酶的分类

什么是酶分类?

酶分类基于国际生物化学和分子生物学联合会(IUBMB)。您可以浏览酶分类,网址为EXPASY酶探索酶.

PDB根据催化的化学反应类型、参与反应的化学基团的特定供体和受体等,将EC(酶委员会)编号分配给结构中的相关蛋白链,所有这些都基于UniProtKB、GenBank、KEGG或作者规范的信息。注:浏览器包括酶,其EC编号已分配给PDB中的结构。

为什么按EC分类浏览?

EC分类将执行相同或相关酶功能的酶分组。您可以使用EC浏览器探索具有类似功能、酶形状和/或执行酶反应的氨基酸排列的酶。它还可以用于识别和探索功能相似但形状和/或酶反应机制不同的酶的结构。

如何使用EC浏览器?

用户可以通过在页面顶部的搜索框中键入特定的酶名称或EC编号(部分或全部)来浏览EC类名。

在EC浏览器树中找到感兴趣的酶后,查看该组中包含的聚合物实体(蛋白质)的数量。点击工艺名称旁边列出的数字,将启动对PDB中与该EC类别相关的所有聚合物实体的搜索。

例子

DNA聚合酶是一种负责复制遗传物质以制造新DNA拷贝的酶,可按如下方式搜索其结构:

  • 浏览树中的“转移酶”>>“转移含磷基团”>>“核苷酸转移酶”和“DNA定向DNA聚合酶”或
  • 通过在页面的搜索框中键入DNA聚合酶进行搜索,并从选项“DNA-directed DNA polymerase”中选择,或键入EC编号(类型2.7.7.7)


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上次更新时间:2024年6月25日