计算 1 欧洲组合数学杂志 1 应用数学进展 1 离散和计算几何 1 神经计算 1 计算几何 1 美国国家科学院院刊 1 美国数学学会公报。新系列 1 国际应用科学与工程分叉与混沌杂志 1 分形 1 计算神经科学杂志 1 范畴的理论与应用 1 复杂性 1 数学学报。英语系列 1 机器学习研究杂志(JMLR) 1 应用数学与工业数学的交流 1 应用与计算拓扑杂志 1 计算和数学生物物理 1 数据科学基础 1 组合理论 全部的 前5名21个领域引用 20 代数拓扑(55-XX) 16 组合数学(05-XX) 14 生物学和其他自然科学(92-XX) 9 博弈论、经济学、金融和其他社会和行为科学(91-XX) 8 统计学(62-XX) 8 计算机科学(68至XX) 三 交换代数(13-XX) 三 流形和细胞复合体(57至XX) 三 统计力学,物质结构(82-XX) 三 信息与通信理论、电路(94-XX) 2 代数几何(14-XX) 2 测量和集成(28-XX) 2 动力系统和遍历理论(37至XX) 2 概率论与随机过程(60-XX) 2 运筹学、数学规划(90-XX) 1 总体主题;集合(00-XX) 1 范畴理论;同调代数(18-XX) 1 常微分方程(34-XX) 1 凸和离散几何(52至XX) 1 一般拓扑结构(54至XX) 1 系统论;控制(93至XX) 按年份列出的引文