基因组

介绍

什么是基因组?

基因组是一套完整的基因和/或细胞或生物体的遗传物质。这是细胞用来制造蛋白质和RNA的蓝图。在一些生物中,整个基因组是作为一个大DNA分子存在的,而在其他生物中,它被组织成若干染色体。通常,参与生物过程或途径的蛋白质的基因彼此靠近,以便它们可以一起表达和/或调节。

为什么要探索基因组?

了解感兴趣的蛋白质/RNA的基因在基因组中的位置,可以深入了解其表达、功能和调节。此外,这些知识可以帮助您了解任何突变、缺失或插入内含子和基因间DNA区域对感兴趣的蛋白质/RNA功能的影响。

基因组信息是如何绘制的?

对于3D结构中的蛋白质实体[实验结构或计算结构模型(CSM)],蛋白质信息资源(个人识别码)提供UniProt标识符(蛋白质序列)和RefSeq记录(基因组DNA、转录本、蛋白质序列和各种注释的集合)之间的映射。如果此映射可用,则在该聚合物实体的“基因组”选项卡中包含相关信息。学习关于基因组视图的更多信息.

文档

界面

此选项卡显示结构中编码蛋白质的基因的信息。

图1:PDB条目7lad的细胞色素P450蛋白的基因组视图。插图显示了部分外显子和氨基酸序列的放大视图(来自两个蛋白质序列数据资源)。
图1:PDB条目7lad的细胞色素P450蛋白的基因组视图。插图显示了外显子和氨基酸序列的部分放大视图(来自两个蛋白质序列数据资源)。
  • 页面顶部显示染色体,红色箭头标记基因的位置。
  • 该基因的5'和3'序列与该基因编码的蛋白质的氨基酸序列一起显示。

学习有关使用的约定的更多信息以及如何使用此视图中显示的信息。

了解结构

从基因组观点可以学到的一些东西包括:

  • 感兴趣基因的基因和蛋白质序列翻译
  • 相关基因内含子的存在和位置
  • 根据具有单核苷酸多态性(SNP)数据和其他遗传信息(例如OMIM)的文献和/或生物信息学数据资源中的信息,将突变、插入或缺失映射到基因内含子和外显子的机会

探索其他结构

  • 了解感兴趣基因在染色体上的位置可能有助于您查找位于其附近的其他基因,并了解其表达和功能如何影响感兴趣的基因或蛋白质。


请向报告任何遇到的断开链接info@rcsb.org
上次更新时间:2022年8月31日