数据库和知识库

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Aquaria-COVID资源 结构覆盖图
绑定MOAD PDB的一个子集,包含每个高质量的配体蛋白结合示例。结合MOAD的目标是最大限度地收集分辨率高的蛋白质晶体结构,并用从文献中提取的实验确定的结合数据注释清楚识别的生物相关配体。
绑定数据库 测量的结合亲和力数据库,主要关注被认为是药物靶点的蛋白质与小的类药物分子的相互作用。
BMCD公司 生物大分子结晶数据库
布伦达 综合酶信息系统
CAZy公司 碳水化合物活性酶
CCDC公司 剑桥晶体数据中心(小分子)
冠状病毒结构特别工作组 冠状病毒结构特别工作组检查SARS和SARS-CoV-2的结构,以评估质量并尽可能改进结构。
CoSSMos公司 二级结构基序的RNA表征(RNA CoSSMos)数据库。该工具允许系统搜索所有编目的三维核酸PDB结构,这些结构包含二级结构基序,如错配、(a)对称内环、发夹环和凸起环。
Covid-19.优先生产能力.org CoV-2蛋白的验证模型可在专用、公共访问的web服务中获得
晶体学开放数据库(COD) 公开收集有机、无机、金属有机化合物和矿物的晶体结构,不包括生物聚合物
CXIDB公司 相干X射线成像(CXI)实验数据的相干X射线图像数据库
高分子运动数据库 描述蛋白质和其他大分子中发生的运动,特别是使用电影
EM数据库 CryoEM的统一数据资源
Entrez公司 NCBI数据库
酶命名法
ExPASy公司 分子生物学服务器
GenBank(基因银行) 核苷酸序列
基因卡 人类基因、蛋白质和疾病数据库
GlyCosmos公司 一个门户网站,旨在将糖科学与基因、蛋白质、脂质、途径和疾病的生命科学相结合。
GlyGen公司 碳水化合物和糖共轭物相关数据的数据集成和传播资源,为糖科学研究提供计算和信息资源及工具。
GlyTouCan公司 国际聚糖结构库,每个唯一聚糖都有唯一的登录代码。
国际能源数据库 免疫表位数据库包含与人类、非人类灵长类、啮齿动物和其他动物物种的抗体和T细胞表位相关的数据。
IMGT公司 国际ImMunoGeneTics数据库
K基础 使用户能够使用旨在帮助构建日益逼真的生物功能模型的数据和工具进行分析、共享和协作。
LS-SNP公司 人类SNP全基因组注释的网络工具。当前版本LS-SNP/PDB提供了有助于识别最可能影响生物功能的氨基酸变化SNP(nsSNP)的信息。
MEROPS公司 肽酶数据库
NAKB公司 核酸知识库
亚欧理事会 结构/功能的浏览器数据库
PDB绑定 在蛋白质数据库中专门收集所有类型的生物分子复合物的实验确定的结合亲和力数据,包括蛋白质小分子、核酸小分子、蛋白质-蛋白质和蛋白质-核酸复合物。
PDB网站 针对学生和教育工作者的简单PDB搜索
普法姆 Pfam数据库(由InterPro托管)是一个蛋白质家族的大型集合,每个家族都由多序列比对和隐马尔可夫模型表示。
ProNIT公司 蛋白质与核酸相互作用的热力学数据库
蛋白质体 蛋白质和其他分子的协作3D百科全书
ProTherm公司 蛋白质和突变体的热力学数据库
SASBDB公司 小角度散射数据和模型的指定存储库。
UniProtKB 一种全面、高质量、可自由获取的蛋白质序列和功能信息资源。
XRDa公司 与PDB条目对应的原始X射线衍射图像的Xtal原始数据档案
用于虚拟筛选的商用化合物的免费数据库。


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上次更新时间:2024年2月28日