tRNAscanImport(tRNAscan导入)

将tRNAscan-SE结果文件作为GRanges对象导入


生物导体版本:释放(3.19)

该包将tRNAscan-SE的结果作为GRanges对象导入。

作者:费利克斯·G·M·恩斯特[aut,cre]

维护人员:Felix G.M.Ernst<Felix.gm.Ernst at outlook.com>

引文(从R中输入引文(“tRNAscanImport”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“tRNAscanImport”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“tRNAscanImport”)
tRNAscanImport(tRNAscan导入) HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 数据导入,预处理,软件,可视化,工作流步骤
版本 1.24.0
在生物导体中 生物技术3.7(R-3.5)(6.5年)
许可证 GPL-3+文件许可证
取决于 R(>=3.5),基因组范围,tRNA
进口 方法,字符串,生物遗传学,生物串,结构字符串,S4载体,I范围,十六矢量,基因组信息Db,rtracklayer公司,牛基因组,Rsamtools软件
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/FelixErnst/tRNAscanImport网站
Bug报告 https://github.com/FelixErnst/tRNAscanImport/issues网站
查看更多
建议 仿生风格,针织物,rmarkdown公司,测试那个,ggplot2,英国基因组。Scerevisiae公司。UCSC.sacCer3
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取决于我
导入我
建议我 构造字符串,tRNA
指向我的链接
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 tRNAscan导入_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 tRNAscanImport_1.24.0.zip码
macOS二进制(x86_64) tRNAscan导入_1.24.0.tgz
macOS二进制(arm64) tRNAscan导入_1.24.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tRNAscanImport网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/tRNAscanI导入
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/tRNAscanImport网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/tRNAscanI导入/
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