pwalling(pwallign)
执行两两序列比对
生物导体版本:释放(3.19)
包中的两个主要函数是pairwiseAlignment()和stringDist()。前者解决了(Needleman-Wunsch)全局对齐、(Smith-Waterman)局部对齐和(无端点)重叠对齐问题。后者计算一组字符串的Levenshtein编辑距离或成对对齐分数矩阵。
作者:Patrick Aboyoun[aut]、Robert Gentleman[aut]、HervéPagès[cre]
维护人员:HervéPagès<hpages.on.github at gmail.com>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“pwalign”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览渐晕图(“pwalign”)
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