卫星

批量和单细胞RNA测序应用中差异转录本使用的可缩放分析

生物导体版本：释放（3.19）

satuRn为执行差异转录使用分析提供了一个高性能和可扩展的框架。该包包含三个主要功能。第一个函数fitDTU适用于模拟不同兴趣组中转录物使用情况的准肿瘤广义线性模型。第二个函数testDTU测试感兴趣的组之间的转录本的差异使用。最后，plotDTU将感兴趣的成绩单的使用情况可视化。

作者：杰伦·吉利斯【aut，cre】，克里斯托弗·维廷·塞鲁普【ctb】，科恩·范登贝尔热【ctb），列文·克莱门特【ctb

维护人员：杰伦·吉利斯（Jeroen Gilis）

引文（从R中输入引文（“satuRn”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“satuRn”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“satuRn”）

生物视图	差异表达式,实验设计,基因表达式,多重比较,RNA序列,回归,排序,单个单元格,软件,转录组学,可视化
版本	1.12.0
在生物导体中	生物化学3.13（R-4.1）（3年）
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=4.1）
进口	位置传感器,总结性实验,生物并行,利马,pbapply（应用程序）,ggplot2,靴子,矩阵、统计、方法、图形
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/statOmics/satuRn
错误报告	https://github.com/statOmics/satuRn/issues网站

建议	针织物,rmarkdown公司,测试那个,覆盖（covr）,仿生风格,批注中心,集成数据库,边缘R,DEXSeq公司,阶段E,延迟阵列
链接到
增强功能
取决于我	IsoformSwitch分析仪
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	状态Rn_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	satuRn_1.12.0.zip文件（仅64位）
macOS二进制（x86_64）	状态Rn_1.12.0.tgz
macOS二进制（arm64）	状态Rn_1.12.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/satuRn
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/状态
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/satuRn/
包短Url	https://bioductor.org/packages/satuRn/
软件包下载报告	下载统计信息