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.2008年12月15日;24(24):2928-9.
doi:10.1093/bioinformatics/btn550。 Epub 2008年10月22日。

SPOCTOPUS:信号肽和膜蛋白拓扑的联合预测

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比较研究

SPOCTOPUS:信号肽和膜蛋白拓扑的联合预测

哈坎·维克隆德等。 生物信息学. .

摘要

总结:SPOCTOPUS是一种结合预测信号肽和膜蛋白拓扑结构的方法,适用于基因组规模的研究。它的目标是最小化跨膜区域作为信号肽的错误预测,反之亦然。我们对SPOCTOPUS算法进行了描述,并进行了性能评估,其中SPOCTOBUS在信号肽和拓扑预测方面优于最先进的方法。

可利用性:SPOCTOPUS可以作为web服务器使用,源代码和基准数据都可以在http://octopus.cbr美国/

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