此网站上的搜索功能当前不可用。
使用谷歌搜索类型网址:bioconductor.org“搜索词”在浏览器中。

pvca公司

主方差分量分析(PVCA)


生物导体版本:释放(3.18)

此软件包包含评估批处理源的功能,方法是将所有“源”拟合为随机效应,包括混合模型(取决于lme4软件包)中的双向交互项,以选择从原始数据相关矩阵中获得的主成分。该软件包与《微阵列实验中的批处理效果和噪声》一书一起提供,第12章。

作者:皮埃尔·布谢尔(Pierre Bushel)

维护人员:李建英<li11 at niehs.nih.gov>

引文(从R中输入引文(“pvca”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.软件包(“BiocManager”)BiocManager::安装(“pvca”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“pvca”)
微阵列数据中的批效应估计 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式

细节

生物视图 BatchEffect(批次效果)微阵列软件
版本 1.42.0
在生物导体中 生物技术2.12(R-3.0)(11年)
许可证 LGPL(>=2.0)
取决于 R(>=2.15.1)
进口 矩阵,博科生物vsn(vsn),统计,lme4
系统要求
统一资源定位地址
查看更多
建议 golubE集
链接到
增强
取决于我
导入我 表达式规范化工作流
建议我
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 pvca_1.42.0.tar.gz
Windows二进制 pvca_1.42.0.zip
macOS二进制(x86_64) pvca_1.42.0.tgz
macOS二进制(arm64) pvca_1.42.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pvca
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/pvca
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/pvca/
包短Url https://bioconductor.org/packages/pvca/
软件包下载报告 下载统计信息