什么是疾病本体论?
蒙多疾病本体旨在协调世界各地的疾病定义。学习关于Mondo DO的更多信息.
目前,描述疾病的各种资源使用了许多不同的定义——有时这些定义重叠,有时相互冲突。这使得来自这些源的映射信息不完整、不一致和不准确。创建Mondo疾病本体论是为了为疾病定义提供统一的、基于逻辑的分类。它描述了构成疾病的个体表型特征。蒙多病本体论的发展与人类表型本体论(HPO)相协调,并为疾病的分类或“卷起”到更高级别的分组提供了层次结构。它提供到其他疾病资源的映射,以便我们知道两个疾病名称或标识符何时相等。
MONDO中的疾病定义已被知识管理中心(KMC)映射到UniProt序列,用于照亮可制药基因组(IDG)计划,并可用于映射到UniProt的PDB实体。
为什么按疾病本体浏览?
疾病本体浏览器允许用户识别和探索与特定疾病相关/受其影响的聚合物实体的结构。这些蛋白质实体的结构可以单独检查或分组,以查看这些蛋白质中是否有任何共同特征或趋势,从而提供有关疾病的新见解。
疾病本体浏览器允许用户键入疾病名称,浏览一系列疾病术语以选择感兴趣的术语,或在搜索框中输入7位MONDO ID以标识相应的PDB实体。
在浏览器中找到感兴趣的疾病术语后,用户可以查看该组中聚合物的数量。单击组件名称旁边列出的数字,将启动对PDB中与其关联的所有聚合物实体的搜索。
例子
浏览PDB档案中与Lynch Syndrome(一种与癌症发病风险增加相关的遗传性疾病)相关的实体,如下所示:
- 在页面的搜索框中键入感兴趣的疾病的名称,例如“林奇综合症”,然后从选项“林奇综合征(MONDO:0005835”或
- 键入7位MONDO ID“0005835”。如果您开始键入ID 5835,则会在页面顶部的搜索框中显示自动完成建议,您可以从中选择适当的选项,以便在浏览器树中进行搜索。