此处包括哪些蜂窝组件?
描述蜂窝组件位置的词汇术语,由基因本体联盟(GO),用于在此浏览器中组织PDB结构。蜂窝组件根据其映射到PDB实体UniProt公司序列和使用结构与功能、分类和序列的集成(SIFTS公司)项目。只有当细胞成分在PDB结构中有一个蛋白质映射到它时,才会在此浏览树中列出细胞成分。
为什么要按蜂窝组件浏览?
浏览此树可以帮助识别定位在特定细胞位置/隔室中的蛋白质实体。你可以检查组合在一起的蛋白质实体的结构,看看这些蛋白质是否有任何共同的特征或趋势。
蜂窝组件浏览器允许用户键入蜂窝组件名称、选择GO术语或在搜索框中输入7位GO ID,以识别相应的PDB实体。
在浏览器中找到感兴趣的细胞成分后,用户可以查看该组中聚合物的数量。单击组件名称旁边列出的数字,将启动对PDB中与其关联的所有聚合物实体的搜索。
例子
按如下方式浏览PDB存档中位于溶酶体中的实体:
- 在页面的搜索框中键入感兴趣的细胞成分的名称,例如“溶酶体”,然后从选项“溶酶体制(GO ID:5764)”或
- 键入7位GO ID:0005764。如果您开始键入ID 5764,则会在页面顶部的搜索框中显示自动完成建议,您可以从中选择适当的选项来搜索浏览器树。