总结
组织
大脑
单细胞
组织细胞
病理学
疾病
免疫
血液
子单元格
细胞系
结构
相互作用
使用来自HGNC公司和合奏以及人类蛋白质图谱项目的预测。
官方基因符号,通常是基因名称的缩写,根据HGNC公司.
完整基因名称依据HGNC公司.
为编码蛋白指定HPA蛋白类别。
基于信号肽和跨膜区预测方法,对所有基因的所有转录物进行了相应蛋白质的位置分析。
注释的位置否决了预测的位置,因此编码已注释为细胞内的预测分泌蛋白的基因将以细胞内为最终位置。
基因信息来自合奏和Entrez公司,以及到可用基因标识符的链接显示在这里。如果没有其他说明,则从Ensembl检索信息。
来自基因的蛋白质编码转录物的数量,定义如下合奏。
结构部分提供了来自Alphafold蛋白质结构数据库的预测结构,包括与uniprot条目对应的结构映射到我们的基因集,其中至少有一个剪接变异体与结构序列具有100%的同源性。
单个剪接变异体可以在蛋白质浏览器的顶部选择(见下文),与整个结构匹配的转录本和仅与全长AlphaFold结构部分对应的转录本均显示出来。通过点击蛋白质浏览器中的相应特征,可以在结构中显示不同的转录物相关特征,如跨膜区、InterPro结构域和抗体的抗原序列,然后与所选转录物相对应的结构部分也将以浅蓝色显示。通过使用结构右侧的滑块,可以突出显示临床和人群氨基酸变体,也可以通过残基指数对整个结构着色或使结构自动旋转。使用NGL查看器也可以手动放大和旋转。
蛋白质浏览器显示目标蛋白质上的抗原位置和目标蛋白质的特征。蛋白质视图部分顶部的选项卡可用于在抗原映射到的不同剪接变体之间切换。
在视图顶部,抗原的位置(由相应的HPA标识符标识)显示为绿色条。条形图上的黄色三角形表示与蛋白质目标的序列一致性<100%。
在抗原下方,使用10 aa残基(HsID 10)或50 aa残基可滑动窗口显示该蛋白质与其他人类基因中所有其他蛋白质的最大序列一致性百分比。抗原设计总是选择具有最低识别度的区域,设计单一目标抗原时允许的最大识别度为60%(阅读更多信息).
蓝色曲线显示了预测的抗原性,即蛋白质不同区域产生免疫反应的趋势,预测峰值区域抗原性更强。该曲线显示了基于滑动窗口方法的平均值,使用内部倾向量表。(阅读更多信息).
如果大多数信号肽预测因子预测信号肽SPOCTOPUS公司,信号P 4.0、和菲比乌斯(绿松石色)和/或跨膜区(橙色)预测如下MDM公司,将显示这些。
描述:Alphafold项目第2版P02649的结构预测
蛋白质信息部分显示该基因根据合奏数据库。
ENSP标识符链接到Ensembl网站蛋白质摘要,而ENST标识符链接到所选剪接变体的Ensemble网站转录摘要。中的数据UniProt公司该列可以展开以显示该蛋白质的所有匹配UniProt标识符的链接。
这个蛋白质类别如果在蛋白质类列中展开数据,则显示分配给该蛋白质的值。父蛋白质类以粗体显示,子类列在父类下。