vsn公司
微阵列数据的方差稳定和校准
生物导体版本:释放(3.19)
该软件包实现了一种从单色和多色阵列归一化微阵列强度的方法。它也可以用于来自其他技术的数据,只要它们具有类似的格式。该方法将最大似然估计量的稳健变量用于加性乘法误差模型和仿射校准。该模型包括数据校准步骤(也称为归一化)、方差对平均强度的依赖性模型和方差稳定的数据转换。转换强度之间的差异类似于“归一化对数比”。然而,与后者相比,它们的方差与平均值无关,并且它们在检测差异转录方面通常更敏感和特异。
作者:沃尔夫冈·胡贝尔(Wolfgang Huber),安贾·冯·海德布雷克(Anja von Heydebreck)供稿。用户的许多意见和建议都得到了认可,其中包括丹尼斯·科斯特卡、大卫·克莱尔、汉斯·乌里奇·克莱恩、罗伯特·绅士、迪帕扬·萨卡尔和戈登·斯迈思
维护人员:沃尔夫冈·胡贝尔(Wolfgang Huber)<Wolfgang.Huber at embl.org>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“vsn”)
对于旧版本的R,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“vsn”)
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