概述:分组结构

介绍

生物分子随着环境的变化而改变形状和相互作用。当这些分子与伴侣蛋白质、核酸、碳水化合物和各种小分子配体(例如离子、辅因子、抑制剂、药物)结合时,它们的分子构象和相互作用发生变化,从而使它们能够执行其特定功能。蛋白质数据库(PDB)或计算结构模型(CSM)中的每个实验结构(包括分子的全部或特定部分)都提供了在特定上下文中对分子的一瞥。为了了解分子的构象、相互作用和功能的范围,重要的是要从多个3D结构和各种数据资源中整合有关分子的相关信息,以便在各种上下文中可视化、分析和比较分子的结构。

将具有类似氨基酸序列的结构分组,并检查其属性和这些序列簇的3D结构特征,可以提供有关3D特征保存的见解,以支持特定生物功能的分子机制。学习关于序列簇和3D结构的更多信息.

什么是分组结构数据?

对结构数据进行分组有助于在高于单个结构的级别上收集有关多个结构的信息并进行探索。

RCSB.org提供的每个3D结构都包含从各种公共生物信息学数据资源中收集的信息和注释。学习有关集成数据和注释的更多信息.

RCSB.org中的分组数据有助于收集与特定属性(如序列)或研究主题相关的多个结构。研究这些结构群有助于识别和探索组中分子的性质、特征和功能的守恒和/或趋势。

这里描述的分组数据方法可以帮助收集3D结构(实验结构和CSM),并根据特定的分子特性或研究主题对其进行组织。目前,RCSB.org提供了探索的选项

  • 预定的3D结构组
  • 三维结构的自定义组
    • 按序列相似性、UniProt标识符组织查询的搜索结果

分组结构如何帮助您?

分组结构可以更广泛地了解分子的结构、功能和进化关系。

示例

浏览分组数据以了解



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上次更新时间:2022年8月30日