tidyCoverage公司
提取并汇总感兴趣特征的基因组覆盖率
生物导体版本：释放（3.19）
`tidyCoverage框架使用“tidySummarizedExperiment”方法对基因组轨迹和特征的集合进行了整洁的操作。它借助于“CoverageExperience”和“AggregatedCoverage”类，有助于提取、聚集和可视化单个或数千个基因组位点的基因组覆盖率。这加快了基因组跟踪数据在基因组分析工作流中的集成。
作者：雅克·塞里扎伊[aut，cre]
维护人员：雅克·塞里扎伊
引文（从R中输入引文（“tidyCoverage”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“tidyCoverage”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“tidyCoverage”）
细节
| 生物视图 |
新闻报道,排序,软件 |
| 版本 |
1.0.0 |
| 在生物导体中 |
生物C 3.19（R-4.4）（<6个月） |
| 许可证 |
MIT+文件许可证 |
| 取决于 |
R（>=4.3.0），总结性实验 |
| 进口 |
S4载体,I范围,基因组范围,基因组信息Db,生物并行,生物IO,rtracklayer公司、方法、，第三年,数字播放器,范西,支柱,爱尔兰航空公司,克莱,呜呜声,压控变压器，统计信息 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/js2264/tidy报道 |
| 错误报告 |
https://github.com/js2264/tidyCoverage/issues网站 |
查看更多
| 建议 |
tidy总结实验,plyranges系列,ggplot2,TxDb（发送日期）。哈皮恩斯。UCSC.hg19.known基因,批注中心,基因组特征,生物风格,色调,针织物,rmarkdown公司,sessioninfo（会话信息）,测试那个(>= 3.0.0) |
| 链接到 |
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| 增强功能 |
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| 取决于我 |
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| 导入我 |
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| 建议我 |
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| 指向我的链接 |
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| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
