leeBam视图

leeBamViews——多个酵母RNAseq样本摘自Lee 2009


生物导体版本:释放(3.19)

来自PMID 19096707的数据;管理多个NGS样本的原型

作者:VJ Carey在channing.harvard.edu>

维护人员:VJ Carey在channing.harvard.edu>

引文(从R中输入引文(“leeBamViews”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“leeBamViews”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“leeBamViews”)
使用bamViews管理多个NGS示例 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式

细节

生物视图 实验数据,RNASeq数据,SNP数据,酿酒酵母_酿酒_数据,排序数据
版本 1.40.0
许可证 艺术2.0
取决于 R(>=2.15.0),博科生物,Rsamtools软件(>= 0.1.50),牛基因组
进口 基因组范围,基因组比对、方法、,S4载体,平行,I范围
系统要求
统一资源定位地址
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 leeBamViews_1.40.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/leeBamViews网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/leeBamViews
包短Url https://bioconductor.org/packages/leeBamViews网站/
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